NMRによる原子レベルでの分子間相互作用スクリーニング法の開発
NMRによる原子レベルでの分子間相互作用スクリーニング法の開発
批准号:
14657569
负责人:
寺沢 宏明
金额:
$1.98万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2004
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英文摘要
脂質分子の生合成および細胞内輸送は、生体膜の形成と細胞機能の維持に不可欠である。リガンド脂質を輸送するタンパク質が、脂質二重膜と相互作用し機能する様子を解析する方法の開発は重要である。近年、小胞体からゴルジ体へのセラミド分子の輸送を直接担う分子であるCERTが同定された。CERTはN末端にphosphatidyl-4-monophosphate (PtdIns4P)を認識するPHドメインを、C末端にceramideを認識するSTARTドメインをそれぞれ有する分子量約70kDaの細胞質タンパク質である。PHドメインが、ゴルジ膜上のPtdIns4Pを認識することにより、小胞体-ゴルジ間特異的ceramide輸送経路を獲得しているものと考えられる。NMRによる構造生物学的解析を行うため、^<15>N標識したPHドメインを調製して^1H-^<15>N HSQCスペクトルの測定を行い、アミノ酸残基数(117残基)と同数のピークを検出できるNMR測定条件を確立することに成功した。次に、PHドメイン上におけるリガンドとの相互作用に関与するアミノ酸残基を明らかにするため、PtdIns4Pを組み込んだリポソームをリガンドとしてNMR滴定実験を行った。その結果、PtdIns4P認識ドメインはPtdIns4Pのリン酸基部分近傍および脂質膜分子表面を認識している可能性が示唆された。PHドメインにおけるPtdIns4P含有リポソーム結合界面を同定するため、当研究室で開発された転移交差飽和法を適用した。その結果、PHドメインは、PtdIns4Pの頭部だけでなく、脂質膜をループ領域で認識することがわかった。本研究は、細胞膜における生体分子の相互作用を観測する手法を提示するものであり、脂質認識タンパク質のみならず、細胞膜において機能する分子の研究に広く適用可能である。
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^1H,^<13>C,^<15>N backbone resonance assignments of the hyaluronan-binding domain of CD44.
CD44的乙酰透明质酸结合结构域的^ 1 H、^ 13 C、^ 15 N主链共振分配。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
J.Biomol.NMR 29
影响因子:
--
作者:
[Gotoh, B., Nishitsuji H. et al., Takeda Mitsuhiro et al.]
通讯作者:
Takeda Mitsuhiro et al.
Noritaka Nishida: "Backbone ^1H, ^<13>C, ^<15>N, resonance assignments of the von Willebrand factor A3 domain"J.Biomol.NMR. 24. 357-358 (2002)
Noritaka Nishida:“骨干^ 1H、^ 13 C、^ 15 N,von Willebrand因子A3结构域的共振分配”J.Biomol.NMR。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Takeda Mitsuhiro et al.: "Hyaluronan recognition mode of CD44 revealed by cross-saturation and chemical shift perturbation experiments."J.Biol.Chem.. 278. 43550-43555 (2003)
Takeda Mitsuhiro 等人:“通过交叉饱和和化学位移微扰实验揭示了 CD44 的透明质酸识别模式。”J.Biol.Chem.. 278. 43550-43555 (2003)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
NMR Study of Repair Mechanism of DNA Photolyase by FAD-Induced Paramagnetic Relaxation Enhancement
FAD诱导顺磁弛豫增强DNA光解酶修复机制的NMR研究
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
J.Biol.Chem. 279
影响因子:
--
作者:
[Sakai, T., Tochio, H., Inomata, K., Sasaki, Y., Tenno, T., Tanaka, T., Kokubo, T., Hiroaki, H., Shirakawa, M., Takumi Ueda]
通讯作者:
Takumi Ueda
Tamiji Nakanishi: "Determination of the Interface of a Large Protein Complex by Transferred Cross-saturation Measurements"J.Mol.Biol.. 318. 245-249 (2002)
Tamiji Nakanishi:“通过转移交叉饱和度测量确定大蛋白复合物的界面”J.Mol.Biol.. 318. 245-249 (2002)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 8 条
機能性システインの化学修飾に基づく新規作用機序の炎症制御化合物の開発
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批准号:23K27315
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.82万
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财政年份:2024
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
機能性システインの化学修飾に基づく新規作用機序の炎症制御化合物の開発
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批准号:23H02624
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
DfMRIに基づく匂い応答の脳活性化パターン解析:嗅覚障害の改善に向けて
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批准号:22K19938
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2022
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
マウスフェロモンファミリーとG蛋白質共役受容体の相互作用ネットワークに関する研究
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批准号:19036022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2007
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
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批准号:18011001
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.62万
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财政年份:2006
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
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批准号:17012006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.7万
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财政年份:2005
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
CD44の糖鎖認識とシグナル伝達制御に関する構造生物学的研究
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批准号:17046003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2005
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
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批准号:16017223
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$6.91万
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财政年份:2004
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
NMRによるCD44‐プロテオグリカン複合体の相互作用解析
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批准号:15040205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2003
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
リン脂質を認識するタンパク質の脂質二重膜における配向に関する構造生物学的研究
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批准号:15013218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.94万
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财政年份:2003
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
PCモチーフを含むタンパク質の特異的認識の解析
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批准号:12034221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2000
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
構造生物学に基づく食細胞NADPH酸化酵素系のSH3を中心とする制御機構の解明
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批准号:10780375
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1998
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
海外基金