リン脂質を認識するタンパク質の脂質二重膜における配向に関する構造生物学的研究

识别脂质双层膜中磷脂的蛋白质取向的结构生物学研究

• 批准号: 15013218
• 负责人: 寺沢 宏明
• 金额: $ 2.94万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15013218/
• 关键词: 交差飽和法; 転移交差飽和法; NMR; 相互作用解析; PXドメイン; リポソーム; リン脂質; NADPHオキシダーゼ

本研究は、リガンド脂質を認識し脂質二重膜に直接相互作用するタンパク質が、本来の姿で相互作用し機能する様子を正確に決定する方法の開発を目的とする。当研究室の開発した、NMRを用いた転移交差飽和法によるタンパク質複合体相互作用界面決定法は、不均一な巨大分子との相互作用解析を可能とした。転移交差飽和法を、NADPHオキシダーゼに存在するp47PXドメインと、そのリガンドであるホスファチジルイノシトール(3,4)2リン酸(以下PI(3,4)P2と表記する)を含むリポソームとの相互作用解析に適用して検討を進めている。まず、p47 PXドメインの発現・精製系を確立して安定同位体標識タンパク質を取得し、三重共鳴NMRの測定とアミノ酸選択的標識による主鎖連鎖帰属を終了した。次に、p47 PXドメインにおけるPI(3,4)P2含有リポソームとの相互作用部位を転移交差飽和法に基づいて同定した。明らかになった相互作用部位は、変異体と表面プラズモン法のみを用いたWilliams RLらのグループの結果とは全く異なった部位であった。さらに、Williamsらはホスファチジン酸結合部位を示しているが、我々の結果では、ホスファチジン酸の結合はPI(3,4)P2に比較して非常に弱く、PI(3,4)P2存在下ではp47 PXドメインとは相互作用しない。また、他のPXドメインにおいて、detergentを用いた結合実験によって示されたmembmne insertion loopは、p47 PXドメインにおいてはリポソームとの相互作用が観測されなかった。データ精度の向上と変異体を用いた検討をさらに進めている。

In this study, we studied the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane, the direct interaction of the lipid double membrane and the direct interaction of the lipid double membrane. When the laboratory is in operation, NMR uses the differential transfer method and the method to determine the interface of the complex interaction, and the analysis of the interaction between heterogeneous macromolecules may be difficult. The transfer of the difference and the method, the NADPH, the p47PX and the interaction are detected in this paper. The analysis of the interaction is based on the analysis of the interaction between the two groups. The key to determine the accuracy of the target is to make sure that the identity of the stable homology is obtained, and the triple NMR is used to determine that the primary link is not valid. The secondary and p47 PX genes were identified as PI (3pc4) P2, which contained the transfer difference of the interaction site and the homology of the DNA base. The results showed that the interaction site and the surface of the body were not affected by the interaction site and the surface of the body. The results of the Williams RL test were used. The binding sites of PI and Williams show that the interaction between P47 and PX is very weak in the presence of P2, which is very weak in the presence of P2. The PX, the other and the detergent display the membmne insertion loop, the p47 PX and the interaction between each other. In order to improve the accuracy, you can improve the accuracy of the system.

项目成果

Takeda Mitsuhiro et al.: "Hyaluronan recognition mode of CD44 revealed by cross-saturation and chemical shift perturbation experiments."J.Biol.Chem.. 278. 43550-43555 (2003)

Takeda Mitsuhiro 等人：“通过交叉饱和和化学位移微扰实验揭示了 CD44 的透明质酸识别模式。”J.Biol.Chem.. 278. 43550-43555 (2003)

Takahasi Kiyohiro et al.: "X-ray crystal structure of IRF-3 and its functional implications."Nature Struct.Biol.. 10. 922-927 (2003)

Takahasi Kiyohiro 等人：“IRF-3 的 X 射线晶体结构及其功能意义。”Nature Struct.Biol.. 10. 922-927 (2003)

Takeda Mitsuhiro et al.: "^1H,^<13>C,^<15>N backbone resonance assignments of the hyaluronan-binding domain of CD44."J.Biomol.NMR. (in press). (2003)

Takeda Mitsuhiro等人：“CD44的乙酰透明质酸结合结构域的^ 1 H，^ 13 C，^ 15 N主链共振分配”。J.Biomol.NMR。