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ヘリコバクターピロリcag pathogenicity islandの機能解析

幽门螺杆菌cag致病岛的功能分析

基本信息

批准号：
17019023
负责人：
東健
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019023/
关键词：
Helicobacter pylori pathogenicity island cagA vacA 慢性胃炎胃癌

项目摘要

1)H.pyloriの疾患特異的病原遺伝子の解析a)cagPAI遺伝子多型と病態との関連:これまでに我々は日本の胃癌株F32と十二指腸潰瘍株OK107において約40kbのcagPAIの全塩基配列を決定し、既報のイギリスの胃炎由来の26695株及びアメリカの十二指腸潰瘍由来のJ99株と比較したところ、4つの株間のcagPAIの塩基配列は約92%の一致率を示した。cagPAI内の各遺伝子の塩基配列は株間で保たれていたが(一致率約95%)、28個のcagPAI遺伝子の中で、cagAとvirB10において繰り返し配列を認め、それぞれの株間で大きく異なっていた(一致率約85%)。また、cagPAIの全塩基配列を、慢性胃炎株、胃癌由来株、十二指腸潰瘍由来株について計11株、既報の塩基配列を元にPCR-direct sequencingにより決定し、系統樹解析を行ったところ、大きく欧米型と日本型とに分けられた。また、日本型の株での感染において、慢性胃炎の萎縮度が強いことが認められた。b)cagPAI遺伝子の国際的地域差と病態との関連:我々はこれまで、H.pylori株のゲノム解析を無作為に選んだ8個の構造遺伝子について塩基配列を検討したところ、世界の地域による差及び病態による差は認められなかった。一方、病原因子であるcagAや細胞空胞化毒素遺伝子vacAは、世界の地域により大きく異なり、特に、慢性萎縮性胃炎と胃癌の発症が高い、日本、韓国、中国と欧米との違いが認められ、塩基配列による樹系図では、欧米と東アジアとは異なったbranchに位置し、H.pyloriの起源が異なると考えられた。したがって、病原遺伝子に変異が多いと考えられた。また、cagPAI内遺伝子の変異とcagPAI外の遺伝子vacAの変異との関係を検討したところ、cagPAI内のcagAとcagEの樹系図の相関よりも、cagAとcagPAI外のvacAの相関が強く、東アジア型のcagAのゲノタイプでslc/ml型のvacAのゲノタイプが相関していた。したがって、遺伝子変異においても、病原因子の遺伝子の変異は何らかの環境や病態に対する適応が関与すると考えられた。

1) Analysis of the pathogen of H.pylori 's disease: a) cagPAI polymorphisms: Japanese gastric cancer strain F32, 12-finger gastric cancer, OK107, 40kb, cagPAI, gastritis, etiology, etiology and origin of gastritis. The consistency rate of about 92% of the cagPAI base alignment among the four plants showed significant difference. In cagPAI, each sub-base of each cluster was assigned to protect each other (the consistency rate was about 95%), 28 cagPAI strains, cagA virus B10 vaccine samples were allocated back to each other, and the same rate was about 85%. There were 11 strains of gastric cancer, 11 strains of chronic gastritis, 11 strains of gastric cancer, 11 strains of cagPAI, 11 strains of gastric cancer, 11 strains of gastric cancer, 11 strains The strains of Japanese type and Japanese type were infected with chronic gastritis, and the atrophy of chronic gastritis was strong. B) the regional difference of the cagPAI database in the international market: we analyze the data of the H.pylori database, and the database of the 8 global economic clusters is equipped with the remote sensing system, the regional database of the world and the sick database of the world. On the one hand, the pathogenic factor, cagA, cystocytotoxin, vacA, world region, chronic atrophic gastritis, chronic atrophic gastritis, chronic atrophic gastritis, The pathogen and the pathogen of the disease were found to be complicated by multiple tests. In the cagPAI, in the vacA, in the cagPAI, in the cagE, in the vacA, in the cagPAI, in the cagA, in the cagPAI, in the cagA, in the cagPAI, and in the vacA. The pathogens, the environmental diseases, the pathogens, the pathogens, the