細胞膜を介した金属の恒常性維持に関与する蛋白質の構造生物学

参与维持跨细胞膜金属稳态的蛋白质的结构生物学

基本信息

  • 批准号:
    19036024
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.03万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2007 至 2008
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ヒト・ミトコンドリア内膜のABC輸送体ABCB6は, 膜貫通ドメインとABCドメインからなり, 鉄の恒常性を保つことで, 鉄の蓄積による酸化的損傷を抑えつつ, 酸化的リン酸化などのミトコンドリア機能の維持に寄与すると考えられている. 一方で大腸菌NikA(56kDa)は, ペリプラズム結合蛋白質(PBP)の一員であり, Ni輸送や走化性に寄与している.ABCB6のC末端ABCドメイン(ABCB6-C)については, ホモロジーモデリングで得た構造の検証と精密化を行った.大腸菌NikAについては, 走化性受容体Tar細胞質領域との相互作用の解析を試みた, TarはNiに対する負の走化性に関与している. この試料についてNMR測定条件の最適化を行い, Tar側の主鎖NMRシグナルの帰属を試みた. また, 2^H/<15>^N標識NikAとTarのタイトレーション実験や交差飽和実験などを行うことによって, NikAと走化性受容体の相互作用のメカニズムの解析を進めた.また, 本研究で取り上げた試料のうち, ABCB6-Cは溶解度が低く, NMR測定温度での安定性が低いという問題があり, NikA/OppAは高分子量試料であるが故に高感度・高分解能の測定が要求された. これらの問題を克服し, 高感度でかつ迅速に3重共鳴NMR測定を行うために, 間接観測軸に非線形サンプリングを採用し, 最大エントロピー法を用いたデータ処理を行う方法の開発研究も並行して行った, この方法論的研究は, 上記ABCB6-C, NikA/OppA試料のみならず, 生細胞内の蛋白質動態を解析するためのin-cell NMR研究にも適用され, 様々な成果を得ることに成功している.
This is due to the fact that the intima is sensitive to ABC, the membrane is sensitive to ABC, the membrane is sensitive, constant, constant, acidified, acidified and acidified. One of the pathogens, NikA (56kDa), combined with protein (PBP), and Ni was sent to the host. ABCB6 C-terminal ABC transmission (ABCB6-C) transmission was successful, and the precision test was successfully established. NikA aspergillus sp., Tar capacitor cell domain interaction assay test, Tar Ni domain interaction assay, mobility assay and histopathology analysis. This is the best way to determine the NMR test conditions, and the Tar operator is responsible for the NMR test. The, 2 ^ H

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
High-resolution multi-dimensional NMR spectroscopy of proteins in human cells
  • DOI:
    10.1038/nature07839
  • 发表时间:
    2009-03-05
  • 期刊:
  • 影响因子:
    64.8
  • 作者:
    Inomata, Kohsuke;Ohno, Ayako;Shirakawa, Masahiro
  • 通讯作者:
    Shirakawa, Masahiro
非線形サンプリング法を用いた迅速な異種核多次元NMR測定法の開発と応用
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tohru Terada;(他4名);伊藤 隆
  • 通讯作者:
    伊藤 隆
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S. Morita;Y. Deharu;E. Takata;M. Nakano;T. Handa;中野実;伊藤隆;中野実;伊藤隆;中野実;伊藤隆
  • 通讯作者:
    伊藤隆
Application of nonlinear sampling and maximum entropy reconstruction to problematic protein samples
非线性采样和最大熵重建在有问题的蛋白质样品中的应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ichihara;H.・Kuma;K.・Urade;Y.・Toh;H;伊藤 隆
  • 通讯作者:
    伊藤 隆
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