細胞膜を介した金属の恒常性維持に関与する蛋白質の構造生物学
細胞膜を介した金属の恒常性維持に関与する蛋白質の構造生物学
批准号:
19036024
负责人:
伊藤 隆
金额:
$4.03万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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ヒト・ミトコンドリア内膜のABC輸送体ABCB6は, 膜貫通ドメインとABCドメインからなり, 鉄の恒常性を保つことで, 鉄の蓄積による酸化的損傷を抑えつつ, 酸化的リン酸化などのミトコンドリア機能の維持に寄与すると考えられている. 一方で大腸菌NikA(56kDa)は, ペリプラズム結合蛋白質(PBP)の一員であり, Ni輸送や走化性に寄与している.ABCB6のC末端ABCドメイン(ABCB6-C)については, ホモロジーモデリングで得た構造の検証と精密化を行った.大腸菌NikAについては, 走化性受容体Tar細胞質領域との相互作用の解析を試みた, TarはNiに対する負の走化性に関与している. この試料についてNMR測定条件の最適化を行い, Tar側の主鎖NMRシグナルの帰属を試みた. また, 2^H/<15>^N標識NikAとTarのタイトレーション実験や交差飽和実験などを行うことによって, NikAと走化性受容体の相互作用のメカニズムの解析を進めた.また, 本研究で取り上げた試料のうち, ABCB6-Cは溶解度が低く, NMR測定温度での安定性が低いという問題があり, NikA/OppAは高分子量試料であるが故に高感度・高分解能の測定が要求された. これらの問題を克服し, 高感度でかつ迅速に3重共鳴NMR測定を行うために, 間接観測軸に非線形サンプリングを採用し, 最大エントロピー法を用いたデータ処理を行う方法の開発研究も並行して行った, この方法論的研究は, 上記ABCB6-C, NikA/OppA試料のみならず, 生細胞内の蛋白質動態を解析するためのin-cell NMR研究にも適用され, 様々な成果を得ることに成功している.
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DOI:
10.1038/nature07839
发表时间:
2009-03-05
期刊:
NATURE
影响因子:
64.8
作者:
[Inomata, Kohsuke, Ohno, Ayako, Shirakawa, Masahiro]
通讯作者:
Shirakawa, Masahiro
非線形サンプリング法を用いた迅速な異種核多次元NMR測定法の開発と応用
非线性采样法快速异构多维核磁共振测量方法的开发与应用
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tohru Terada, (他4名), 伊藤 隆]
通讯作者:
伊藤 隆
Understanding the roles of amino acid residues in tertiary structure formation of chignolin by using molecular dynamics simulation
利用分子动力学模拟了解氨基酸残基在chignolin三级结构形成中的作用
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
PROTEINS:Structure, Function, and Bioinformatics
影响因子:
--
作者:
[KURODA, M, HASHIGUCHI, H, NAKAGAWA, N., 中川重和(執筆分担), Tohru Terada]
通讯作者:
Tohru Terada
In-cell NMRによる細胞内蛋白質の立体構造解析
通过细胞内核磁共振对细胞内蛋白质进行三维结构分析
DOI:
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发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Morita, Y. Deharu, E. Takata, M. Nakano, T. Handa, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆]
通讯作者:
伊藤隆
Application of nonlinear sampling and maximum entropy reconstruction to problematic protein samples
非线性采样和最大熵重建在有问题的蛋白质样品中的应用
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ichihara, H.・Kuma, K.・Urade, Y.・Toh, H, 伊藤 隆]
通讯作者:
伊藤 隆
共 8 条
金属の溶解析出反応を制御する有機物添加剤の超高感度ラマン分光学解析
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批准号:23K23441
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2024
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
In situ SERS spectroscopy for organic additives with controlling metal deposition
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批准号:22H02173
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.32万
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财政年份:2022
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
In-situ structural biology by NMR spectroscopy
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批准号:21H02419
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.23万
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财政年份:2021
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発
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批准号:22510237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.33万
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财政年份:2010
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
In-cell NMRによる真核細胞内蛋白質の立体構造解析法の開発
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批准号:21200044
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
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资助金额:$19.39万
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财政年份:2009
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
In-Cell NMRを用いた生細胞内蛋白質の物性・動態解析法の開発
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批准号:20050024
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2008
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
ミトコンドリア膜を介した鉄の恒常性維特に関与するABC輸送体の構造・機能解析
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批准号:17048033
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2005
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
好アルカリ性好塩性古細菌の系統分類学的研究
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批准号:04F04852
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2004
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
ミトコンドリア膜を介した鉄の恒常性維持に関与するABC輸送体の構造生物学
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批准号:16048230
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
ln-Cell NMR:細胞内蛋白質間相互作用の直接解析法の開発
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批准号:15657031
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2003
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
電気化学In Situラマン分光法のアゾ化合物を修飾した炭素電極への展開
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批准号:14750651
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2002
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
DNA組換え制御機構の構造生物学的解析
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批准号:13740432
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2001
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
高分子量蛋白質複合体の溶液構造決定法の開発
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批准号:13014221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2001
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
プロチウム材料溶液界面のマイクロACインピーダンス解析と電極過程のモデル化
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批准号:12022208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2000
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
電気化学InSituラマン分光法の高温溶融炭酸塩系への展開
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批准号:12750724
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2000
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
オーラル・メソッドによる政策の基礎研究
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批准号:12CE2002
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项目类别:Grant-in-Aid for COE Research
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资助金额:$523.85万
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财政年份:2000
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
エアロスパイクノズルの性能評価と流れ場の数値解析
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批准号:00J07301
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2000
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
形質転換植物体の異常リグニンに関する化学的研究
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批准号:99J03808
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1999
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
ラマン分光による光インサーション材料の界面構造解析
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批准号:11118213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1999
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
DNA組換え・修復系メカニズムの構造生物学的解析
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批准号:11740419
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:伊藤 隆
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依托单位:
海外基金