课题基金 / 基金详情

解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発

解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発
开发难以分析的蛋白质的高精度三维结构测定方法
批准号：
22510237
负责人：
伊藤 隆
金额：
$2.33万
依托单位：
Tokyo Metropolitan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2012
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22510237/
关键词：
NMRプロテオミクス立体構造最大エントロピー法非線形サンプリング蛋白質自動立体構造計算異種核次元NMR

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项目成果

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本研究は,構造プロテオミクス研究をさらに前進させるための新しい技術基盤の創生を目指し,解析が非常に困難な生体高分子試料(実験条件下で不安定,溶解度が低い等)に対して,構造・機能解析を行う手段として,実験科学と情報・計算科学を融合した新しい総合的なアプローチを模索するものであるH22年度は,本研究の2つの研究手テーマのうち「迅速で高感度な異種核多次元NMR測定法」として,非線形サンプリング法を利用し,従来法の10%以下の測定時間で同程度の感度・分解能と,正確なクロスピークの相対強度を持つスペクトルを得る方法の検討を行った.その結果,半日～1日程度の測定時間で従来法に比して充分な感度と分解能の4D NMR測定が可能であること,またNOESYスペクトルのようにある程度の強度の正確性が要求される測定にも適用可能であることが示された.また,従来のMaxEntを用いたデータ処理法の改良版であるquantitative MaxEnt (QMEM), multidimensional deconvolution (MDD)を用いた精度の高い多次元NMRスペクトルの再構成ソフトウェアの検討も行ったまた,「限られた構造情報からの効率的な立体構造解析法」として,NOESYスペクトルのみから完全に自動で立体構造解析を行うシステムの構築に成功した.このように客観的で再現性の高い解析法は,様々なより難しい試料において非常に有用であると考えられる
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Cellular structural biology
DOI： 10.1016/j.sbi.2010.07.006
发表时间： 2010-10-01
期刊： CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子： 6.8
作者： [Ito, Yutaka, Selenko, Philipp]
通讯作者： Selenko, Philipp
Structure and dynamics of proteins at work inside cells
细胞内工作蛋白质的结构和动力学
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [伊藤隆]
通讯作者： 伊藤隆
Exclusively NOESY-based automated NMR assignment and structure determination of proteins
DOI： 10.1007/s10858-011-9502-8
发表时间： 2011-06-01
期刊： JOURNAL OF BIOMOLECULAR NMR
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作者： [Ikeya, Teppei, Jee, Jun-Goo, Guentert, Peter]
通讯作者： Guentert, Peter
NMR protein structure determination in living E. coli cells using nonlinear sampling
DOI： 10.1038/nprot.2010.69
发表时间： 2010-01-01
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作者： [Ikeya, Teppei, Sasaki, Atsuko, Ito, Yutaka]
通讯作者： Ito, Yutaka
金属の溶解析出反応を制御する有機物添加剤の超高感度ラマン分光学解析
  • 批准号：
    23K23441
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $2.66万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tohoku University
In situ SERS spectroscopy for organic additives with controlling metal deposition
  • 批准号：
    22H02173
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.32万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tohoku University
In-situ structural biology by NMR spectroscopy
  • 批准号：
    21H02419
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.23万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tokyo Metropolitan University
In-cell NMRによる真核細胞内蛋白質の立体構造解析法の開発
  • 批准号：
    21200044
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
  • 资助金额：
    $19.39万
  • 财政年份：
    2009
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tokyo Metropolitan University
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