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ln-Cell NMR:細胞内蛋白質間相互作用の直接解析法の開発

ln-Cell NMR:細胞内蛋白質間相互作用の直接解析法の開発
细胞内核磁共振:开发直接分析细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的方法
批准号:
15657031
负责人:
伊藤 隆
金额:
$2.24万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2005

项目摘要

项目成果

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本研究の目的は,In-Cell NMRの手法を用いて,生細胞中の蛋白質間相互作用を直接観測するシステムを確立するというものである.平成17年度は平成16年度までの結果を基にして以下のポイントについて開発研究を行った.1.^<13>C/^<15>N二重標識を用いたIn-Cell NMRシグナルの帰属法の検討細胞内蛋白質の動態を解析するためには,In-Cell NMRを用いてシグナルの位置特異的帰属を行っていく必要がある.一方で平成16年度までの研究から,In-Cell NMR測定では,(1)細胞中の目的蛋白質の寿命が短い,(2)細胞中の蛋白質濃度が低いため感度が低い,(3)細胞中の粘性などの影響でシグナルの線幅が著しく増大する,などの問題点が明らかになっていた.平成17年度は,これらの問題を解決するために,異種核多次元NMRを短時間で感度よく測定する手法の確立を行った.具体的には,非線形サンプリング法で測定したデータを最大エントロピー法を用いて処理を行なうことで,数時間で十分な感度と分解能を持つ3次元In-Cell NMRスペクトルを得ることに成功した.この手法を用いることで,生きた大腸菌中のCalmodulin(14kDa),およびCalmodulinのN末端およびC末端ドメインについて,主鎖NMRシグナルの帰属を行なうことができた.またこの手法は,In-Cell NMRのみならず,これまで解析の困難であった,溶解度が低く不安定な蛋白質の解析にも極めて有用であることを示した.2.In-Cell NMRを用いた蛋白質間相互作用の解析の試みIn-Cell NMR法を発展させることで,細胞内の蛋白質間互作用を従来法より高分解能で観測できる手法となる可能性がある.CalmodulinおよびCalmodulinと相互作用する蛋白質の大腸菌内共発現系を構築し,細胞内での蛋白質間相互作用の解析を行なった.
期刊论文(5)
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会议论文
生命秩序を担う生体超分子 蛋白質・核酸・酵素 2005年8月号増刊
负责生命秩序的生物超分子:蛋白质、核酸和酶 2005 年 8 月特别版
DOI: --
发表时间: 2005
期刊:
影响因子: --
作者: [M.Itoh, K.Nagatomo, Y.Kubo, Y.Sugimoto, O.Saitoh, M.Watanabe, Kaori Kurashima-Ito, Yasuhiro Isogai, Sundaresan Rajesh, 伊藤 隆(共著), 伊藤 隆(共著)]
通讯作者: 伊藤 隆(共著)
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Journal of Biomolecular NMR (印刷中)
影响因子: --
作者: [M.Itoh, K.Nagatomo, Y.Kubo, Y.Sugimoto, O.Saitoh, M.Watanabe, Kaori Kurashima-Ito]
通讯作者: Kaori Kurashima-Ito
DOI: 10.1021/bi0509043
发表时间: 2005-11-15
期刊: BIOCHEMISTRY
影响因子: 2.9
作者: [Kurashima-Ito, K, Kasai, Y, Shiro, Y]
通讯作者: Shiro, Y
金属の溶解析出反応を制御する有機物添加剤の超高感度ラマン分光学解析
  • 批准号:
    23K23441
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $2.66万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    伊藤 隆
  • 依托单位:
In situ SERS spectroscopy for organic additives with controlling metal deposition
  • 批准号:
    22H02173
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.32万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    伊藤 隆
  • 依托单位:
In-situ structural biology by NMR spectroscopy
  • 批准号:
    21H02419
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.23万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    伊藤 隆
  • 依托单位:
解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発
  • 批准号:
    22510237
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.33万
  • 财政年份:
    2010
  • 负责人:
    伊藤 隆
  • 依托单位:
海外基金