好アルカリ性好塩性古細菌の系統分類学的研究
嗜碱嗜盐古菌的系统发育研究
基本信息
- 批准号:04F04852
- 负责人:
- 金额:$ 0.77万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 2005
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本年度は、前年度において分類学的研究の対象としたルーマニアの塩湖由来Haloferax属5分離株について新種としての妥当性を検討するためDNA-DNA相同性実験を行い、また好アルカリ性好塩性古細菌の系統学的関係を推定するためrpo B'遺伝子の塩基配列を決定し系統解析を行った。DNA-DNA相同性実験では5分離株はいずれもHaloferax gibbonsiiの基準株と高い相同性を示した。しかし分離株とHaloferax gibbonsiiとは表現性状に差があることから少なくとも亜種レベルで異なるものと推定できた。rpo B'遺伝子による系統学的解析では、新たに増幅プライマーの設計を行い、17株の好塩性古細菌株のシークエンスを決定した後に系統樹を作成した。rpo B'遺伝子の系統樹は概ね16S rRNA遺伝子によるものと良く一致していた。特に好アルカリ性菌と非好アルカリ性菌が混在しているHalobiforma属やHalorubrum属は16S rRNA遺伝子の系統樹と同様に一つのクラスターを形成しており、好アルカリ性(あるいは中性性)が二次的な環境適合の結果である可能性を示唆していた。しかしrpo B'遺伝子の系統樹では好アルカリ性のNatronorubrum属は二つのクラスターに分かれ本属が不均一であることを示した。また非好アルカリ性であるが異なる16S rRNA遺伝子が存在するために同遺伝子では系統学的位置の推定が困難であったNatrinema sp.XA3-1はNatrinema pallidumと比較的近縁であるものの独立した系統枝を形成した。以上のようにrpo B'遺伝子の系統解析は16S rRNA遺伝子と相補的に考察することで、好アルカリ性好塩性古細菌の系統分類にも有効であるものと思われた。
は, before this year's annual に お い て taxonomic research の like と seaborne し た ル ー マ ニ ア の salt lake origin Haloferax belong to 5 isolates に つ い て new species と し て の justice を beg す 検 る た め DNA - DNA identity be 験 を い, ま た good ア ル カ リ resistance good salt archaea の systematics of masato presumption is を す る た め rpo The B' s 伝 subunit <s:1> base configuration を determines the を line った of the arp system analysis. DNA-DNA homogeneity experiment で で 5 isolates ずれ ずれ ずれ と Haloferax gibbonsii <s:1> reference strains と high <s:1> homogeneity を shows た た. し か し isolates と Haloferax gibbonsii と は phen に poor が あ る こ と か ら less な く と も 亜 kind レ ベ ル で different な る も の と presumption で き た. Rpo B 'posthumous son 伝 に よ る systematics of parsing で は, new た に rights of プ ラ イ マ ー の line design を い, 17 strains の good salt ancient bacteria strains の シ ー ク エ ン ス を decided し た に system after tree を made し た. rpo B' s legacy 伝 sub-<s:1> system tree た probability ね16S rRNA legacy 伝 sub-に よる <s:1> <s:1> と と good く consistent <s:1> て た た た た た Especially に good ア ル カ リ sex bacteria と not good ア ル カ リ sex bacteria が mixed in し て い る Halobiforma genus や Halorubrum は 16 s Traces of rRNA 伝 tree と の system with others in a つ に の ク ラ ス タ ー を form し て お り, good ア ル カ リ sex (あ る い は neutral) が secondary な environment suitable for の results で あ を る possibility in stopping し て い た. し か し rpo B 'posthumous son 伝 の system tree で は good ア ル カ リ sex の Natronorubrum genus は two つ の ク ラ ス タ ー に points か れ this genus が heterogeneity で あ る こ と を shown し た. ま た not good ア ル カ リ sex で あ る が different な る traces of 16 s rRNA 伝 son が exist す る た め に with heritage 伝 son で は systematics the location of the presumption の が difficult で あ っ た Natrinema sp. XA3-1 は Natrinema instead と comparison nearly try で あ る も の の independent し た system branch を し た. Above の よ う に rpo B 'heritage 伝 analytical は の system and 16 s rRNA posthumous son 伝 と phase of に investigation す る こ と で, good ア ル カ リ resistance good salt archaea の system classification に も have sharper で あ る も の と think わ れ た.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
伊藤 隆其他文献
Hot-mesh CVD 法を用いた原料ガスパルス供給によるGaN成長
利用热网CVD法脉冲供给原料气体进行GaN生长
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小前泰彰;深田祐介;黒木雄一郎;末光眞希;伊藤 隆;成田克;遠藤哲郎;中澤日出樹;高田雅介;安井寛治;赤羽正志 - 通讯作者:
赤羽正志
カイコ幼虫を用いた活性型PKB の発現と精製
家蚕幼虫活性PKB的表达和纯化
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
前崎 綾子;佐藤 亮介;田岡 万悟;金場 哲平;朝野 維起;藤田 千春;藤原 俊伸;伊藤 隆;礒辺 俊明;箱嶋 敏雄;前仲 勝実;三島 正規 - 通讯作者:
三島 正規
X-ray crystallographic study and NMR analyses of protonation state of chromophore of cyanobacterial photoreceptor protein
蓝藻感光蛋白发色团质子化状态的X射线晶体学研究和核磁共振分析
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
飯塚 佑介;永江 峰幸;青山 洋史;伊集院 良祐;伊藤 隆;広瀬 侑;三島 正規 - 通讯作者:
三島 正規
「革新派」という視点から見た戦前・戦後の政治(特集 占領期再考--「占領」か「解放」か)
“改良派”视角下的战前与战后政治(专题:重新思考占领时期——“占领”还是“解放”?)
- DOI:
- 发表时间:
2005 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Fukunaga Fumio;佐道 明広;伊藤 隆 - 通讯作者:
伊藤 隆
エーテル溶媒を用いたアモルファスGe酸化物におけるナトリウムイオン二次電池特性の向上
使用醚溶剂改善非晶氧化锗钠离子二次电池特性
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
梶田 徹也;伊藤 隆 - 通讯作者:
伊藤 隆
伊藤 隆的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('伊藤 隆', 18)}}的其他基金
金属の溶解析出反応を制御する有機物添加剤の超高感度ラマン分光学解析
控制金属溶解沉淀反应的有机添加剂的超灵敏拉曼光谱分析
- 批准号:
23K23441 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
In situ SERS spectroscopy for organic additives with controlling metal deposition
用于控制金属沉积的有机添加剂的原位 SERS 光谱
- 批准号:
22H02173 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
In-situ structural biology by NMR spectroscopy
通过核磁共振波谱进行原位结构生物学
- 批准号:
21H02419 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発
开发难以分析的蛋白质的高精度三维结构测定方法
- 批准号:
22510237 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
In-cell NMRによる真核細胞内蛋白質の立体構造解析法の開発
开发使用细胞内 NMR 进行真核蛋白质 3D 结构分析的方法
- 批准号:
21200044 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
In-Cell NMRを用いた生細胞内蛋白質の物性・動態解析法の開発
开发一种使用细胞内核磁共振分析活细胞中蛋白质的物理性质和动力学的方法
- 批准号:
20050024 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
細胞膜を介した金属の恒常性維持に関与する蛋白質の構造生物学
参与维持跨细胞膜金属稳态的蛋白质的结构生物学
- 批准号:
19036024 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ミトコンドリア膜を介した鉄の恒常性維特に関与するABC輸送体の構造・機能解析
ABC 转运蛋白的结构和功能分析,特别是通过线粒体膜参与铁稳态
- 批准号:
17048033 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ミトコンドリア膜を介した鉄の恒常性維持に関与するABC輸送体の構造生物学
ABC转运蛋白通过线粒体膜维持铁稳态的结构生物学
- 批准号:
16048230 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ln-Cell NMR:細胞内蛋白質間相互作用の直接解析法の開発
细胞内核磁共振:开发直接分析细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的方法
- 批准号:
15657031 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
相似国自然基金
外源磁场强化嗜盐古菌Haloferax mediterranei代谢有机废水生产PHA及其生物磁效应机制
- 批准号:51878010
- 批准年份:2018
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
古菌Haloferax sp. strain D1227 通过龙胆酸分解代谢3-苯丙酸的分子机理研究
- 批准号:31570100
- 批准年份:2015
- 资助金额:63.0 万元
- 项目类别:面上项目
Haloferax mediterranei代谢有机废水合成PHA和EPS的竞争机制及其强化PHA的定向调控
- 批准号:51478011
- 批准年份:2014
- 资助金额:85.0 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Atypical DNA replication in the absence of origins in archaeon Haloferax volcanii
古细菌 Haloferax volcanii 中缺乏起源的非典型 DNA 复制
- 批准号:
1944984 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Studentship
µ proteins in Haloferax volcanii: an important part of the proteome
Haloferax volcanii 中的 µ 蛋白质:蛋白质组的重要组成部分
- 批准号:
379070156 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Priority Programmes
Regulated maturation and controlled degradation: the life cycle of RNAs in Haloferax volcanii
调控成熟和控制降解:Haloferax volcanii 中 RNA 的生命周期
- 批准号:
287106579 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Research Grants
Small regulatory RNAs from the halophilic archaeon Haloferax volcanii
来自嗜盐古菌 Haloferax volcanii 的小调控 RNA
- 批准号:
238237704 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Research Grants
RUI: Characterization of Four Cryptic Circadian Gene Homologs In The Haloarchaeon Haloferax Volcanii
RUI:Haloarchaeon Haloferax Volcanii 中四个隐秘昼夜节律基因同源物的表征
- 批准号:
1051782 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Standard Grant
Charakterisierung neuer Ribonukleasen in Haloferax volcanii
Haloferax volcanii 中新核糖核酸酶的表征
- 批准号:
61949542 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Research Grants
RUI: Examination of the Genetic Mechanisms Used to Control the Expression of Salinity-regulated Proteins in the Archaeon Haloferax volcanii
RUI:用于控制古细菌 Haloferax volcanii 中盐度调节蛋白表达的遗传机制的检查
- 批准号:
0641243 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Continuing Grant
Small regulatory RNAs from the halophilic archaeon Haloferax volcanii
来自嗜盐古菌 Haloferax volcanii 的小调控 RNA
- 批准号:
39788743 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Priority Programmes
SGER: The Transcriptome of Haloferax volcanii
SGER:Haloferax volcanii 的转录组
- 批准号:
0620005 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Standard Grant
Microbial Genome Sequencing: Complete Genome Sequencing of the Extremely Halophilic Archaea Haloferax Volcanii
微生物基因组测序:极嗜盐古菌 Haloferax Volcanii 的完整基因组测序
- 批准号:
0243492 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 0.77万 - 项目类别:
Standard Grant














{{item.name}}会员




