新規in vivo可視化技術を用いた真核細胞における遺伝情報発現機構の解析
新規in vivo可視化技術を用いた真核細胞における遺伝情報発現機構の解析
批准号:
13GS0013
负责人:
古久保 哲朗
金额:
$217.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2005
中文摘要
すべての生命現象は必要な遺伝情報がプログラム通りに正しく発現することにより支えられている。遺伝子発現プログラムにおいて最も重要な制御段階は「転写」であり、その制御反応に関与する蛋白質の多くはすでに同定されたと考えられるが、それらの生体内における作用機構の詳細は依然として明らかではない。本研究の目的は、生物個体における遺伝子発現を非破壊的に計測する新規手法の開発を行い、その手法を用いて真核細胞の転写制御を支える分子的基盤及びその作動原理を明らかにすることである。無機リン酸のポリマーであるポリリン酸は、全ての生物に普遍的に存在し、^<31>P-NMRによる定量的なマイクロイメージングが可能であることから、遺伝子発現量をモニターする上で非常に有効なプローブになりうるものと考えられる。これまで我々は、出芽酵母、動物培養細胞、動物・植物個体を宿主とし、ポリリン酸合成酵素(または合成・蓄積に関与するタンパク質)を新規レポーター遺伝子として用いてプロモーター活性を効率よくモニタリングできる手法の開発を進めてきた。今年度は、^<31>P-MRI測定系の検出限界を打破するべく、T_1緩和時間の変化を^1H-MRIにより画像化する新規モニタリング手法の開発を行った。別途開発を進めてきた自動コロニースポッターと組み合わせることにより、少なくとも出芽酵母においては、極めて短時間に上流活性化配列(UAS)、及びコアプロモーター配列の決定を行うことが可能となった。
英文摘要
すべての生命現象は必要な遺伝情報がプログラム通りに正しく発現することにより支えられている。遺伝子発現プログラムにおいて最も重要な制御段階は「転写」であり、その制御反応に関与する蛋白質の多くはすでに同定されたと考えられるが、それらの生体内における作用機構の詳細は依然として明らかではない。本研究の目的は、生物個体における遺伝子発現を非破壊的に計測する新規手法の開発を行い、その手法を用いて真核細胞の転写制御を支える分子的基盤及びその作動原理を明らかにすることである。無機リン酸のポリマーであるポリリン酸は、全ての生物に普遍的に存在し、^<31>P-NMRによる定量的なマイクロイメージングが可能であることから、遺伝子発現量をモニターする上で非常に有効なプローブになりうるものと考えられる。これまで我々は、出芽酵母、動物培養細胞、動物・植物個体を宿主とし、ポリリン酸合成酵素(または合成・蓄積に関与するタンパク質)を新規レポーター遺伝子として用いてプロモーター活性を効率よくモニタリングできる手法の開発を進めてきた。今年度は、^<31>P-MRI測定系の検出限界を打破するべく、T_1緩和時間の変化を^1H-MRIにより画像化する新規モニタリング手法の開発を行った。別途開発を進めてきた自動コロニースポッターと組み合わせることにより、少なくとも出芽酵母においては、極めて短時間に上流活性化配列(UAS)、及びコアプロモーター配列の決定を行うことが可能となった。
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N.Goda, T.Tenno, H.Takasu, H.Hiroaki, M.Shirakawa: "The PRESAT-vector. Asymmetric T-vector for high throughput screening of soluble protein domains for structural proteomics"Protein Science. 13・3. 652-658 (2004)
N.Goda、T.Tenno、H.Takasu、H.Hiroaki、M.Shirakawa:“PRESAT 载体。用于结构蛋白质组学的可溶性蛋白质结构域高通量筛选的不对称 T 载体”蛋白质科学 13・3。 -658 (2004)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Z.Kato, J.-G.Jee, H.Shikano, M.Mishima, I.Ohki, H.Ohnishi, A.Li, K.Hashimoto, E.Matsukuma, K.Omoya, Y.Yamamoto, T.Yoneda, T.Hara, N.Kondo, M.Shirakawa: "The structure and binding mode of interleukin-18"Nature Structural Biology. 10・11. 966-971 (2003)
Z.Kato、J.-G.Jee、H.Shikano、M.Mishima、I.Ohki、H.Ohnishi、A.Li、K.Hashimoto、E.Matsukuma、K.Omoya、Y.Yamamoto、T.Yoneda ,T.Hara,N.Kondo,M.Shirakawa:“白细胞介素18的结构和结合模式”自然结构生物学10・11(2003)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1016/j.jmb.2006.03.036
发表时间:
2006-05-26
期刊:
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
5.6
作者:
[Baba, Daichi, Maita, Nobuo, Shirakawa, Masahiro]
通讯作者:
Shirakawa, Masahiro
Takahashi, M., Maraboeuf, F., Sakai, Y., Yakushiji, H., Mishima, M., 他: "Role of tryptophan residues in the recognition of mutagenic oxidized nucleotides by human antimutator MTH1 protein"Journal of Molecular Biology. 319. 129-139 (2002)
Takahashi, M.、Maraboeuf, F.、Sakai, Y.、Yakushiji, H.、Mishima, M.等人:“色氨酸残基在人抗突变剂 MTH1 蛋白识别诱变氧化核苷酸中的作用”分子杂志生物学。319。129-139(2002)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kobayashi, A., Miyake, T., Kawaichi, M., Kokubo, T: "Mutations in the histone fold domain of the TAF12 gene show synthetic lethality with the TAF1 gene lacking the TAF N-terminal domain (TAND) by different mechanisms from those in the SPT15 gene encoding
Kobayashi, A.、Miyake, T.、Kawaichi, M.、Kokubo, T:“TAF12 基因的组蛋白折叠结构域中的突变通过不同机制表现出对缺乏 TAF N 末端结构域 (TAND) 的 TAF1 基因的合成致死性”
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 22 条
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
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批准号:23K05642
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:20052024
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2008
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
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批准号:06F05755
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:18055028
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.57万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:17054034
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2005
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:16013240
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2004
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:15013247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2003
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:14014244
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2002
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写調節における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:13680765
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:13206051
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:13014214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:12206060
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:12028225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:12034215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母も用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:11154220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:11160211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:10173221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:10179211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:09277217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:08250217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1996
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
海外基金