転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能
基本信息
- 批准号:20052024
- 负责人:
- 金额:$ 4.61万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2009
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、TATAボックス結合タンパク質(TBP)と14種類のTBP随伴因子(TAF1-14)から構成される巨大なタンパク質複合体であり、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。一方、5種類のサブユニット(TAF5,6,9,10,12)をTFIIDと共有するSAGAはヒストンをアセチル化するとともにTBPのTATA配列への結合を補助する働きを有する。コアプロモーター中にTATA配列を含むストレス誘導性遺伝子ならびにTATA配列を含まないハウスキーピング遺伝子はそれぞれ主にSAGA, TFIIDによって転写されると考えられているが、その詳細については不明な点が多い。今回我々は、TFIIDとSAGAの機能分担について新たな知見を得るべくChIP on chip解析を行った。具体的にはTFIIDの全サブユニット(TAF1-14, TBP)、SAGA(GCN5)、基本転写因子群(TFIIB(SUA7), TFIIE(TFA2), TFIIF(TFG1), TFIIH(TFB3)), NC2(BUR6, NCB2),RNAポリメラーゼII(RPB1)のC末端にエピトープタグを付加し、野生株及びtaf1変異株において、これらの因子がゲノム上(第III, IV, V染色体)のどの領域に結合するかを詳細に調べた。その結果、(1)TFIIBとNC2の機能連関、(2)TFIIDとSAGAのリボソーム遺伝子(RPG)プロモーターへの共結合、(3)RPGプロモーター上におけるtaf1変異による転写異常の分子機序、(4)TAF2の結合特異性、(5)コアプロモーターごとにTFIIDの高次構造が異なる可能性、等々複数の興味深い知見が得られた。
コ ア プ ロ モ ー タ ー tectonic を know す る basic planning write factor TFIID は, TATA ボ ッ ク ス combining タ ン パ ク mass (the TBP) と 14 kinds の the TBP as companion factor (TAF1-14) か ら constitute さ れ る huge な タ ン パ ク qualitative complex で あ り, planning to write regulating factor か ら by け take っ た signal を planning write quantity の rights reduce へ と variations in す る The な at the center of で cut を fruit たす. Side, 5 kinds の サ ブ ユ ニ ッ ト (TAF5, 6,9,10,12) を TFIID と mutual す る SAGA は ヒ ス ト ン を ア セ チ ル change す る と と も に the TBP の TATA match column へ の combining を subsidies す る 働 き を have す る. コ ア プ ロ モ ー タ ー に with TATA in column を containing む ス ト レ ス induced posthumous son 伝 な ら び に TATA match column を containing ま な い ハ ウ ス キ ー ピ ン グ posthumous son 伝 は そ れ ぞ れ main に SAGA, TFIID に よ っ て planning write さ れ る と exam え ら れ て い る が, そ の detailed に つ い て は が い more unknown な point. Now back to my 々 は, TFIID と SAGA の function sharing に つ い て new た な knowledge を must る べ く ChIP on line analytical を ChIP っ た. Specific に サブユニット TFIID サブユニット all サブユニット(TAF1-14, TBP), SAGA(GCN5), basic 転 write factor groups (TFIIB(SUA7), TFIIE(TFA2), TFIIF(TFG1), TFIIH(TFB3)), NC2(BUR6) NCB2), RNA ポ リ メ ラ ー ゼ II (RPB1) の C terminal に エ ピ ト ー プ タ グ を pay plus し, wild plants and び taf1 - different strains に お い て, こ れ ら の factor が ゲ ノ ム on chromosomes (III, IV, V) の ど の fields に す る か を detailed に adjustable べ た. そ の results, (1) TFIIB と NC2 の function even masato, (2) TFIID と SAGA の リ ボ ソ ー ム heritage 伝 child (RPG) プ ロ モ ー タ ー へ の altogether, and (3) the RPG プ ロ モ ー タ ー on に お け る taf1 - different に よ る planning write abnormal の molecular machine order, (4) TAF2 の specificity, (5) コ ア プ ロ モ Youdaoplaceholder0 タ ごとにTFIID <e:1> higher-order construction が different なる possibilities, equal 々 complex numbers <e:1> are of great interest and the knowledge is が られた.
项目成果
期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
出芽酵母のHMGBファミリータンパク質HMO1によるリボソームタンパク質遺伝子の転写開始点決定機構
酿酒酵母HMGB家族蛋白HMO1确定核糖体蛋白基因转录起始点的机制
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:笠原浩司;ら
- 通讯作者:ら
Deletion of the N-terminal domain of TAF1 (taf1-TAND) exhibits synthetic lethality with mutations of the RAM signaling network in budding yeast
TAF1 N 端结构域 (taf1-TAND) 的缺失在芽殖酵母中通过 RAM 信号网络的突变表现出合成致死性
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ohyama Y.;Kasahara K.;Kokubo T.
- 通讯作者:Kokubo T.
Saccharomyces cerevisiae Med9 comprises two functionally distinct domains that play different roles in transcriptional regulation
- DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01250.x
- 发表时间:2009-01
- 期刊:
- 影响因子:2.1
- 作者:Hiroyuki Takahashi;K. Kasahara;T. Kokubo
- 通讯作者:Hiroyuki Takahashi;K. Kasahara;T. Kokubo
Structure-function correlation of microl for micromere specification insea urchin embryos.
海胆胚胎微粒规格的 microl 的结构-功能相关性。
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yamazaki A;Ki S;Kokubo T;Yamaguchi M.
- 通讯作者:Yamaguchi M.
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
古久保 哲朗其他文献
p53活性化剤とCDK8阻害剤の併用は神経芽腫に対し細胞死を誘導する
p53 激活剂和 CDK8 抑制剂的组合诱导神经母细胞瘤细胞死亡
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
中島 綾奈;宮崎 允;日比谷 優子;富山 新太;古久保 哲朗;市村 幸一 - 通讯作者:
市村 幸一
染色体異常の分子メカニズム(日本遺伝学会奨励賞受賞講演)
染色体异常的分子机制(日本遗传学会鼓励奖讲座)
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
笠原 浩司;中山 理紗;志波 優;兼崎 友;石毛 太一郎;吉川 博文;古久保 哲朗;Takuro Nakagawa;中川拓郎 - 通讯作者:
中川拓郎
磁気共鳴法を利用した生細胞での遺伝子発現解析テクノトレンド バイオテクノロジージャーナルvol.6, No.5
使用磁共振技术进行活细胞基因表达分析的技术趋势生物技术杂志第 6 卷第 5 期
- DOI:
- 发表时间:
2006 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
古久保 哲朗;ら - 通讯作者:
ら
出芽酵母においてSpt3/SAGAの一過的な機能喪失がもたらす解糖系遺伝子プロモーターのTaf1/TFIID依存的な転写活性化
酿酒酵母中Spt3/SAGA功能短暂丧失导致糖酵解基因启动子的Taf1/TFIID依赖性转录激活
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
岩見 亮;高井 直樹;古久保 哲朗 - 通讯作者:
古久保 哲朗
出芽酵母のFK506/ラパマイシン結合タンパク質Fpr1は、リボソームタンパク質遺伝子の転写因子として働く
酿酒酵母 FK506/雷帕霉素结合蛋白 Fpr1 充当核糖体蛋白基因的转录因子。
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
笠原 浩司;中山 理紗;志波 優;兼崎 友;石毛 太一郎;吉川 博文;古久保 哲朗 - 通讯作者:
古久保 哲朗
古久保 哲朗的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('古久保 哲朗', 18)}}的其他基金
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
酿酒酵母启动子重编程因子的鉴定及核心因子选择机制的阐明
- 批准号:
23K05642 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
新型固氮细菌基因表达的可视化
- 批准号:
06F05755 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能
- 批准号:
18055028 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能
- 批准号:
17054034 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
16013240 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
15013247 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
14014244 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
新規in vivo可視化技術を用いた真核細胞における遺伝情報発現機構の解析
利用新型体内可视化技术分析真核细胞遗传信息表达机制
- 批准号:
13GS0013 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
転写調節における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能
- 批准号:
13680765 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
13206051 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
相似海外基金
RNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHの特異的相互作用の普遍性と特異性
RNA聚合酶与碱性转录因子TFIIH之间特异性相互作用的普遍性和特异性
- 批准号:
24K09354 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ウイルス性基本転写因子の核内集積から解き明かす新たな遺伝子発現制御機構の解明
从病毒基本转录因子的核积累阐明新的基因表达控制机制
- 批准号:
22K07090 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ヒトRNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHとの複合体の構造モデルの構築
人RNA聚合酶与碱性转录因子TFIIH复合物结构模型的构建
- 批准号:
21K06035 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能
- 批准号:
18055028 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能
- 批准号:
17054034 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
16013240 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
転写因子の欠損に起因する発がんにおける基本転写因子の役割と核内シグナル伝達機構
基础转录因子及核信号转导机制在转录因子缺陷癌变中的作用
- 批准号:
15024240 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
基本転写因子TFIIEを介するRNAポリメラーゼIIの転写制御の分子機構解析
碱性转录因子TFIIE介导RNA聚合酶II转录调控的分子机制分析
- 批准号:
03J50631 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
15013247 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
- 批准号:
14014244 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 4.61万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas