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基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性

全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征

基本信息

批准号：
13206051
负责人：
古久保哲朗
金额：
$ 3.52万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、転写開始前複合体のアッセンブリーに際して核となる分子であり、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。我々はTFIIDサブユニット(TAF)の生体内機能について解析を進める過程で、TAF145のN末端に存在するTBP機能阻害領域(TAND)がTFIIDによる転写活性化の分子スイッチとして機能する可能性を見出した。またコアプロモーターの認識能に異常をきたすTAF145点変異体(N568Δ,T657K)を新たに単離し、これらの変異株においてはTATAボックス以外のコアプロモーターエレメントの認識に異常が見られることを示した。一方、普遍的転写因子であるTFIIDあるいはSAGA複合体の標的遺伝子をゲノムスケールで同定するため、まず上記各種taf145変異株と野生株(対照)に対して独立に三回のDNAチップ実験を行い、二回以上の試行において正負2.5倍以上の変動を示した遺伝子を有意なTAF145標的遺伝子とした。その結果N568Δ,T657K,ΔTAND株において、それぞれ397,521,49個の標的遺伝子が同定された。これらの遺伝子群をさらに分類したところ、N568Δ,T657K,ΔTAND株において特異的に影響を受ける遺伝子がそれぞれ375,272,26個存在し、共通に影響の見られた遺伝子は15個のみであった。同様の解析をtaf61-1,2変異株についても行い、それぞれ429,511個の標的遺伝子を見出した。この場合も各株に特異的な標的遺伝子がそれぞれ220,302個、両株に共通のものが209個存在した。以上の結果は、いずれのtaf変異株においても、それぞれの変異によりTFIID(あるいはSAGA)複合体の異なる機能が損なわれたことを示唆している。

In order to understand the basic writing factor TFIID, before the writing starts, the basic writing factor is used. Before the writing starts, the complex is used to analyze the information of the molecule. The signal is used to determine the amount of information that can be obtained from the data. We use TFIID monitoring equipment (TAF) in vivo to analyze the progress of the process, and the existence of TBP at the N-terminal of the TAF145 can block the domain (TAND). The molecular characterization of the activation of the TBP is possible. I don't know what to do. I don't know. I don't know, I don't know. One and a half of the common writing factors, such as TFIID replication and SAGA replication, show that children are interested in using the same level of data as those of various taf145 strains in the wild (according to the photo), and that three times as many as two and a half times more than two cycles indicate that the child is interested in using the TAF145 virus. The results showed that the offspring of N568 Δ, T657K and Δ TAND were the same as those of 49 obese, 397, 521 and 49 respectively. The sub-group of the whole family is divided into five categories, namely, N568 Δ, T657K, and Δ TAND. There are 26 existing families that share the same number of 15 models. In the same way, the children of 429511 parasitoids of taf61-1 were analyzed in the same way. There are 220302 sub-strains and 209 common strains of each strain in this city. The results of the above results show that the taf strain has not been detected, and that the TFIID (diagnostic SAGA) complex has been cloned. The mechanism is capable of instigating infection.