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基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性

全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征

基本信息

批准号：
16013240
负责人：
古久保哲朗
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。我々はTAF1のTBP機能阻害領域TANDがTFIIDによる転写活性化の分子スイッチとして機能する可能性を示すとともに、コアプロモーターの認識能に異常をきたすtaf1点変異体を複数単離し(N568Δ,T657K)、その解析を進めてきた。TFIIDを含む普遍的転写因子間の機能的ネットワークの実体を明らかにしていくためには、それぞれの標的遺伝子を網羅的に単離するというゲノム生物学的手法が極めて有効である。昨年度までに、DNAチップにより同定したTAND標的遺伝子の一つであるHIS4について詳しい解析を行い、制限温度下における転写量減少の原因は、転写調節因子BAS1の有する複数種類の転写活性化ドメイン(AD)のうち、C端側に存在するAD(以下AD^*と略する)からのシグナルが特異的に阻害されるためであることを明らかにした。今年度はこの系についてさらに解析を進め、AD^*による転写活性化にはTANDのみならずBAS2との直接的な相互作用も重要であることを明らかにした。また興味深いことに、コアクチベーター能を有するMediator複合体の構成成分の一つであるMED9の機能は、BAS1のN末端側ADによる転写活性化に必要であったが、AD^*による転写活性化には不要であった。さらにTANDΔ med9Δ二重変異株を用いた解析から、両因子は酵母の生育ならびにpolyA+ mRNAの転写において重複した機能を有することが示された。またChIP on chip法を用いてTAF1タンパク質のプロモーターローディングをゲノムワイドに解析したところ、従来考えられていたモデルとは異なり、TFIIDがほぼ全てのクラスII系プロモーターに結合していることが示唆された。

In order to understand the basic writing factor TFIID, write factor, receive signal, write quantity, write quantity, read, write, write, Our TAF1 TBP machine can prevent the field of TAND, TFIID, and write activation. The machine can display the possibility of detecting the number of copies of the taf1 (N568 Δ, T657K) and the analysis of the data. TFIID contains a common write factor that enables communication between computers. There are significant differences in how to do this, and how to do so in the sub-network of Internet users. Last year, the data of DNA and BAS1 were the same as that of the TAND. In the first place, we analyzed the cause of the low volume of writing at the temperature limit, and the reason for the reduction of writing volume at the temperature limit. There are many factors such as complex data, such as the activation of writing (AD), On the C-side, there is a block block of the AD (the following AD^ *). This year, it is important to understand the importance of interaction in the context of the improvement of TAND analysis and the activation of BAS2. Because of the deep flavor, the components of the Mediator complex, the components of the MED9 machine, the N-terminal AD of the BAS1, the activation of the writing process, the activation of the device, and the activation of the device are necessary. The double strain of TAND Δ med9 Δ was analyzed by PCR, and the factors were analyzed by yeast. The polyA+ mRNA was written and the mechanism was analyzed. In the ChIP on chip method, you can use the TAF1 method to determine the accuracy of the system. This is the best way to tell you how to solve the problem. In this way, you can find out the difference between the two groups. The TFIID method is used to show that the whole system is correct.