基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
批准号:
16013240
负责人:
古久保 哲朗
金额:
$3.2万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --
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英文摘要
コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。我々はTAF1のTBP機能阻害領域TANDがTFIIDによる転写活性化の分子スイッチとして機能する可能性を示すとともに、コアプロモーターの認識能に異常をきたすtaf1点変異体を複数単離し(N568Δ,T657K)、その解析を進めてきた。TFIIDを含む普遍的転写因子間の機能的ネットワークの実体を明らかにしていくためには、それぞれの標的遺伝子を網羅的に単離するというゲノム生物学的手法が極めて有効である。昨年度までに、DNAチップにより同定したTAND標的遺伝子の一つであるHIS4について詳しい解析を行い、制限温度下における転写量減少の原因は、転写調節因子BAS1の有する複数種類の転写活性化ドメイン(AD)のうち、C端側に存在するAD(以下AD^*と略する)からのシグナルが特異的に阻害されるためであることを明らかにした。今年度はこの系についてさらに解析を進め、AD^*による転写活性化にはTANDのみならずBAS2との直接的な相互作用も重要であることを明らかにした。また興味深いことに、コアクチベーター能を有するMediator複合体の構成成分の一つであるMED9の機能は、BAS1のN末端側ADによる転写活性化に必要であったが、AD^*による転写活性化には不要であった。さらにTANDΔ med9Δ二重変異株を用いた解析から、両因子は酵母の生育ならびにpolyA+ mRNAの転写において重複した機能を有することが示された。またChIP on chip法を用いてTAF1タンパク質のプロモーターローディングをゲノムワイドに解析したところ、従来考えられていたモデルとは異なり、TFIIDがほぼ全てのクラスII系プロモーターに結合していることが示唆された。
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会议论文
In vivo synthesis of Taf1p lacking TAF N-terminal domain using alternative transcription or translation initiation sites.
使用替代转录或翻译起始位点体内合成缺乏 TAF N 末端结构域的 Taf1p。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Genes to Cells 9・8
影响因子:
--
作者:
[K.Kasahara, M.Kawaichi, T.Kokubo]
通讯作者:
T.Kokubo
Autonomous function of the amino-terminal inhibitory domain of TAF1 in transcriptional regulation.
TAF1 氨基末端抑制域在转录调控中的自主功能。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Molecular and Cellular Biology 24・8
影响因子:
--
作者:
[S.Takahata, K.Kasahara, M.Kawaichi, T.Kokubo]
通讯作者:
T.Kokubo
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
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批准号:23K05642
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:20052024
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2008
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
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批准号:06F05755
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:18055028
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.57万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:17054034
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2005
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:15013247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2003
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:14014244
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2002
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規in vivo可視化技術を用いた真核細胞における遺伝情報発現機構の解析
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批准号:13GS0013
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项目类别:Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
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资助金额:$217.73万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写調節における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:13680765
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:13206051
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:13014214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:12206060
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:12028225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:12034215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母も用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:11154220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:11160211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:10173221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:10179211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:09277217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:08250217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1996
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
海外基金