课题基金 / 基金详情

ディスタンスジオメトリー法による溶液中の生理活性ペプチドの高次構造解析

ディスタンスジオメトリー法による溶液中の生理活性ペプチドの高次構造解析
利用距离几何法分析溶液中生物活性肽的高阶结构
批准号:
61580235
负责人:
小林 祐次
金额:
$0.64万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份:
1986
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1986 至 --

项目摘要

项目成果

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蛋白質およびモデルペプチドの溶液中での構造解析の手法を開発中であるが、本年度は先に行った核磁気共鳴吸収(NMR)測定とディスタンスジオメトリー法の組合せによる手法を更に発展させることが出来た。NMRより核オーバーハウザー効果(NOE)を測定し、分子内の原子間距離の情報を取り出すが、この際それぞれの吸収ピークを個々の原子核に帰属しなければならない。従来の二次元NMR法ではスペクトルの位相の情報を利用することが出来ず、各ピークの分離がよくなくて大きい分子になるとピークの重なりが生じた。このため全ピークの帰属の可能であったのはアミノ酸13残基のコノトキシンと14残基のエンテロトキシン(Sth)のみであった。今回は二次元の測定法に改良を加え位相検知の可能なシフト相関法(COSY),NOE相関法(NOESY)を用いることを試み、ピークの分離に飛躍的な改善をみた。また最近報告されはじめた多数の共有結合を通してスピン相関を観測できるリレーシフト相関法(RELAY-COSY)の適用条件の検討も行った。このような測定法の改良により、今まで不可能であった水溶液中でのNOE測定を可能とし、残基数18のアンジオテンシン変換酵素阻害剤アンコベニンのNMR解析を水溶液中で行った。さらに分離能が上ったことにより残基数28の心房性ナトリウム利尿ペプチド(hANP)のNMR解析も行えた。これらの実験結果をディスタジオンスメトリー法で解析するが、我々の二面角空間におけるターゲット関数の極小化を用いるDADAS法に改良を加え、今まで考慮できなかったスピン-スピン結合定数をも三次元構造構築の情報として用いることが出来るようにした。この改良されたプログラムを用いて上記2つのペプチドの構造解析を大型計算機により行ったが、本年度補助金で購入した分子モデルはその結果の考察に際して重要な手助けとなっった。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
小林祐次: 化学. 42. 152-157 (1987)
小林裕二:化学 42. 152-157 (1987)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
小林祐次: "「続生化学実験講座 タンパク質化学」高次構造" 東京化学同人,
小林裕二:“‘蛋白质化学实验教程:高阶结构’”东京化学同人,
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
小林祐次: Peptide Chemistry. 1986. 127-130 (1987)
小林裕二:肽化学1986。127-130(1987)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
小林祐次: "「R&Dコンピューティングガイド.生物学モデルと計算」NMRによる構造決定" サイエインスフォーラム,
Yuji Kobayashi:“‘研发计算指南。生物模型和计算’通过 NMR 确定结构”科学论坛,
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    アディポネクチンの超分子構造・相互作用
    • 批准号:
      18052020
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.1万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      小林 祐次
    • 依托单位:
    アディポネクチンの超分子構造・相互作用解析
    蛋白質生合成の最終過程を司るリボソーム再生因子(RRF)の立体構造解析
    • 批准号:
      10174219
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
    • 资助金额:
      $1.28万
    • 财政年份:
      1998
    • 负责人:
      小林 祐次
    • 依托单位:
    蛋白質生合成の最終過程を司るリボソーム再生因子(RRF)の立体構造解析
    • 批准号:
      09278220
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.28万
    • 财政年份:
      1997
    • 负责人:
      小林 祐次
    • 依托单位: