Structures of chemically modified oligomers: studies using high resolution mass spectrometry

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Chemische Veränderungen der DNA, seien sie endogen oder exogen, führen zur Veränderung der supramolekularen Eigenschaften von DNA und daher zu verändertem biologischem Verhalten. Wir wollen Elektrospray und MALDI an einem hochauflösenden Massenspektrometer (FT-ICR-MS) nutzen, um chemische Modifikationen zu charakterisieren. Dazu soll das Spektrometer auch mit Kapillartrennmethoden (Kapillarelektrophorese, NanoHPLC) gekoppelt werden. Auf der Basis der Primärstrukturen sollen die daraus resultierenden Suprastrukturen (z. B. Duplex- oder Triplex-DNA) zuerst in Modellen untersucht und dann weitere, nicht kovalente Komplexe (DNA/Proteine, DNA/RNA) hinzugenommen werden. Da nur mit oligomeren Nukleotiden biologisch relevante Aussagen zu erhalten sind, ist FT-ICR-MS das geeignetste Werkzeug. Die Technik ist auch bei MSN-Experimenten hochauflösend, empfindlich und hat einen ausreichend großen Massenbereich. Für die Studien zum supramolekularen Verhalten sind die BIRD-Technik und die Kombination mit einem neu zu bauenden IonenmobilitätsSpektrometer vorgesehen.