DNAとの動的相互作用解析を目的とした^<13>C標識DNA結合蛋白質の全合成

用于与DNA动态相互作用分析的^ 13 C标记的DNA结合蛋白的全合成

• 批准号: 63540425
• 负责人: 相本 三郎
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1988
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1988 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-63540425/
• 关键词: DNA結合タンパク質; 安定同位体標識; ペプチド合成; タンパク質の化学合成; DNAータンパク質相互作用。

B.stearothermophilusのHUタイプDNA結合タンパク質と2本鎖DNAとの相互作用の様式を解明するために以下の実験を行った。1.安定同位体で標識されていないB.stearothermophylusのHUタイプDNA結合タンパク質の合成アミノ酸90残基よりなるDNA結合タンパク質の化学合成について検討し、独自のタンパク質合成法を開発し、その合成に成功した。2.安定同位体で標識する部位の検討2本鎖DNAは、DNA結合タンパク質と80位と83位のLys残基および58位と61位のArg残基を介して結合していると考えられており、まずこの部位を安定同位体で標識したタンパク質を合成することとした。また、Lysの3位、18位、19位、23位により構成される面、Lysの38位と41位で構成される面でのタンパク質とDNAとの相互作用の有無を調べるため、これら2つのグループのLysがそれぞれ標識された物を合成することとした。なお安定同位体としては、当初の予定を変更し、相互作用を直接調べることのできる^<15>Nを導入することとした。3.安定同位体標識アミノ酸誘導体の合成LysおよびArg側鎖の窒素を^<15>Nで標識した誘導体の合成法について検討した。その結果、独自の方法を開発することにより、極めて効率良くアミノ酸誘導体を合成することができた。4.安定同位体標識タンパク質の合成筆者らの開発した方法により特定の部位のLysあるいはArgを標識したタンパク質が合成できた。5.DNAータンパク質相互作用の検討NMRを用いて今後両者の相互作用の詳しい検討を行う予定である。

B.Stearothermophilus HU DNA binding protein 2. The interaction between DNA and protein is explained in detail below. 1. The identification of stable isotopes in B.stearothermophylus was successfully developed and synthesized by chemical synthesis of DNA-binding compounds using acid 90 residues. 2. The identification of stable isotope sites is mediated by Lys residues at positions 80 and 83 and Arg residues at positions 58 and 61. Lys at position 3, 18, 19 and 23 constitutes the surface, Lys at position 38 and 41 constitutes the surface, Lys at position 2 constitutes the surface, Lys at position 3 and Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 and Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 constitutes the surface, Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 and Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 constitutes the surface, Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 and Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 constitutes the surface, Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 constitutes the surface, Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 constitutes the surface, Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at position 38 constitutes the surface, Lys at position 41 constitutes the surface, Lys at A stable isotope is introduced into the system by direct interaction<15>. 3. Stable Isotope Identification and Synthesis of Acid Inducers Lys and Arg Side <15>Locks The result is that the method of synthesis is very effective. 4. A method for the development of stable isotope identification and synthesis 5. The study of DNA molecule interaction by NMR

项目成果

Saduro Aimoto: Chemistry Lett.

Saduro Aimoto：化学快报。

Hironobu Hojo: Peptide Chemistry 1988. 97-102 (1989)

北条博信：肽化学 1988. 97-102 (1989)