選択的安定同位体標識を用いた高分子量タンパク質複合体の溶液構造決定法の開発

利用选择性稳定同位素标记开发高分子量蛋白质复合物的溶液结构测定方法

• 批准号: 10179221
• 负责人: 伊藤 隆
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10179221/
• 关键词: triple-resonance NMR; 高分子量タンパク質; 安定同位体標識; global fold; アミノ酸選択的標識

平成10年度は主として,(1)高分子量タンパク質におけるアロマティックアミノ酸側鎖シグナル解析のための安定同位体標識法およびNMR測定法の開発,(2)選択的プロトン標識を用いた高分子量タンパク質のglobal foldの決定,の2点について研究を行った.(1)については,アロマティック側鎖の磁化を,分離のよいアミド窒素,アミドプロトンに伝達させて観測する経路を考え,新しいパルス・シークエンスを考案した.またこれらの測定においては,Cβ/Cαを経由した磁化の伝達の際に著しい感度低下が予想されたために,Hβ/Hαを選択的に2H標識することを試みた.安定同位体標識試料は,大腸菌での大量発現系を用いてα/β-^2H/^<13>C/^<15>N-Pheを取り込ませることによって調製した.モデル試料(〜1mM)を用いて上記の測定を行ったところ,すべてのPhe残基側鎖のシグナルを,実験上妥当な感度で観測することができた.またα/β選択的^2H標識によって著しい感度上昇が得られることが判明した.この手法は高分子量タンパク質におけるPhe/Tyr残基側鎖シグナルの帰属に普遍的に利用できる.(2)については,分子量27Kの酵母YUH1を用いて研究を行った.試料として,Ile/Leu/Val/Phe/Tyr残基を^1H/^<15>N標識し,他をユニフォーム^2H/^<15>N標識したものと,Ile/Leu/Valを^1H/^<13>C/^<15>Nで,またPhe/Tyrを^1H/^<15>N標識し,他をユニフォーム^2H/^<15>N標識したものを作成した.この手法を用いることによってシグナルのオーバーラップが緩和され,速やかに側鎖シグナルの帰属を行うことができた.さらにこれらの試料について観測した3D NOESYスペクトルを解析しglobal foldの決定を行った.

Pp.47-53 10 year は main と し て, (1) high molecular weight タ ン パ ク qualitative に お け る ア ロ マ テ ィ ッ ク ア ミ ノ acid side chain シ グ ナ ル parsing の た め の identification method of stable isotopic body お よ び NMR measurement の 発, (2) sentaku プ ロ ト ン logo を with い た high molecular weight タ ン パ ク qualitative の global A fold の decision, の 2 に つ い を line っ て research た. (1) に つ い て は, ア ロ マ テ ィ ッ ク side chain の を magnetization, separation の よ い ア ミ ド smothering, ア ミ ド プ ロ ト ン に 伝 da さ せ て 観 measuring す る を exam え 経 road, new し い パ ル ス · シ ー ク エ ン ス を test case し た. ま た こ れ ら の determination に お い て は, C alpha beta/C を 経 by し た magnetization の 伝 da の interstate に the し い が low sensitivity to think さ れ た た め に, alpha beta H/H を sentaku に 2 H logo す る こ と を try み た. Stable isotopic body logo sample は, coliform で の large 発 practice while department を い て alpha/beta 2 h ^ ^ < 13 > C / ^ < 15 > N - Phe を take り 込 ま せ る こ と に よ っ て modulation し た. モ デ ル sample (~ 1 mm) を い の measuring line を っ て in remember た と こ ろ, す べ て の Phe residue side chain の シ グ ナ ル を, be appropriate な 験 Sensitivity で す 観 test る こ と が で き た. ま た alpha/beta, sentaku ^ 2 h logo に よ っ て in し い sensitivity rise が have ら れ る こ と が.at し た. こ の gimmick は high molecular weight タ ン パ ク qualitative に お け る Phe/Tyr residues side lock シ グ ナ ル の 帰 に widely に using で き る. (2) に つ い て は, molecular weight and 27 k YUH1 の yeast Youdaoplaceholder0 study を line った with て て. Sample と し て, Ile/Leu/Val/Phe/Tyr residues を 1 h / ^ ^ < 15 > N logo し, he を ユ ニ フ ォ ー ム 2 h / ^ ^ < 15 > N logo し た も の と, Ile/Leu/Val を 1 h / ^ ^ < 13 > C / ^ < 15 > N で ま た Phe/Tyr を 1 h / ^ ^ < 15 > N し, he を ユ ニ フ ォ ー ム 2 h / ^ ^ < 15 > N logo し た も の を made し た. こ の gimmick を with い る こ と に よ っ て シ グ ナ ル の オ ー バ ー ラ ッ プ が ease さ れ, speed や か に side chain シ グ ナ ル の 帰 を rows う こ と が で き た. さ ら に こ れ ら の sample に つ い て 観 measuring し た 3 d NOESYスペ スペ ト ト を を を parsing global fold を determines を lines った.