分子古生物学の新展開
分子古生物学新进展
基本信息
- 批准号:02354001
- 负责人:
- 金额:$ 0.9万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Co-operative Research (B)
- 财政年份:1990
- 资助国家:日本
- 起止时间:1990 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
(1)現存する全生物は3つの超生物界、すなわち真正細菌、古細菌、真核生物に分類されることが認められているが、3者の系統関係はいぜん不明であった。その理由は、分子の比較から系統樹を推定する際、大元にあたる祖先(系統樹の根)が決定出来なかったからである。我々は先に3者の分岐以前に遺伝子重複によって生じたことが明らかな重複遺伝子を使って複合系統樹を推定し、古細菌は真正細菌よりもむしろ真核生物に近縁であることを明らかにした。今年度は、その後に発表されたATPア-ゼα鎖とβ鎖及び伸長因子EFーTuとGの多くの配列に基づいて、上記の結果を確認した。さらに、古細菌はイオウ細菌、メタン生産菌、好塩菌に大きく分類されるが、この3系統と真核生物の系統を含む4つの系統がほぼ同時に分岐したことも明らかにした。この結果は真核生物の起源を考える上で、古細菌の研究が非常に重要であることを示唆する。(2)分子系統樹は本研究課題を進める上で理論的技術的基礎となる。従来種々の分子系統樹推定法が発表されているが、その中で最尤法が最も信頼性の高い方法とされてきた。しかしこの方法は塩基配列に対いてのみ適用可能であった。一方全生物の系統関係を問題にするような、非常に古い時代にまで辿るには塩基配列比較より、アミノ酸配列比較の方が適している。従って従来の最尤法をアミノ酸配列デ-タにも適用出来るように拡張することが急務であった。我々は、Dayhoffらによって決定されたアミノ酸間の置換頻度を利用することでこの問題を解決した。さらにこの方法を上記の古細菌の進化の問題に適用した。(3)およそ5000年前に生存していたと考えられる縄文人の人骨からミトコンドリアDNAの一部を単離し、PCR法によってその塩基配列を決定することに成功した。
(1)All living organisms are classified into three groups: superorganisms, true bacteria, archaea, and eukaryotes, and their systematic relationships are unknown. The reason for this is that the molecular comparison of the phylogenetic tree is inferred, and the ancestor (root of the phylogenetic tree) is determined The first three species of bacteria were identified by the phylogenetic tree, and the last three species were identified by the phylogenetic tree. This year, the results of ATP-α lock-β lock and elongation factor EF-Tu-G are confirmed. In addition, archaea, bacteria, producer bacteria, and good bacteria are classified into three systems: eukaryotes, eukaryotes, and eukaryotes. The results show that the origin of eukaryotes and archaea are very important. (2)Molecular phylogenetic tree is the basis of theoretical technology. The molecular phylogenetic tree method of the future species is the most reliable method for the development of the species. This method is based on the allocation of resources, and it is possible to apply them. The systematic relationship between a whole organism and a whole organism is a problem in ancient times. The most important thing is that you can use it to make it happen. The problem is solved by determining the frequency of substitution between acids. This method is applicable to the problem of evolution of archaea. (3)A part of DNA was isolated from human bones 5000 years ago, and PCR was successfully used to determine the sequence of DNA.
项目成果
期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Iwabe,N.: "Evolution of RNA polymerases and branching patterns of the three major groups of archaebacteria." J.Mol.Evol.32. 70-78 (1991)
Iwabe,N.:“RNA 聚合酶的进化和三大古细菌的分支模式。”
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Mukohata,Y.: "Close evolutionary relatedness of archaebacteria with eukarytes" Proc.Japan Acad.66B. 63-67 (1990)
Mukohata,Y.:“古细菌与真核生物的密切进化相关性”Proc.Japan Acad.66B。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Iwabe,N.: "Compartmentalized isozyme genes and the origin of introns" J.Mol.Evol.31. 205-210 (1990)
Iwabe,N.:“区室化同工酶基因和内含子的起源”J.Mol.Evol.31。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kishino,H.: "Maximum likelihood inference of protein phylogeny,and the origin of chloroplasts" J.Mol.Evol.31. 151-160 (1990)
Kishino, H.:“蛋白质系统发育的最大似然推断和叶绿体的起源”J.Mol.Evol.31。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kuma,K.: "Gene families and evolution:Immunoglobulin family" Current Opinion in Structural Biology. 1/3.
Kuma,K.:“基因家族和进化:免疫球蛋白家族”结构生物学的当前观点。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
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$ 0.9万 - 项目类别:
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$ 0.9万 - 项目类别:
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