gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIV感染メカニズムの解明

gp120的X射线晶体结构分析及基于其三维结构阐明HIV感染机制

• 批准号: 10180210
• 负责人: 千田 俊哉
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Nagaoka University of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10180210/
• 关键词: HIV; gp-120; SDF-1; 立体構造; X線結晶構造解析

SDF-1は、HIVのco-receptorであるCXCR4の本来のリガンドであるため、その立体構造情報は、抗HIV薬の開発に重要な意味を持つ。そこで、本研究では、SDF-1のX線結晶構造解析を行った。1. 結晶構造解析SDF-1の結晶化は、通常の蒸気拡散法で行った。その結果、空間群P2_12_12_1結晶を得ることができた。得られた結晶には、格子定数の良く似た2つの結晶形があることがわかった(Form A,B)。回折像の解析の結果、Forom Aの方が、高分解能の回折像を与えることから、こちらの構造解析を行った。構造解析は、分子置換法で行った。結晶学的精密化の結果、2.0Å分解能でR-factor=18.9%の構造を得ることができた。我々の結果と、他グループのSDF-1の解析結果を比較したところ、我々の解析の方が精度の高いものであることが明らかになった。更に、他グループの解析には誤りが含まれていることがわかった。その意味で、我々の提出した立体構造がはじめての精密な構造といえる。得られた結晶構造は、2量体であった。2量体を形成しているサブユニットの構造はお互いに少しずつ異なっており、SDF-1分子の柔軟性を示唆している。2. 受容体結合部位の探索これまで行われてきた変異体を用いた活性部位探索の実験結果と今回明らかとなった立体構造を比較することで、受容体結合部位(N末端の12残基)を同定することができた。この仮説は、現在までに行われた変異体の実験結果を矛盾無く説明することができる。

SDF-1, HIV co-receptor anti-HIV, anti-HIV, anti- The results of this study and the X-ray analysis of SDF-1 were used to analyze the data. 1. The results show that the crystallization of SDF-1 is usually carried out by the method of steaming and dispersion. The result of the experiment and the result of the crystal of the empty group P2O12-12-1 show that the structure of the empty group P212-12-12-1 is very high. The results show that the lattice number is similar to that of the crystal shape of the crystal, and the lattice number is similar to that of the crystal shape of the crystal (Form A, B). The results of analysis, Forom A square, high resolution can be used to analyze the results of the analysis results, the analysis results, the The analytical method and molecular placement method are used to analyze and analyze. The precision results of crystallography and 2.0% decomposition can be used to improve the precision of Raff factor analysis by 18.9%. We compare the results, the results of SDF-1 analysis and the accuracy of SDF-1 analysis. Please tell me that there is an error in the analysis of the error. It means that we put forward the idea of three-dimensional construction, precision and precision. You can get the results of the test, and you can measure the weight by 2. (2) to measure the size of each other, the flexibility of SDF-1 molecules and the flexibility of each other. two。 Explore the binding site of the receptor and explore the active site of the receptor. The results show that the receptor binding site (N-terminal 12 residue) is the same as the receptor binding site (N-terminal 12 residue). Please tell me that there is a contradiction between the results of the current situation and the result of the conflict.