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結晶構造解析によるノンヘム鉄を含む2原子酸素添加酵素LigABの反応機構解析

通过晶体结构分析含非血红素铁的双原子加氧酶LigAB的反应机理

基本信息

批准号：
11780425
负责人：
千田俊哉
金额：
$ 1.41万
依托单位：
Nagaoka University of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2000
项目状态：
已结题

项目摘要

1.LigABの高分解能構造と変異体を用いた構造活性相関研究現在までに得られているLigABの構造は、2.2Å分解能であり、詳細な構造を議論するためには不十分である。そこで、分解能を改善して詳細な原子レベルでの立体構造を決定する為に、回折データ測定の条件を検討し直した。LigABの回折データ測定は、この結晶の空間群の関係から非常に長い時間がかかる。そこで、出来るだけ結晶のX線に対するダメージを減らすために、100Kでの測定を行うこととし、その条件を検討した。その結果、放射光と100Kでの低温測定を併用することで、1.3Å分解能でのデータ測定に成功した。現在、1.3Å分解能において結晶構造の精密化を進めている。2.変異体を用いた構造活性相関研究LigABの触媒反応機構を探るため、活性中心付の残基に関して10種類以上の変異体を作成し、LigABの立体構造と機能の相関を解析した。その結果、以前から我々が主張していたように、LigABの触媒反応にはHis195が必須で、この残基は触媒塩基であることが強く示唆された。これは、LigABの触媒反応が、Class IIのextradiol型dioxygenaseであるBphCと本質的には同じ機構で反応が進むことを強く示唆するものである。また、基質の結合には、疎水的な相互作用よりも、基質のカルボン酸と蛋白質の間に形成される水素結合が重要であることを示唆する結果も得られた。3.活性型LigAB結晶の作成の試み精製後のLigABは、活性中心のノンヘム鉄(II)の酸化によりかなり活性が下がってしまっている。活性型の結晶構造を得るためには、活性化の減少したLigABを再活性化する技術が不可欠であるため、このこの技術の確立を行った。その結果、昨年度作成した無酸素チャンバー内において、LigABとFe(II)溶液を混合することで活性型LigABを得ることに成功した。現在、無酸素条件下で活性型LigABの結晶化条件の探索を行っている。

The high decomposition energy of 1.LigAB has been studied in terms of the activity phase of the system. Now, the decomposition energy of LigAB is very high. The temperature and decomposition can improve the temperature of the atom. The determination of the temperature is determined, and the determination condition of the temperature is determined. LigAB test results show that the air-to-air group test is very stable for a very long time. The results show that the temperature is low, the temperature is low. The results showed that the temperature was measured successfully by photoluminescence (100K) and decomposition energy (1.3). At present, 1.3 μ m decomposition can improve the precision of the crystal structure. two。 The reaction mechanism of LigAB catalyst was used to study the activity phase of maleic acid. the active center was used to make more than 10 kinds of carbon monomers, and the stereo reaction mechanism of LigAB was used to analyze the phase. According to the results of the test, the previous test results showed that we were responsible for the response of the LigAB catalyst to the His195, and that the residue of the catalyst was not required. The counterpart agencies of this company, such as anti-dioxygenase, LigAB catalyst and Class II anti-BphC, have strongly indicated that they are instigated to do so. It is important to show the results of the combination of water and water, the interaction between water and water, the interaction between water and water, the binding of water and water, the interaction of water and water, the interaction of water and protein, the formation of protein, the combination of water and water. 3. After the active LigAB crystal was formed, the LigAB was purified, and the active center was acidified and the active center was acidified. The results of the active test results, the activation of the LigAB and the re-activation of the technology must be improved, and the operation of the technology must be established. According to the results of the experiment, the results showed that the mixture of LigAB Fe (II) solution and LigAB Fe (II) solution was successful. At present, under the acid-free condition, the crystallization conditions of active LigAB are explored.