gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIVの感染メカニズムの解明
gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIVの感染メカニズムの解明
批准号:
11161213
负责人:
千田 俊哉
金额:
$0.96万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 --
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1)gp120現在までにセンダイウイルスの発現系を使用して発現させたgp120およびgp140(gp120とgp41にプロセスされる前の状態の蛋白質)を用いて結晶化を進めてきてた。その結果微小ではあるがgp120の結晶らしきものを得た。高エネルギー加速器研究機構の放射光実験施設でこの微小な結晶を用いて、回折実験を行ったが、回折パターンを得ることはできなかった。そこで、現在までのアプローチに加え、gp120とgp41の相互作用部位に焦点をあてて、この両者の相互作用を見るために、gp41とgp120のN末端約100残基程度からなる融合蛋白質(gp41-N(gp120))を発現させて、これを構造解析する試みも開始した。現在は、大腸菌を用いてのgp41-N(gp120)の大量発現系の構築を行っている。2)SDF-1αSDF-1αの結晶としては、現在のところ3種類のものが得られている。そのうちの2つに関して立体構造解析を完了した(論文投稿中)。得られた構造から、SDFは、結晶中では2量体を形成していること、ループ部分の運動性が高いことなどが明らかになった。また、温度因子の比較から、高分解能の回折点を与えない結晶では、結晶中の分子間相互作用に関与するアミノ酸の温度因子が極めて高いことを見出した。反対に、高分解能の回折点を与える結晶では、これらの残基は、原子全体の平均の温度因子より低い温度因子を持っていることが明らかになった。これらの知見は、変異体を利用した良質の結晶作成に応用可能であると考えられる。
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Sugimoto, K.: "Crystal structure of an aromatic-ring opening dioxygenase LigAB, a protocatechuate 4,5-dioxygenase, in aerobic condition"Structure Fold Des.. 7. 953-965 (1999)
Sugimoto, K.:“有氧条件下芳香环开双加氧酶 LigAB(一种原儿茶酸 4,5-双加氧酶)的晶体结构”结构折叠设计.. 7. 953-965 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sugimoto K.: "Purification and Crystallization of a Catechol 2,3-Dioxygenase PheB from Bacillus stearothermophilus BR219"Protein and Peptide Lett.. 6. 403-406 (1999)
Sugimoto K.:“来自嗜热脂肪芽孢杆菌 BR219 的儿茶酚 2,3-双加氧酶 PheB 的纯化和结晶”蛋白质和肽快报.. 6. 403-406 (1999)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Ohtsubo Y.: "PcpA, which is involved in the degradation of pentachlorophenol in Sphingomonas chlorophenolica ATCC39723, is a novel type of ring-cleavage dioxygenase"FEBS Letters. 459. 395-398 (1999)
Ohtsubo Y.:“PcpA 参与氯酚鞘氨醇单胞菌 ATCC39723 中五氯苯酚的降解,是一种新型的环裂解双加氧酶”FEBS Letters。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sugimoto, K.: "Purification and crystallization of a protocatechuate 4,5-dioxygenase LigAB from Sphinggomonas pausimobilis SYK-6"Protein and Peptide Lett.. 6. 55-58 (1999)
Sugimoto, K.:“来自 Sphinggomonas pausimobilis SYK-6 的原儿茶酸 4,5-双加氧酶 LigAB 的纯化和结晶”Protein and Peptide Lett.. 6. 55-58 (1999)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
LysR型転写制御因子CbnRの4次構造変化メカニズムの構造学的解明
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批准号:23K23827
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2024
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
Mechanistic study of quaternary structure changes of a LysR- type transcriptional regulator
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批准号:22H02563
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.82万
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财政年份:2022
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
物理化学的解析に適した高分子量型クロマチン因子群の大量発現系の開発
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批准号:21657030
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2009
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
HIRAーヒストン複合体の立体構造解析に基づいたヌクレオソーム構造変換機構の解明
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批准号:20051031
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2008
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
無酸素条件下における新規結晶化法の開発
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批准号:18657036
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2006
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
2原子酸素添加酵素の反応中間体結晶構造に基づいた触媒反応機構解析
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批准号:15770077
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2003
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIV感染メカニズムの解明
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批准号:12035207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:2000
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
結晶構造解析によるノンヘム鉄を含む2原子酸素添加酵素LigABの反応機構解析
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批准号:11780425
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIV感染メカニズムの解明
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批准号:10180210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.79万
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财政年份:1998
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
放線菌の細胞間情報伝達物質A-factorの受容体のX線結晶構造解析
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批准号:09780543
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
立体構造に基づいた2原子酸素添加酵素の反応機構の解明
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批准号:08780556
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
ヒト大腸癌におけるIa抗原,DNAおよびリンパ球サブセットの検討
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批准号:04770905
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:千田 俊哉
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依托单位:
海外基金