ミトコンドリア行きターゲティングシグナル受容体による分子認識機構の解析

线粒体靶向信号受体分子识别机制分析

• 批准号: 12019226
• 负责人: 遠藤 斗志也
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12019226/
• 关键词: ミトコンドリア; タンパク質輸送; プレシークエンス; Tom20; ターゲティングシグナル; NMR

近年,分子シャペロンによる基質認識やタンパク質のターゲティングシグナルの認識など,ブロードな基質スペクトルに特徴づけられる「あいまいな分子認識」の重要性が注目されている。本研究ではあいまいな認識の例として,ミトコンドリアタンパク質のプレシークエンスに書き込まれたミトコンドリアターゲティングシグナルを認識する受容体Tom20をとりあげた。様々な^<15>N標識した様々なプレ配列ペプチドについて,Tom20のサイトゾルドメイン(ΔTom20)を加えていったときにNMRシグナルが影響を受ける部位を調べることにより, 「Tom20結合セグメント」を同定した。またスピンラベルしたペプチドを用いて,ΔTom20結合時のプレ配列の配向も調べた。そして,プレ配列中のΔDTom20結合セグメントの位置はプレ配列によって異なる(フレキシブルである)が,ΔTom20結合時の配向は一定であることを見いだした。ΔTom20結合セグメントは,ΔTom20との結合によりNMRシグナルが影響を受ける残基であり,直接ΔTom20との結合に関わるのはその一部と考えられる。実際ΔTom20との複合体の立体構造を決定したALDHのプレ配列においてΔTom20との結合に直接関わるセグメントは,5残基である。ΔTom20との結合に直接関わるセグメントをΔTom20認識エレメントと呼ぶことにする。ALDH以外のプレ配列中のΔTom20認識エレメントを推測するために,各プレ配列中のΔTom20結合セグメントに共通するモチーフ,具体的にはAKDHのΔTom20認識エレメントと共通するモチーフを検索した。その結果,各プレ配列ペプチドにφχχφφというパターンが見いだされた。ただし,φは疎水性/芳香族残基(Leu,Met,Trp,Cys,Ala,Tyr,Phe,Ile),χは任意のアミノ酸残基である。

In recent years, the importance of molecular understanding has been highlighted. In this study, we found that there was a significant difference between the two groups. In <15>addition to the above, the Tom20 and the Tom 20 can be identified as "Tom 20 and Tom 20 can be identified as" Tom20 and Tom20 ". The alignment of the column when combined with ΔTom20 is adjusted. However, the position of the ΔDTom20 in the layout when combined with the equipment is different from that in the layout. The orientation of the Δ DTom 20 when combined is certain.ΔTom20 binding is related to NMR,ΔTom 20 binding is related to NMR. In fact, the stereo structure of ΔTom 20 complex is determined by the alignment of ALDH and ΔTom20. The combination of ΔTom 20 and The ΔTom20 recognition in the list of positions other than ALDH is estimated to be common to the ΔTom20 in each list of positions. Specifically, the ΔTom 20 recognition in AKDH is common to the ΔTom20 recognition. As a result, each of the columns was assigned to the right column.ただし,φは疎水性/芳香族残基(Leu,Met,Trp,Cys,Ala,Tyr,Phe,Ile),χは任意のアミノ酸残基である。

项目成果

遠藤斗志也(分担執筆,編者): "タンパク質の一生〜タンパク質の誕生,成熟から死まで(中野明彦,遠藤斗志也 編)"プロテイントラフィックの第一歩〜生まれたタンパク質は,どこに,どうやって行けばよいのか. 62-74 (2000)

Toshiya Endo（合著者、主编）：《蛋白质的生命——从蛋白质的诞生，从成熟到死亡（中野明彦、远藤俊也主编）》蛋白质流通的第一步——在哪里、如何诞生蛋白质好吗？ 62-74 (2000)

T.Muto et al.: "NMR identification of the Tom20 binding element in mitochondrial presequences."J.Mol.Biol.. (in press). (2001)

T.Muto 等人：“线粒体前序列中 Tom20 结合元件的 NMR 鉴定。”J.Mol.Biol..（出版中）。

K.Nakatsukasa et al.: "Mnllp, an α-mannosidase-like protein in yeast Saccharomyces cerevisiae, is requnred for endoplasmic reticulum-associated degradation of glycoproteins."J.Blol.Chem.(Communication). (in press). (2001)

K. Nakatsukasa 等人：“Mnllp 是酿酒酵母中的一种 α-甘露糖苷酶样蛋白，是内质网相关糖蛋白降解所必需的。”J.Blol.Chem.（通讯），2001 年。 ）

Y.Abe et al.: "Structural basis of presequence recognition by the mitochondrial protein import receptor Tom20."Cell. 100. 551-560 (2000)

Y.Abe 等人：“线粒体蛋白输入受体 Tom20 识别前序列的结构基础。”细胞。

K.Saeki et al.: "Identification of mammalian Tom22 as a subunit of the preprotein translocase of the mitochondrial outer membrane."J.Biol.Chem.. 275. 31996-32002 (2000)

K.Saeki 等人：“鉴定哺乳动物 Tom22 作为线粒体外膜前蛋白易位酶的亚基。”J.Biol.Chem.. 275. 31996-32002 (2000)