课题基金 / 基金详情

高分子量蛋白質複合体の溶液構造決定法の開発

高分子量蛋白質複合体の溶液構造決定法の開発
高分子量蛋白质复合物溶液结构测定方法的开发
批准号：
13014221
负责人：
伊藤 隆
金额：
$1.15万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2001 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13014221/
关键词：
高分子量蛋白質NMR高次構造解析選択的プロトン標識シキミ酸蛋白質異種複合体

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
平成13年度の研究実績は以下の通りである.酵母YUHlとUbの相互作用の系については,35kDaの共有結合複合体試料について大まかな高次構造を決定するために,選択的プロトン標識試料を作成し解析を行った.IleのHD1#,LeuのHD#,ValのHG#の標識にはKayらによって提案された方法を用いた.高分子量蛋白質の大まかな構造の決定には,メチルプロトンの他に芳香族アミノ酸の側鎖プロトンからの距離情報が重要であることが知られている.今回は新たな試みとして,Phe,Tyr,Trpの共通の前駆体であるシキミ酸を用いた結果,α位β位(Trpの場合はさらに側鎖5員環)を重水素化しつつ,側鎖6員環部のみプロトン標識することに成功した.現在YUHl-Ub複合体について選択的プロトン標識試料から得られる少数のNOE情報と残余双極子カップリング情報を用いた効率的な構造解析法の確立を進めている.NMRを用いた蛋白質異種複合体の高次構造解析の際には,一方を安定同位体標識し,^<13>C/^<15>N選択/除去フィルターを組み込んだ測定を行うことで,分子内/分子間の距離情報の選別を行うのが普通である.今回は^<13>C/^<15>N標識された1種類の蛋白質複合体試料を用い,「それぞれの蛋白質の単体での高次構造と結合インターフェイスの情報から効率よく分子内/分子間の距離情報の選別を行い,半自動的に高次構造解析を行うシステム」の構築を試みた.テスト試料として用いた110残基と84残基の複合体試料の場合,まったく分子間NOEの帰属がない状態からスタートして,主鎖RMSDが0.7Å程度まで構造を収束させることに成功した.現在他の複合体の系において,このシステムの効率と安全性の検証を行っている.
英文摘要
平成13年度の研究実績は以下の通りである.酵母YUHlとUbの相互作用の系については,35kDaの共有結合複合体試料について大まかな高次構造を決定するために,選択的プロトン標識試料を作成し解析を行った.IleのHD1#,LeuのHD#,ValのHG#の標識にはKayらによって提案された方法を用いた.高分子量蛋白質の大まかな構造の決定には,メチルプロトンの他に芳香族アミノ酸の側鎖プロトンからの距離情報が重要であることが知られている.今回は新たな試みとして,Phe,Tyr,Trpの共通の前駆体であるシキミ酸を用いた結果,α位β位(Trpの場合はさらに側鎖5員環)を重水素化しつつ,側鎖6員環部のみプロトン標識することに成功した.現在YUHl-Ub複合体について選択的プロトン標識試料から得られる少数のNOE情報と残余双極子カップリング情報を用いた効率的な構造解析法の確立を進めている.NMRを用いた蛋白質異種複合体の高次構造解析の際には,一方を安定同位体標識し,^<13>C/^<15>N選択/除去フィルターを組み込んだ測定を行うことで,分子内/分子間の距離情報の選別を行うのが普通である.今回は^<13>C/^<15>N標識された1種類の蛋白質複合体試料を用い,「それぞれの蛋白質の単体での高次構造と結合インターフェイスの情報から効率よく分子内/分子間の距離情報の選別を行い,半自動的に高次構造解析を行うシステム」の構築を試みた.テスト試料として用いた110残基と84残基の複合体試料の場合,まったく分子間NOEの帰属がない状態からスタートして,主鎖RMSDが0.7Å程度まで構造を収束させることに成功した.現在他の複合体の系において,このシステムの効率と安全性の検証を行っている.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
伊藤 隆: "効率的で迅速なNMRタンパク質構造解析法の模索"実験医学. 19. 954-957 (2001)
Takashi Ito：“寻找高效快速的 NMR 蛋白质结构分析方法”实验医学 19. 954-957 (2001)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Tohru Terada: "Solution structure of the human parvulin-like peptidyl prolyl cis/trans isomerase, hPar14"Journal of Molecular Biology. 305. 917-926 (2001)
Tohru Terada：“人小鸟蛋白样肽基脯氨酰顺/反异构酶的溶液结构，hPar14”分子生物学杂志。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
金属の溶解析出反応を制御する有機物添加剤の超高感度ラマン分光学解析
  • 批准号：
    23K23441
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $2.66万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tohoku University
In situ SERS spectroscopy for organic additives with controlling metal deposition
  • 批准号：
    22H02173
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.32万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tohoku University
In-situ structural biology by NMR spectroscopy
  • 批准号：
    21H02419
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.23万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tokyo Metropolitan University
解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発
  • 批准号：
    22510237
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $2.33万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    伊藤 隆
  • 依托单位：
    Tokyo Metropolitan University
国内基金
海外基金
基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
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NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
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  • 批准号：
    22577099
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    50.00万元
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    谢华勇
  • 依托单位：
    武汉科技大学