使用Biobje模拟基因表达控制机制-猫眼课题宝

使用Biobje模拟基因表达控制机制

批准号：

13208005

负责人：

萩原正敏

金额：

$4.16万

依托单位：

Tokyo Medical and Dental University

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)

财政年份：

2001

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2001 至 --

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13208005/

关键词：

シミュレーション工学生体生命情報学バーチャルリアリティ発現制御

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英文摘要

本年度はBiobjeシミュレ-タ-をDrosophilaの概日周期の系に適応し、光に対しての感受性についての〓な研究を行い、シミュレーターの応用へのめどをつけるべく研究を計画した。具体的には、1)理論上、またグラム上の問題がないか、様々な条件の元で検証を行う;2)Drosophilaの概日周期の系に関しての遺伝子の理論実験を行う;3)光による周期のシフトのメカニズムを理論的に探る、などの研究を遂行した。その〓Biobjeシミュレーションにおいての、その方法、アルゴリズムの開発、検証については、完了した。そして、〓用を容易にする為の、条件ファイルの設置、結果ファイルのCSV化(Microsoft Ex. cel対応)も行った。当〓「光による周期のシフトのメカニズム」に注目した「理論実験」を、Biobjeシミュレーターを用いて行う予定で〓が、その前段階として試験的に行った、「機能分子の特性が周期に及ぼす影響」を見る理論実験の結果〓常に興味深く、また、その後行う予定であった「光による周期のシフトのメカニズム」に関わる理論実験に必要〓くの情報が得られる為、こちらを優先して先に行った。そして、その結果をまとめ、複数の学界にて発表した〓究のシミュレーターは、既存の細胞レベルでのシミュレーターとは大きく違った、理論のもとで作成された為、より生物学者にとって理解し易いタイプのシミュレーターとなっている。国内、国外においても、様々な〓の細胞レベルでのシミュレーターが開発されているが、その点において、本研究は注目されており、国内及〓外で特許の対象としての高い評価を得ている。

期刊论文(5)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

Osada, M., Inaba, R., Shinohara, H., Hagiwara, M., Nakamura, M., Ikawa, Y: "Regulatory Domain of Protein Stability of Human P51/TAP63, a P53 Homologue"Biochem. & Biophys.Res.Comm.. 283. 1135-1141 (2001)

Osada, M.、Inaba, R.、Shinohara, H.、Hagiwara, M.、Nakamura, M.、Ikawa, Y：“人 P51/TAP63（P53 同源物）蛋白质稳定性的调节域”Biochem。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Ueda, H.R., Hagiwara, M., Kitano, H.: "Robust oscillations within the interlocked feedback model of Drosophila circadian rhythm"J.Theoret.Biol.. 210. 401-406 (2001)

Ueda, H.R.、Hagiwara, M.、Kitano, H.：“果蝇昼夜节律连锁反馈模型中的稳健振荡”J.Theoret.Biol.. 210. 401-406 (2001)

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Kamimoto, T., Zama, T., Aoki, R., M11.研究発表(発表予定を含む。但し、投稿中、投稿準備中を除く。)uro, Y., Hagiwara, M.: "Identification of a novel kinesin-related protein, KRMP1, as a target for mitotic peptidyl-prolyl isomerase Pin1"J.Biol.Chem.. 276. 37520-37528 (2001)

Kamimoto，T.，Zama，T.，Aoki，R.，M11。研究演示（包括演示时间表，但不包括提交和提交准备）uro，Y.，Hagiwara，M.：“一种新型驱动蛋白相关的鉴定蛋白质，KRMP1，作为有丝分裂肽基-脯氨酰异构酶 Pin1 的靶标”J.Biol.Chem.. 276. 37520-37528 (2001)

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Kojima, T., Zama, T., Wada, K., Onogi, H., Hagiwara, M.: "Cloning of Human PRP4 Reveals Interaction with Clk1"J.Biol.Chem.. 276. 32247-32256 (2001)

Kojima, T.、Zama, T.、Wada, K.、Onogi, H.、Hagiwara, M.：“克隆人 PRP4 揭示与 Clk1 的相互作用”J.Biol.Chem.. 276. 32247-32256 (2001)

DOI： --

发表时间：

期刊：