光誘起電子移動に基づく蛍光性化学センサーの開発と分析チップへの応用
光誘起電子移動に基づく蛍光性化学センサーの開発と分析チップへの応用
批准号:
03F03280
负责人:
寺前 紀夫
金额:
$1.02万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2005
中文摘要
分子認識に関して生体内の仕組みをモチーフにして、小分子に対する高い認識能を達成するため、分子量の小さなDNAやRNAを認識試薬、つまりアプタマーとして利用する研究が最近注目を集めている。高い親和性と特異性を達成するために小分子との結合に伴う核酸の高次構造変化が利用されており、進化工学の手法を取り入れて人為的に作り出すことが行われている。本研究では相補的なオリゴDNA二重鎖中に脱塩基部位を設け、この脱塩基部位に対向する塩基を認識部位として疎水的な脱塩基空間において分子認識を達成するという、新たなアプタマーの構築を研究の目的とした。標的分子としては、リボフラビン、フラビンモノヌクレオチド(FMN)、フラビンジヌクレオチドの3種を選び、核酸分子として、5' -TCCAGXGCAAC-3'(X=specer-C3)/3'-AGGTCYGGTTG-5'(Y=G, A, C, or T)を含むDNA二重鎖で、長さが11merのものを検討し,さらにY=T, Cについて23-mer, Y=Tについて4-1merと51-merのものについて検討した。11-merのアプタマーと標的分子、リボフラビンとの相互作用をDNA融解温度で評価したところ脱塩基部位に対向する塩基がチミンのときに融解温度が最も向上した。また、熱量滴定によりリボフラビンと各種アプタマーとの錯生成定数や熱力学的パラメータを計測した結果、23-merで対向する塩基がチミンのときに最も大きな錯生成定数が得られ、その値はおよそ50万であった。この結合能は従来報告されているRNAアプタマーに匹敵するものである。本研究で開発した新たなアプタマーはリボフラビンの定量や分離に利用できる特徴を持つものである。
英文摘要
分子認識に関して生体内の仕組みをモチーフにして、小分子に対する高い認識能を達成するため、分子量の小さなDNAやRNAを認識試薬、つまりアプタマーとして利用する研究が最近注目を集めている。高い親和性と特異性を達成するために小分子との結合に伴う核酸の高次構造変化が利用されており、進化工学の手法を取り入れて人為的に作り出すことが行われている。本研究では相補的なオリゴDNA二重鎖中に脱塩基部位を設け、この脱塩基部位に対向する塩基を認識部位として疎水的な脱塩基空間において分子認識を達成するという、新たなアプタマーの構築を研究の目的とした。標的分子としては、リボフラビン、フラビンモノヌクレオチド(FMN)、フラビンジヌクレオチドの3種を選び、核酸分子として、5' -TCCAGXGCAAC-3'(X=specer-C3)/3'-AGGTCYGGTTG-5'(Y=G, A, C, or T)を含むDNA二重鎖で、長さが11merのものを検討し,さらにY=T, Cについて23-mer, Y=Tについて4-1merと51-merのものについて検討した。11-merのアプタマーと標的分子、リボフラビンとの相互作用をDNA融解温度で評価したところ脱塩基部位に対向する塩基がチミンのときに融解温度が最も向上した。また、熱量滴定によりリボフラビンと各種アプタマーとの錯生成定数や熱力学的パラメータを計測した結果、23-merで対向する塩基がチミンのときに最も大きな錯生成定数が得られ、その値はおよそ50万であった。この結合能は従来報告されているRNAアプタマーに匹敵するものである。本研究で開発した新たなアプタマーはリボフラビンの定量や分離に利用できる特徴を持つものである。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Abasic Sites-Containing Oligodeoxynucleotides as Aptamers for Riboflavin
含有脱碱基位点的寡脱氧核苷酸作为核黄素适体
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Angew.Chem.Int.Ed 45
影响因子:
--
作者:
[N.B. Sankaran, Seiichi Nishizawa, Takehiro Seino, Keitaro Yoshimoto, Norio Teramae]
通讯作者:
Norio Teramae
Design of ratiometric fluorescent sensors for alkali metal ions from simple PET sensors by control of spacer length
通过控制间隔长度从简单 PET 传感器设计碱金属离子比率荧光传感器
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Material.Chemistry 15(印刷中)
影响因子:
--
作者:
[N.B.Sankaran, et al.]
通讯作者:
et al.
RNA非翻訳領域を標的とする核酸検出リガンドの創製と機能性RNA研究への応用
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批准号:22245010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$10.48万
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财政年份:2010
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
アプタマー含有メソポーラス材料を用いたバイオセンサーの開発
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批准号:10F00342
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2010
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
生理活性物質の高選択的高感度検出用電気化学バイオセンサーの開発
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批准号:07F07057
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2007
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
脱塩基オリゴDNAを用いた表面プラズモン共鳴による一塩基多型検出
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批准号:06F06075
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2006
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
原始地球環境を模擬した水熱条件下でのRNA合成について
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批准号:06F06168
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2006
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
オリゴDNA修飾マイクロ電極を用いた新規バイオセンサーの開発
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批准号:06F06344
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2006
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
グアノシン高次会合構造の形成制御とバイオ分析への応用
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批准号:17655029
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2005
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
脱塩基オリゴDNAを用いた一塩基置換のSPR検出
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批准号:05F05393
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2005
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
ナノ細孔メンブランの機能化と化学センシングへの応用
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批准号:05F05126
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2005
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
脱塩基部位形成に基づく一塩基決損の蛍光検出法の開発と応用
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批准号:04F04391
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
界面ナノ反応場の特性を利用した金属ナノ粒子の合成とそのバイオセンサーへの応用
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批准号:04F04392
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
金ナノ粒子と有機分子の集積化とその化学センサーへの応用
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批准号:15655021
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
光誘起電子移動に基づく蛍光性化学センサーの開発と分析チップへの応用
-
批准号:03F00280
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.51万
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财政年份:2003
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
液液界面の特異性を用いる分子認識とSHG分光法による認識機能解析
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批准号:13129201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$27.39万
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财政年份:2001
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
一次元ナノ細孔体を用いた生体関連イオン・分子の一斉分析システムの開発
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批准号:12874093
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
ナノポアを有するシリカ多孔体を用いた分析反応場の設計と応用
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批准号:10874108
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
電気活性人工アニオンレセプターを利用したリン酸イオンセンサーの開発
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批准号:09237211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1997
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
レーザー誘起電解反応の解析と電極反応制御
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批准号:07215208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1995
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
導電性高分子の電解重合プロセスのin-situ計測と反応機構解析
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批准号:06226210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1994
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位:
FT-ラマン合光法による電解重合プロセスのin-situ計測と材料解析
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批准号:04650678
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1992
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负责人:寺前 紀夫
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依托单位: