Crohn病およびインフルエンザ脳症の発症に関わる遺伝的要因の相関解析

克罗恩病与流感脑病发病遗传因素的相关性分析

• 批准号: 03J52211
• 负责人: 山崎 慶子
• 金额: $ 1.09万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J52211/
• 关键词: クローン病; インフルエンザ脳症; SNP(一塩基多型); 遺伝学; 炎症性腸疾患; SNP

クローン病(Crohn's Disease ; CD)は主に小腸や大腸に縦走潰瘍や非乾酪性類上皮細胞肉芽腫などの特徴的な病変を呈する炎症性腸疾患である。その発症には遺伝的関与が疑われているが、不明なところが多い。欧米人集団で強い相関が示唆されているCARD15の3種類の変異(1007insC, R702W, G908R)は日本人集団には存在しないことが知られている。近年、新たなCD関連遺伝子としてSLC22A4、SLC22A5、DLG5が報告された。我々は日本人CD患者484名について追試を行ったが報告よりも弱い相関しか認められず、相関の有無を確定するには至らなかった(J Hum Genet. 2004;49(12):664-668にて報告)。今までの研究が主に欧米で行われていることから、日本人CDの発症は欧米人とは異なった遺伝子が関係していると考えられた。そこで我々はSNP(single nucleotide polymorphism)を用いたwhole-genome相関解析を行った。スクリーニングの結果より、非常に強い相関(p=1.71×10^<-14>)を示すSNPを含む新たなCD関連遺伝子を同定した。この結果を確認するため、西欧白人集団に対し同遺伝子上の強い相関を示した12SNPsを用いて解析を行った。その結果、西欧人集団で多型を確認できたのはこれら12SNPsのうち5SNPsであった。多型を示した5SNPsの解析より、日本人集団、欧米人集団に共通な感受性、非感受性ハプロタイプが同定された。

Crohn's Disease (CD) is a disease characterized by inflammatory bowel disease mainly in the small intestine, large intestine, and large intestine. The relationship between the disease and the problem is unknown. The European Group has strong correlation with CARD15 and three different species (1007insC, R702W, G908R), while the Japanese Group has strong correlation with CARD 15. In recent years, new CD-related information has been reported on SLC22A4, SLC22A5 and DLG5. I have conducted a follow-up report on 484 Japanese CD patients and found that there is a weak correlation between them and whether they are relevant or not (J Hum Genet. 2004;49(12):664-668). The study of Japanese CD and the study of European CD and the relationship between Japanese CD and European CD SNPs (single nucleotide polymorphism) are used in whole-genome analysis. The results showed that the SNPs were strongly correlated (p=1.71×10^<-14>), and the CD-related genes were equally stable. These results confirm that the Western European Caucasian Population has strong correlations with the same population and that 12SNPs have been analyzed. The result is that Western European populations are polytypic. The analysis of 5SNPs in polytype shows that Japanese and European populations share the same sensitivity and non-sensitivity.

项目成果

Association analysis of SLC22A4, SLC22A5 and DLG5 in Japanese patients with Crohn disease

• DOI: 10.1007/s10038-004-0204-x
• 发表时间: 2004-10
• 期刊: Journal of Human Genetics
• 影响因子: 3.5
• 作者: K. Yamazaki;M. Takazoe;Torao Tanaka;T. Ichimori;S. Saito;A. Iida;Y. Onouchi;A. Hata;Yusuke Nakamura

K.Yamazaki: "Absence of mutation in the NOD2/CARD15 gene among 483 Japanese patients with Crohn's disease."J Hum Genet. 46. 469 (2002)

K.Yamazaki：“483 名日本克罗恩病患者的 NOD2/CARD15 基因不存在突变。”J Hum Genet。