Analysis of oxygen activation mechanism in the heme-containing dioxygenases

含血红素双加氧酶的氧活化机制分析

• 批准号: 19770094
• 负责人: SUGIMOTO Hiroshi
• 金额: $ 2.39万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19770094/
• 关键词: ヘムタンパク質; 共鳴ラマン分光; X線結晶学; トリプトファン; 構造生物学

2つのヘム含有二原子酸素添加酵素(IDO,TDO)の反応メカニズムを明らかにするために共鳴ラマン分光法によりIDOの反応中間体である酸素結合型の電子状態を明らかにした。また、IDO変異体の機能解析・X線結晶構造解析・共鳴ラマン分光解析により明らかにした活性中心のタンパク質残基の役割とDFT法による理論計算結果から、新しい反応スキームを提案した。さらに、TDOの協同的基質結合性とそのメカニズム明らかにした。

为了阐明两种含血红素的双重氧酶（IDO，TDO）的反应机理，氧键型的电子状态（这是IDO的反应中间体）通过resonance Raman光谱揭示。我们还提出了一种基于蛋白质残基在活性中心的作用的新反应方案，该方案通过功能分析，X射线晶体结构分析和共振拉曼光谱法以及使用DFT方法的理论计算结果揭示。此外，我们已经阐明了TDO及其机制的合作底物结合特性。

项目成果

共鳴ラマン分光法によるインドールアミン2,3ジオキシゲナーゼの解析

共振拉曼光谱分析吲哚胺 2,3 双加氧酶

• 发表时间: 2007
• 作者: 四ッ谷景子;杉本宏;大槻崇史;佐藤秀明;吉田匡;小倉尚志;城宜嗣
• 通讯作者: 城宜嗣

Synthesis and biological activity of 1-methyl-tryptophan-tirapazamine hybrids as hypoxia-targeting indoleamine 2,3-dioxygenase inhibitors.

• DOI: 10.1016/j.bmc.2008.07.087
• 发表时间: 2008-09
• 期刊: Bioorganic & medicinal chemistry
• 影响因子: 3.5
• 作者: H. Nakashima;Y. Uto;Eiji Nakata;H. Nagasawa;Kazuhiro Ikkyu;N. Hiraoka;K. Nakashima;Yuki Sasaki;H. Sugimoto;Y. Shiro;T. Hashimoto;Y. Okamoto;Y. Asakawa;H. Hori

RIKENリサーチハイライト「Missing piece gets a work over」

RIKEN 研究亮点“缺失的部分得到修复”

ヒト由来Tryptophan 2,3-dioxygenaseの分光学的解析

人源色氨酸 2,3-双加氧酶的光谱分析

• 发表时间: 2007
• 作者: 福村栄維子;杉本宏;永野真吾;瀧尾擴士;井柳尭;小倉尚志;城宜嗣
• 通讯作者: 城宜嗣

Cooperative binding of L-Trp to human tryptophan 2,3-dioxygenase : resonance Raman apectroscopic analysis

L-Trp 与人色氨酸 2,3-双加氧酶的协同结合：共振拉曼光谱分析

• 期刊: Journal of Biochemistry (印刷中)
• 作者: Eiko Fukumura;et al.
• 通讯作者: et al.