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真核生物におけるD型アミノ酸の機能と代謝

真核生物におけるD型アミノ酸の機能と代謝
D型氨基酸在真核生物中的功能和代谢
批准号:
08J07333
负责人:
伊藤 智和
金额:
$0.77万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009

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真核生物型D-セリンデヒドラターゼ(以後よりDsdSC)は、ビタミンB6の補酵素型であるピリドキサール5'リン酸とZn2+に依存して、D-セリンをピルビン酸とアンモニアに分解する。本酵素はZn2+に依存する唯一のPLP酵素であり、その機能を詳細に解析した。その結果DsdSCからの亜鉛の除去が酵素に微細な構造変化を引き起こすことが示唆された。また、1H-NMRを用い、D-セリンのCαプロトンの引き抜きと、その後に起こる予想されるヒドロキシル基脱離の両速度を分別測定した。Cαプロトンの引き抜き速度が、ヒドロキシル基の脱離速度とほぼ同等であること、Zn2+の除去により両活性がほぼ完全に失われることなどが明らかとなった。以上の結果等より、Zn2+はCα位のプロトンの引き抜きの後の、脱離基の脱離能を高める為に必要な構造の維持に寄与し、Cβ位のOH基とCαプロトンの脱離は協奏しているものと予想された。また、DsdSCのLys57がPLPとシッフ塩基を形成し、基質のCαプロトンの引き抜きに関与することが明らかとなった。さらに、Cys400のアラニン置換体がD-セリンとD-トレオニン等のヒドロキシル基を有する基質に対する活性を完全に失う一方、β-クロロ-D-アラニンに対する活性を維持することを見いだした。この変異体はZn2+除去酵素と同様の性質を示すことから、同残基がZn2+の結合残基である可能性が考えられた。また、われわれは以前、DsdSCを用いた簡便なD-セリン酵素定量法を開発し、同方法がヒト尿中D-セリン定量に適用可能であることを示した。今年度は、同方法を改良し、ピルビン酸オキシダーゼ、Amplex-Red、ペルオキシダーゼのカップリングアッセイにより、前述の酵素定量法の感度を既存法と比べ、その感度を約10倍改善する事に成功し、1μMのD-セリンを定量可能であることを示した。また、今回の改良アッセイ法を牛血清に適用し、血清中のD-セリンが良好に測定可能であることを確認した。
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会议论文
DOI: 10.1271/bbb.90558
发表时间: 2009-12-01
期刊: BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY
影响因子: 1.6
作者: [Ito, Tomokazu, Uozumi, Nobuyuki, Yoshimura, Tohru]
通讯作者: Yoshimura, Tohru
真核生物型D-セリンデヒドラターゼの触媒機構:亜鉛の機能と触媒残基の同定
真核D-丝氨酸脱水酶的催化机制:锌功能和催化残基的鉴定
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [伊藤智和, 邊児久, 吉村徹, 他]
通讯作者:
真核細胞型セリンラセマーゼの触媒機構
真核丝氨酸消旋酶的催化机制
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [前川元貴, 伊藤智和, 吉村徹, 他]
通讯作者:
細胞生粘菌セリンラセマーゼの触媒機構
粘菌丝氨酸消旋酶的催化机制
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [伊藤智和, 邊見久, 吉村徹, 他]
通讯作者:
10
    「修飾型」葉酸の生物分布と分子機能の解明
    • 批准号:
      24K08699
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $3.0万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      伊藤 智和
    • 依托单位:
    海外基金