Mechanisms of streptococcal infection investigated by whole genomic tiling array

全基因组平铺阵列研究链球菌感染机制

• 批准号: 20790111
• 负责人: MARUYAMA Fumito
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20790111/
• 关键词: 微生物・感染症学; タイリングアレイ; トランスクリプトーム; non-coding RNA; A群レンサ球菌; non- codingRNA; レンサ球菌

Genomic contents of group A streptococci is rich in A or T nucleotides. This causes problem in determination of transcription factors and/or prediction of open reading regions. Firstly, we have established the method to analyze the transcriptome of streptococcal cells inside host eukaryotic cells with cDNA microarray and tiling array. The data obtained from the arrays revealed the existence of 58 novel non-coding RNA and importance of unknown genes to combat with host immune system. These things suggests various pathogenicities of group A streptococci are resulted from these non-coding RNA and hypothetical genes.

A组链球菌的基因组内容物富含A或T核苷酸。这导致转录因子的确定和/或开放阅读区域的预测出现问题。首先，我们建立了用基因芯片和平铺芯片分析宿主真核细胞内链球菌细胞转录组的方法。从芯片获得的数据揭示了58个新的非编码RNA的存在和未知基因对对抗宿主免疫系统的重要性。这些结果表明，A组链球菌的各种致病性都是由这些非编码RNA和假想基因引起的。

项目成果

レンサ球菌属ゲノム情報に基づく種特異的進化機構の解析

基于链球菌基因组信息分析物种特异性进化机制

• 发表时间: 2010
• 作者: C.Aikawa;T.Nozawa;F.Maruama;K.Tsumoto;S.Hamada;I.Nakagawa;丸山史人
• 通讯作者: 丸山史人

芳香族化合物による土壌撹乱に対するバクテリア群集の環境応答のメタゲノム解析

细菌群落对芳香族化合物扰动土壤的环境响应的宏基因组分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 森宙史;加藤広海;堂園亜由美;大坪嘉行;宮腰昌利;丸山史人;豊田敦;藤山秋佐夫;永田裕二;黒川顕;津田雅孝
• 通讯作者: 津田雅孝

ビブリオ科細菌における薬剤耐性プラスミド全塩基配列解析とその伝達機構

弧菌科细菌耐药质粒的全核苷酸序列分析及其传播机制

• 发表时间: 2009
• 作者: C.Aikawa;T.Nozawa;F.Maruama;K.Tsumoto;S.Hamada;I.Nakagawa;丸山史人;野中里佐・丸山史人・宮本学・黒川顕・増田道明
• 通讯作者: 野中里佐・丸山史人・宮本学・黒川顕・増田道明

Species-specific evolutionary strategies revealed from genome and transcriptome of Streptococcus pyogenes and S. mutans

化脓性链球菌和变形链球菌的基因组和转录组揭示了物种特异性进化策略

• 发表时间: 2009
• 作者: F. Maruyama;H. Mori;C. Aikawa;T. Nozawa;K. Kurokawa;I. Nakagawa
• 通讯作者: I. Nakagawa

比較ゲノム・トランスクリトームにつくStreptococcus mutansおよびS.pyogenesの種レベルでの進化機構の解明

使用比较基因组学和转录组学在物种水平上阐明变形链球菌和化脓性链球菌的进化机制

• 发表时间: 2008
• 作者: 丸山史人;大野雅幸;相川知広;野澤孝志;桜井敦朗;中川一路;丸山史人;M. Ono;T. Nozawa;丸山史人
• 通讯作者: 丸山史人