Tiling array analysis of transcriptional regulators in genus Streptococcus

链球菌属转录调节因子的平铺阵列分析

• 批准号: 19390468
• 负责人: HAMADA Shigeyuki
• 金额: $ 12.56万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19390468/
• 关键词: レンサ球菌; マイクロアレイ; タイリングアレイ; 遺伝子発現; A群レンサ球菌; non-coding RNA; 転写調節; 感染

A群レンサ球菌(Group A Streptococcus : GAS)は初発感染として咽頭炎や扁桃炎, さらに続発性疾患として猩紅熱やリウマチ熱, 糸球体腎炎を引き起こす病原菌である. A群レンサ球菌は, 上皮細胞に侵入した後, エンドソームによる分解を回避し細胞質へと移行する. 一部は, 新たな自然免疫として機能することが示されたオートファジーにより除去される. このように細胞内の宿主の防御系から逃避することが, A群レンサ球菌の多彩な臨床像を示す1つの理由となるのではないかと考えられる. そこで, 本研究ではA群レンサ球菌が, 宿主の防御機構を回避し, 細胞内で生存する機構を明らかにすることを目的として, 感染時におけるA群レンサ球菌の全ゲノムレベルでの発現解析を経時的に行った.その結果, 真核細胞内に存在しているA群レンサ球菌のRNAを抽出・増幅した後に, マイクロアレイ解析を行った結果と定量的PCRとの間に相関があるプロトコールを確立することが出来た. 次に, A群レンサ球菌の発現変化に着目して, 発現解析を行った. 感染前のA群レンサ球菌と比較して, 感染後1時間目においてその発現を1.5倍以上変化させていた遺伝子数は全ORFの43%(1861個のうちの約800個)に及んでおり, オートファジーによる作用を受けていると考えられる3, 4時間目においても10%程度の遺伝子が発現を変化させていた.興味深いことに, 細胞のオートファジーの有無が, 同じ感染時間のA群レンサ球菌の遺伝子発現パターンの変化に影響を与えており, 全ORFの8%の遺伝子発現に差が生じていることがわかった.また, オートファジー欠損型細胞での比較により, オートファジーの存在下でのみ発現が上昇する遺伝子が26個見られた. このうちの7個の遺伝子(一本鎖結合タンパク質, インテグラーゼ, プラスミド安定化タンパク質, リボソームタンパク質S21, 透過酵素及び未知のタンパク質)は, オートファジー欠損型の宿主に感染した場合は発現が1.5倍以上減少していたため, オートファジーに対応して発現を増加させている可能性が考えられた.

Group A Streptococcus: レ サ サ GAS) early は 発 infection と し て those inflammation や almond inflammation, さ ら に 続 発 disorder と し て scarlet fever や リ ウ マ チ hot, si sphere nephritis を lead き up こ で す pathogen あ る. A group of レ ン サ aureus は, epithelial cells に intrusion し た after エ ン ド ソ ー ム に よ る decomposition を avoid し cytoplasm へ と transitional す る. A は, new た な natural immune と し て function す る こ と が shown さ れ た オ ー ト フ ァ ジ ー に よ り remove さ れ る. こ の よ う に intracellular の の host defense department か ら escape す る こ と が, A group of レ ン サ aureus の colorful な clinical like を shown す 1 つ の reason と な る の で は な い か と exam え ら れ る. そ こ で, This study で は group A レ ン サ aureus が, host の defense agency を avoid し, intracellular で す survival る institutions を Ming ら か に す る こ と を purpose と し て, infection に お け る group A レ ン サ aureus の full ゲ ノ ム レ ベ ル で の 発 now parse を 経 に line when っ た. そ の results, Eukaryotic cells exist に し て い る group A レ ン サ を aureus の RNA extraction, rights of し た に after マ イ ク ロ ア レ イ parsing line を っ た results と quantitative PCR と の に phase between masato が あ る プ ロ ト コ ー ル を establish す る こ と が た. The following に, group A レ レ サ サ of the cocci have a に target of evolution に て, and a を line of evolution った. Infection before の group A レ ン サ aureus と compare し て, 1 time after infection に お い て そ の 発 を now more than 1.5 times - the さ せ て い た heritage 伝 son number は whole ORF の 43% (1861 の う ち の about 800) に and ん で お り, オ ー ト フ ァ ジ ー に よ る role を by け て い る と exam え ら れ る 3, 4. At the same time, there is a にお にお て て 10% degree of cultural heritage 伝 が occurrence を change させて た た. Takes deep い こ と に, cell の オ ー ト フ ァ ジ ー の presence of が, with time の じ infection group A レ ン サ aureus の heritage 伝 son 発 now パ タ ー ン の - spheroidized に を and え て お り, whole ORF の 8% の heritage 伝 child born poor 発 now に が じ て い る こ と が わ か っ た. ま た, オ ー ト フ ァ ジ ー owe damage type cells で の is に よ り, オ ー ト フ ァ ジ ー の presence で の み 発 now rising が す る posthumous son 伝 が 26 see ら れ た. こ の う ち の seven の heritage 伝 child (a combination lock タ ン パ ク qualitative, イ ン テ グ ラ ー ゼ, プ ラ ス ミ ド stabilization タ ン パ ク qualitative, リ ボ ソ ー ム タ ン パ ク S21, through enzyme and び unknown の タ ン パ ク qualitative) は, オ ー ト フ ァ ジ ー owe damage type の に hosts し た occasions は 発 が now 1.5 times more than reduce し て い た た め, オ ー ト フ ァ ジ ー に 応 seaborne し て 発 now を raised さ せ て い る possibility が exam え ら れ た.

项目成果

A群レンサ球菌感染時にオ-トファジ-を誘導するNLRファミリーと相互作用する宿主因子の機能解析

A 组链球菌感染期间与诱导自噬的 NLR 家族相互作用的宿主因子的功能分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 野澤孝志;他
• 通讯作者: 他

Demonstration of Mother-to-Child Transmission of Streptococcus mutans Using Multilocus Sequence Typing

• DOI: 10.1159/000170588
• 发表时间: 2008-01-01
• 期刊: CARIES RESEARCH
• 影响因子: 4.2
• 作者: Lapirattanakul, J.;Nakano, K.;Ooshima, T.
• 通讯作者: Ooshima, T.

細菌感染によって誘導されるオートファジー

细菌感染诱导的自噬

• 发表时间: 2008
• 期刊: 化学療法の領域 24
• 作者: Harada F;et. al.;中川 一路
• 通讯作者: 中川 一路

Streptococcus, Shigella and Listeria-induced autophagy.

链球菌、志贺氏菌和李斯特菌诱导的自噬。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Method Enzymol. 452
• 作者: Ogawa M;et al.
• 通讯作者: et al.

レンサ球菌のゲノム解析に基づく進化と多様性獲得機構の解析

基于链球菌基因组分析的进化和多样性获取机制分析

• 作者: Lapirattanakul;J.;et al;中川一路;丸山史人;野澤孝志;相川知宏;丸山史人;森宏員;中川一路;中川一路;丸山史人;中川一路
• 通讯作者: 中川一路