小胞体に由来する新規オルガネラ"ER body"の解析

内质网衍生的新细胞器“ER体”分析

• 批准号: 06J03246
• 负责人: 永野 惇
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J03246/
• 关键词: ER body; 小胞体; オルガネラ; ベータ・グルコシダーゼ; PYK10; NAI2; IMP1; 定量解析; ベータグルコシダーゼ; ジャカリン様レクチン; 集団遺伝学; シロイヌナズナ; タイリングアレイ; メタボローム; 病害; GDSLリパーゼ

シロイヌナズナの根に見られるオルガネラ"ER Body"の機能を明らかにするため、その構成たんぱく質であるPYK10ベータ・グルコシダーゼおよび関連タンパク質の解析を行った。共発現解析からPYK10と関連が深いと考えられるタンパク質としてNAI2を同定した。NAI2はER bodyに局在するタンパク質であること、これを欠損するとER bodyが作られなくなることを明らかにした。また、NAI2を欠く突然変異体においてはPYK10のmRNA蓄積量に野生型と変化がないが、タンパク質の蓄積量が減少することが分かった。さらにNAI2を欠く突然変異体においてPYK10タンパク質は小胞体のネットワークに拡散してしまうことを明らかにした。これらの結果からNAI2は小胞体内腔においてPYK10タンパク質を凝集させることでER body形成を起こしているタンパク質であると考えられ、またPYK10タンパク質はNAI2によって凝集させられることによってより安定になっていると考えられる。さらに我々は、ER bodyの形態制御機構を明らかにするため、ER body数・形態の定量解析システムを構築した。この定量解析システムによってER bodyが長くなる変異体と短くなる変異体を見出した。長くなる変異体の原因遺伝子を同定したところ、PYK10のアミノ酸置換変異が原因であることが分かった。また、短くなる変異体では膜タンパク質IMP1が欠損している。さらに一過的遺伝子発現や分画遠心法をもちいたタンパク質の局在解析から、IMP1はER body膜に局在するということがわかった。以上、述べたように、NAI2を介したER body形成の分子機構およびER body内容物PYK10・膜タンパク質IMP1によるER body形態の制御機構を明らかにした。

シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ の root に see ら れ る オ ル ガ ネ ラ Ming ら "ER Body の function を" か に す る た め, そ の constitute た ん ぱ く qualitative で あ る PYK10 ベ ー タ · グ ル コ シ ダ ー ゼ お よ び masato even タ ン パ ク qualitative analytical line を っ の た. Total 発 now parse か ら PYK10 と masato even が deep い と exam え ら れ る タ ン パ ク qualitative と し て NAI2 を with fixed し た. NAI2 は ER body に bureau in す る タ ン パ ク qualitative で あ る こ と, こ れ を owe loss す る と ER body が as ら れ な く な る こ と を Ming ら か に し た. ま た, NAI2 を owe く suddenly - variant に お い て は PYK10 の mRNA volume に wild-type と variations change が な い が, タ ン パ ク qualitative の volume が reduce す る こ と が points か っ た. さ ら に NAI2 を owe く suddenly - variant に お い て PYK10 タ ン パ ク qualitative は small cell body の ネ ッ ト ワ ー ク に company, scattered し て し ま う こ と を Ming ら か に し た. Results こ れ ら の か ら NAI2 は small cell in the body cavity に お い て PYK10 タ ン パ ク qualitative を agglutination さ せ る こ と で ER Body formation を こ し て い る タ ン パ ク qualitative で あ る と exam え ら れ, ま た PYK10 タ ン パ ク qualitative は NAI2 に よ っ て agglutination さ せ ら れ る こ と に よ っ て よ り settle に な っ て い る と exam え ら れ る. さ ら に I 々 は, ER body の form system of the royal institution を Ming ら か に す る た め, ER body count, forms の quantitative analytic シ ス テ ム を build し た. <s:1> <s:1> quantitative analysis システムによってER bodyが long くなる variant と short くなる variant を see を た. Long く な る - cause of allograft の survived 伝 を with fixed し た と こ ろ, PYK10 の ア ミ ノ acid replacement - different が reason で あ る こ と が points か っ た. Youdaoplaceholder0, short くなる variant で で membrane タ パ パ <s:1> IMP1が underdamaged て て る る る. さ ら に a legacy of 伝 son 発 や points now draw far art を も ち い た タ ン パ ク qualitative の bureau in parsing か ら, IMP1 は ER body membrane に bureau in す る と い う こ と が わ か っ た. This, べ た よ う に, NAI2 を interface し た ER body form の molecules institutions お よ び ER body contents PYK10, membrane タ ン パ ク qualitative IMP1 に よ る ER body form の system royal institution を Ming ら か に し た.

项目成果

AtMap1: a DNA microarray for genomic deletion mapping in Arabidopsis thaliana

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03656.x
• 发表时间: 2008-12-01
• 期刊: PLANT JOURNAL
• 影响因子: 7.2
• 作者: Nagano, Atsushi J.;Fukazawa, Mitsue;Hara-Nishimura, Ikuko
• 通讯作者: Hara-Nishimura, Ikuko

二峰性発現量多型を指標とした種内多型原因遺伝子の逆遺伝学的探索

使用双峰表达多态性作为指标对种内多态性基因进行反向遗传搜索

• 发表时间: 2007
• 作者: Morinaga;S.-I. and A.J.Nagano;et. al.;永野惇;永野 惇
• 通讯作者: 永野 惇

NAI2 Is an Endoplasmic Reticulum (ER) Body Component That Enables ER Body Formation in Arabidopsis thaliana

NAI2 是一种内质网 (ER) 体成分，可促进拟南芥 ER 体的形成

• 发表时间: 2008
• 期刊: Plant Cell 20(9)
• 作者: Yamada K.;Nagano AJ.;et al
• 通讯作者: et al

AtMAP1タイリングアレイを用いたハイスループット正遺伝学の試み.

使用 AtMAP1 平铺阵列进行高通量阳性遗传学的尝试。

• 发表时间: 2008
• 作者: T. Goto;A. V. Dorofeenko;A. M. Merzlikin;A. V. Baryshev;A. P. Vinogradov;M. Inoue;A. A. Lisyansky;A. B. Granovsky;永野惇
• 通讯作者: 永野惇

Ecogenomics of cleistogamous and chasmogamous flowering:: genome-wide gene expression patterns from cross-species microarray analysis in Cardamine kokaiensis (Brassicaceae)

• DOI: 10.1111/j.1365-2745.2008.01392.x
• 发表时间: 2008-09-01
• 期刊: JOURNAL OF ECOLOGY
• 影响因子: 5.5
• 作者: Morinaga, Shin-ichi;Nagano, Atsushi J.;Fukuda, Hiroo
• 通讯作者: Fukuda, Hiroo