マイクロアレイを用いた大腸癌術後遠隔転移の予測および新規遠隔転移関連遺伝子の検討

微阵列预测结直肠癌术后远处转移及新型远处转移相关基因的研究

• 批准号: 20659211
• 负责人: 渡邉 聡明
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: Teikyo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20659211/
• 关键词: 大腸癌; 血行性転移; 遺伝子発現解析; マイクロアレイ; テーラーメイド治療

大腸癌外科的治療後の遠隔転移を来すハイリスク症例を選別できれば、ハイリスク症例に対して積極的な術後補助化学療法、あるいはintensiveな術後フォローアップを行うことにより、大腸癌外科治療後の予後の向上が期待できる。しかし、現在までに大腸癌外科的治療後の遠隔転移を高精度で予測するマーカーは確立されていない。今回、DNAマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析により、大腸癌手術後に遠隔転移を来す症例を予測し、大腸癌に対するテーラーメイド治療を可能にすることを目的とした。外科的切除が行われ、手術時に切除された大腸癌組織が直ちに凍結して保存されていて、術後5年以上経過観察されて遠隔転移の有無が確認されている症例のうち、大腸癌組織を用いた遺伝子研究に対してインフォームドコンセントが得られている128症例を対象とした。対象症例の凍結標本よりSepazolを用いtotal RNAを抽出し、T7-oligo(dT)24 primerを用いcDNAへ逆転写後、biotin標識cRNAを合成し、Affymetrix社のGeneChipにハイブリダイズして大腸癌発生及び転移や薬剤感受性に関連が考えられる約54,000種類の遺伝子発現解析を行った。遠隔転移の認められた38例と認められなかった90例の間で有意に発現の差のあった64遺伝子を抽出した。この64遺伝子を用いて、肝転移の予測式を作成した。予測式を作成する際には、GeneSpring(silicon genetics社)を用い、leave-one-out法の一種であるKNN法にて行った。この結果、予測精度68%で遠隔転移の有無の予想が可能であった。今後は、独立した症例により予測式のvalidationを行っていく必要があるが、本予測式により、遠隔転移ハイリスク例に対するテーラーメード治療が行える可能性がある。

Colorectal cancer surgery after treatment of distant shift to select cases, cases of active postoperative chemotherapy, intensive postoperative treatment of colorectal cancer after the upward expectations High precision prediction of distant metastasis after colorectal cancer surgery is now established. The gene discovery analysis of the present study indicates that there is a possibility of distant metastasis after colorectal cancer surgery. Surgical resection, surgical resection, colorectal cancer tissue preservation, more than 5 years after surgery, observation, remote migration, and confirmation of the presence of symptoms, colorectal cancer tissue use, genetic research, and other 128 cases were identified. For example, total RNA was extracted from frozen DNA, T7-oligo (dT) 24 primer was back-written with cDNA, biotin cRNA was synthesized, and Affytrix GeneChip was used to analyze the gene expression of about 54,000 species related to colorectal cancer development and susceptibility to cancer. 38 cases were identified and 90 cases were intentionally identified. The 64 genes were used in the prediction of liver migration. GeneSpring (Silicon Genetics) is one of the leave-one-out methods. The accuracy of prediction is 68%. In the future, independent cases, predictive formula validation, necessary, predictive formula, remote case, predictive formula validation, possible

项目成果

Chromosome 18q deletion as a novel molecular predictor for colorectal cancer with simultaneous hepatic metastasis

染色体 18q 缺失作为结直肠癌并发肝转移的新型分子预测因子

• 期刊: Diagn Mol Pathol (in press)
• 作者: Tanaka T;Watanabe T;Kitayama J;Kazama Y;Tanaka J;Kanazawa T;Kazama S;Nagawa H.
• 通讯作者: Nagawa H.

Recent advances in chemotherapy and chemoradiotherapy for gastrointestinal tract cancers.

胃肠道癌症化疗和放化疗的最新进展。

• 发表时间: 2008
• 期刊: International Journal of Clinical Oncology 13
• 作者: Watanabe T;Yamamoto Y;Yamada H;et al.;Watanabe T.;Watanabe T.
• 通讯作者: Watanabe T.

Predicting clinical outcome to 5-Fluorouracil-based chemotherapy for colon cancer patients : is it the CpG island methylator phenotype?

预测结肠癌患者基于 5-氟尿嘧啶的化疗的临床结果：是 CpG 岛甲基化表型吗？

• 发表时间: 2008
• 期刊: Int J Clin Oncol 13 (6)
• 作者: Iacopetta B;Kawakami K. Watanabe T.
• 通讯作者: Kawakami K. Watanabe T.

Intraoperative Colonoscopy for Stapled Anastomosis in Colorectal Surgery

• DOI: 10.1007/s00595-007-3740-0
• 发表时间: 2008-11-01
• 期刊: SURGERY TODAY
• 影响因子: 2.5
• 作者: Ishihara, Soichiro;Watanabe, Toshiaki;Nagawa, Hirokazu
• 通讯作者: Nagawa, Hirokazu

Gene Expression Signature and the Prediction of Lymph Node Metastasis in Colorectal Cancer by DNA Microarray

• DOI: 10.1007/dcr.0b013e3181b53684
• 发表时间: 2009-12
• 期刊: Diseases of the Colon & Rectum
• 影响因子: 3.9
• 作者: Toshiaki Watanabe;T. Kobunai;Toshiaki Tanaka;S. Ishihara;K. Matsuda;H. Nagawa