Multi-disciplinary analysis ob 50-100nt-sized,small RNAs Universally found in mouse cells
Multi-disciplinary analysis ob 50-100nt-sized,small RNAs Universally found in mouse cells
批准号:
21200039
负责人:
KIYOSAWA Hidenori
金额:
$19.8万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011
中文摘要
我们基于定制的微阵列,对最初在产生内源性反义RNA的基因位点中发现的新型大小(50-100个核苷酸)的小RNA进行了全基因组分析。用Northern杂交分析基因表达的有效性。我们建立了一种用于小RNA结构分析的核磁共振管内转录结构筛选方法。我们还使用下一代测序仪对小RNA进行了试表达分析,并对RNA序列进行了结构聚类。
英文摘要
We performed genome-wide analysis of novel-sized (50-100nt) small RNAs that is originally discovered in the gene loci producing endogenous antisense RNA, based on the custom-made microarrays. The expression validation was analyzed by Northern hybridization. We developed a structural screening method by the in NMR tube transcription for the structural analysis of small RNA. We also performed a trial expression analysis of small RNAs using the next generation sequencers and structural clustering of the RNA sequences.
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NMR試験管内転写によるRNAのNMRスペクトルの測定
通过 NMR 体外转录测量 RNA 的 NMR 谱
DOI:
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发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[斎藤裕之, 伊谷野悠里, 牛田千里, 清澤秀孔, 河合剛太]
通讯作者:
河合剛太
マウスSAT領域から発現する50-100残基RNAのクラスタリングと構造解析
小鼠 SAT 区域表达的 50-100 个残基 RNA 的聚类和结构分析
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[河合剛太, 牛田千里, 清澤秀孔]
通讯作者:
清澤秀孔
An ES cell-differentiation system recapitulates a developmentally regulated neuron-specific parent-of-origin expressivity
ES细胞分化系统概括了发育调节神经元特异性的亲本表达能力
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
Hum. Mol. Genet.
影响因子:
--
作者:
[Kohama C, Kato H, Numata K, Hirose M,Og ura A, and Kiyosawa H]
通讯作者:
and Kiyosawa H
A new entropy model for RNA : part V, Incorporating the Flory-Huggins model in structure prediction and folding
一种新的 RNA 熵模型:第五部分,将 Flory-Huggins 模型纳入结构预测和折叠
DOI:
--
发表时间:
期刊:
J. Nucleic Acids Invest.
影响因子:
--
作者:
[Y. Oba, N. Watanabe, A. Kouchi, T. Hama, V. Pirronello, Dawson W and Kawai G]
通讯作者:
Dawson W and Kawai G
機能性RNAの分子生物学
功能RNA的分子生物学
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[河合剛太, 清澤秀孔編]
通讯作者:
清澤秀孔編
共 24 条
Analysis of the imprinted regions based on the entire transcriptome
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批准号:26290063
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.15万
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财政年份:2014
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负责人:KIYOSAWA Hidenori
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依托单位:
New strategy for drug-resistant cancer cells by targeting long, non-coding/antisense RNA
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批准号:25640067
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2013
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负责人:KIYOSAWA Hidenori
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依托单位:
Functional Analysis of Mouse Antisense RNA and Evolution of X Chromosome
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批准号:15510161
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2003
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负责人:KIYOSAWA Hidenori
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依托单位:
海外基金