誘導型アンチセンスRNAによるカンジダ酵母のフェノムプロジェクト

使用诱导型反义 RNA 的念珠菌酵母表型项目

• 批准号: 15019016
• 负责人: 知花 博治
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15019016/
• 关键词: 病原性真菌; ゲノム創薬; 染色体

カンジダは化学療法により治療中の患者や臓器移植を受けた患者並びに,エイズ患者等,免疫機能の低下した患者に対して重篤な深在性カンジダ症を起こす真菌であり,患者数は年々増加している。カンジダはヒトと同じ真核生物であるため副作用の低い抗真菌薬の開発が難しく,有効な抗真菌薬の種類が少ない。現在アゾール系抗真菌薬を中心に処方されているが,近年アゾール系抗真菌薬耐性株の報告が増加しており,新薬の開発並びに病原性の解明は緊急課題であり,遺伝子レベルでの解析が世界中で進められている。カンジダ(Candida albicans)のシークエンスプロジェクトはスタンフォード大学やミネソタ大学等との共同研究において進められ,ゲノムシークエンスのドラフトシークエンス(草稿)(15Mbp)を完成させた。ゲノム上には6.421の遺伝子の存在が推測された。この研究成果は米国科学アカデミー学会誌(PNAS)に投稿し,受理された。C.albicansは二倍体生物で有性生殖は行わないとされており,これが原因で相同染色体間でヘテロな塩基配列が多く見られシークエンスの編集作業に混乱を来している。ドラフトシークエンスは421本のコンティグで構成されており申請者らは染色体7番のシークエンス上に見つかった6箇所のギャップのシークエンスをPCR法によって増幅,配列の決定を行い,さらに修正を加え1Mbpのシークエンスを完成させた。染色体7番の正確なアノテーションも行なった。

念珠菌是一种真菌，通过化学疗法，进行器官移植的患者和免疫功能降低的患者（例如艾滋病患者）引起严重的深层念珠菌病，例如艾滋病患者，并且患者的数量逐年增加。念珠菌是类似于人类的真核生物，因此很难开发具有低副作用的抗真菌药物，而且有效的抗真菌药物几乎没有类型的抗真菌药物。目前，硫唑抗真菌剂主要是处方的，但是近年来，关于硫唑抗真菌抗药性菌株的报道正在增加，新药物的发展和致病性的阐明是一个紧迫的问题，并且基因分析正在全球范围内进行。白色念珠菌测序项目是与斯坦福大学和明尼苏达大学合作进行的，并完成了基因组序列草案（15MBP）。在基因组上估计了6.421的基因的存在。这项研究已提交给国家科学院（PNAS）杂志并接受。白色念珠菌是二倍体生物，不是性生殖的，这会导致同源染色体之间许多异源核苷酸序列，从而导致序列编辑中的混淆。草稿序列由421个重叠群组成，申请人放大并测序了通过PCR在染色体数7的序列上发现的六个间隙的序列，并进行了进一步的修改以完成1MBP序列。还进行了第7号染色体的注释。

项目成果

Hiroji Chibana, Yuzuru Mikami: "Genomic analysis in Candida albicans"Japanese Journal of Medical. 44・2. 81-85 (2003)

Hiroji Chibana，Yuzuru Mikami：“白色念珠菌的基因组分析”日本医学杂志 44・2（2003）。