誘導型アンチセンスRNAによるカンジダ酵母のフェノムプロジェクト

使用诱导型反义 RNA 的念珠菌酵母表型项目

• 批准号: 15019016
• 负责人: 知花 博治
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15019016/
• 关键词: 病原性真菌; ゲノム創薬; 染色体

カンジダは化学療法により治療中の患者や臓器移植を受けた患者並びに,エイズ患者等,免疫機能の低下した患者に対して重篤な深在性カンジダ症を起こす真菌であり,患者数は年々増加している。カンジダはヒトと同じ真核生物であるため副作用の低い抗真菌薬の開発が難しく,有効な抗真菌薬の種類が少ない。現在アゾール系抗真菌薬を中心に処方されているが,近年アゾール系抗真菌薬耐性株の報告が増加しており,新薬の開発並びに病原性の解明は緊急課題であり,遺伝子レベルでの解析が世界中で進められている。カンジダ(Candida albicans)のシークエンスプロジェクトはスタンフォード大学やミネソタ大学等との共同研究において進められ,ゲノムシークエンスのドラフトシークエンス(草稿)(15Mbp)を完成させた。ゲノム上には6.421の遺伝子の存在が推測された。この研究成果は米国科学アカデミー学会誌(PNAS)に投稿し,受理された。C.albicansは二倍体生物で有性生殖は行わないとされており,これが原因で相同染色体間でヘテロな塩基配列が多く見られシークエンスの編集作業に混乱を来している。ドラフトシークエンスは421本のコンティグで構成されており申請者らは染色体7番のシークエンス上に見つかった6箇所のギャップのシークエンスをPCR法によって増幅,配列の決定を行い,さらに修正を加え1Mbpのシークエンスを完成させた。染色体7番の正確なアノテーションも行なった。

The number of patients treated with chemotherapy, organ transplantation, and fungal infection is increasing with age. It is difficult to develop antifungal agents with low side effects in eukaryotes, and there are few antifungal agents. Recently, reports of resistant strains of antifungal agents have been increasing, new drug development and identification of pathogenic agents have been urgent issues, and analysis of genetic agents has been advancing in the world. The common research on Candida albicans (Candida albicans) was carried out in the United States and other universities, and the draft (15Mbp) was completed. The existence of the 6.421 gene is presumed. The results of this research were submitted to the Journal of the National Science Society (PNAS) and accepted. C.albicans is a diploid organism that reproduces sexually. The composition of the chromosome of the applicant is 421. The chromosome of the applicant is 7. The chromosome of the applicant is 6. The PCR method is used to increase the amplitude and determine the alignment. The correction is added 1Mbp. Chromosome 7 is the correct candidate for chromosome 7.

项目成果

Hiroji Chibana, Yuzuru Mikami: "Genomic analysis in Candida albicans"Japanese Journal of Medical. 44・2. 81-85 (2003)

Hiroji Chibana，Yuzuru Mikami：“白色念珠菌的基因组分析”日本医学杂志 44・2（2003）。