アンチセンスRNAによる概日リズムおよび非生物的ストレス応答の制御機構の解明

反义RNA阐明昼夜节律和非生物胁迫反应的控制机制

基本信息

  • 批准号:
    10F00213
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.64万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2010 至 2011
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

環境ストレス(乾燥、低温、塩)やABA処理条件下でのタイリングアレイデータ(Matsui et al. 2008)およびSteve Kayグループの概日リズム応答に関するタイリングアレイデータ(Hazen et al. 2009)を用いてデータ解析を行った。その結果、乾燥・塩などのストレスやABAに応答し、かつ概日リズムにも応答する遺伝子の内、概日リズム応答性のアンチセンスRNAが蓄積しているものはほんの一部であった。一方で、低温ストレスと概日リズムの両方に応答する遺伝子においては、概日リズム応答性のアンチセンスRNAが蓄積するものが幾らか存在していた。その中には、低温などの環境ストレスにより誘導される遺伝子としてよく知られているRD29A遺伝子および概日リズム制御の主要な因子であるLHYおよびCCA1遺伝子が存在していた。本研究ではLHYおよびCCA1遺伝子に解析対象を絞って進めた。まず、アンチセンスRNAの概日リズム依存的な発現プロファイル検出を目指して鎖特異的なRT-PCRの条件検討およびアンチセンスRNAのクローニングを目指してRACE-PCR条件の至適化を進めた。また、近年クロマチンリモデリングが概日リズム応答の制御に関与する事が示唆されてきている。上記アレイデータを用いて概日リズムにより発現制御されるクロマチンリモデリング関与遺伝子の候補を幾つか同定した。それら遺伝子のT-DNA挿入変異株を選抜し、野生株と異なる概日リズムを有する変異体を迅速に同定するためCCA1:LUCのトランスジェニック植物系統との交配を進めた。さらに、概日リズム解析のためのクロマチン免疫沈降実験のプロトコールの至適化を行った。今後、野生株と異なる概日リズムを有する変異体を同定し、変異体におけるクロマチン動態の解析を行う予定である。
Under the condition of environmental temperature (dry, low temperature, temperature) and ABA, the temperature and temperature of the environment are affected by temperature and temperature (Matsui et al. 2008) the Steve Kay is expected to answer the question (Hazen et al.) 2009) parse the lines using the parsing method. The results, dryness and dryness, the results, the ABA, the results, the dryness, the results, the dryness, the results, the results On the one hand, the cryogenic temperature is very sensitive to the temperature, the temperature is very low, the temperature is very low, the temperature is low, and the temperature is very low. In the environment of low temperature and low temperature, it is necessary to know that there is a significant impact on the main factors affecting the control of the RD29A environment, such as the LHY environment, the environment and the environment. The purpose of this study is to analyze the results of LHY analysis and CCA1 analysis. On the basis of the data, we can see that the RNA conditions that are dependent on each other refer to the RT-PCR conditions that are specific to each other. The RT-PCR conditions refer to the RACE-PCR conditions to the evolution conditions. In recent years, we have been told that we are going to be in charge of the government and that we are going to tell you that we are going to be in trouble. In the previous session, you will need to know that you are in the same position as your child. In the wild, there is a possibility that there will be a rapid increase in mating of the plant system in the same way that the T-DNA of the plant system has been selected and the wild plant has been selected for the first time. In the wild, there is a rapid increase in the number of plants that can be mating rapidly. It is necessary to analyze the immune system in order to reduce the risk of immune sedimentation. In the future, the wild plants will be able to determine the same and analyze the dynamics in the future.

项目成果

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ARTADE2DB: Improved Statistical Inferences for Arabidopsis Gene Functions and Structure Predictions by Dynamic Structure-Based Dynamic Expression (DSDE) Analyses
  • DOI:
    10.1093/pcp/pcq202
  • 发表时间:
    2011-02-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Iida, Kei;Kawaguchi, Shuji;Toyoda, Tetsuro
  • 通讯作者:
    Toyoda, Tetsuro
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
    2016
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  • 影响因子:
    0
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
    2016
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  • 影响因子:
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    山下 朋恵;坂本 卓也;坂本 勇貴;松井 章浩;金 鐘明;関 原明;松永 幸大
  • 通讯作者:
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    17017041
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    2005
  • 资助金额:
    $ 0.64万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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    16011266
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    2004
  • 资助金额:
    $ 0.64万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 0.64万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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  • 批准号:
    14011257
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 0.64万
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  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 0.64万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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  • 批准号:
    12202056
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 0.64万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
逆遺伝学的手法による高等植物シグナル伝達経路関連遺伝子の機能解析
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  • 批准号:
    11780502
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 0.64万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 0.64万
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  • 批准号:
    08780666
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 0.64万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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