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原核生物小分子RNAを利用した遺伝子ノックダウン系の構築

原核生物小分子RNAを利用した遺伝子ノックダウン系の構築
利用原核小RNA构建基因敲除系统
批准号：
21657032
负责人：
饗場 弘二
金额：
$1.98万
依托单位：
Suzuka University of Medical Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2009
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2009 至 2010
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21657032/
关键词：
小分子RNAHfqサイレンシング遺伝子ノックダウン系大腸菌組換sRNAアンチセンRNA塩基対形成アンチセンスRNA

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项目成果

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小分子RNA(sRNA)による転写後の遺伝子発現調節機構が大腸菌からヒトに至る多くの生物において発見され、細胞の環境応答や発生、分化などを支配している。大腸菌のグルコーストランスポーター遺伝子(ptsG)の発現が解糖系中間代謝産物の蓄積により転写後段階で抑制されるという発見を契機に一連の研究を展開し、この制御に関わるSgrS RNAがsRNAの作動原理の理解にとって有力であることを明らかにしてきた。本研究では、SgrSをモデル系として、原核生物におけるsRNAによる人為的遺伝子ノックダウン系の構築を目指す。平成22年度までに以下の成果を得た。1)SgrSは全長が227ntからなるRNA分子であるが、168-227領域からなる60ntのSgrS-Sが完全な活性を示すことを明らかにした。2)塩基対形成に必要な最小の領域は168-181の14ntであること、したがって、転写終結領域を含む182-227にHfqとの結合領域が存在することを明らかにした。3)実際に、転写終結シグナルの1つの要素であるpolyU tailがHfq結合部位であることを発見した。4)SgrS-Sの塩基対形成領域内に種々のmRNAの翻訳開始領域と相補的な30ntをクローニングし、IPTGにより発現誘導できる一連のを組換SgrSを構築し、標的mRNAの発現をNorthern blotting、およびWestern blottingにより解析したところ、いずれも効果的な抑制作用がみられた。すなわち人為的遺伝子ノックダウン系の構築に成功した。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
歴史を遡るRNA研究
RNA研究追溯历史
DOI： --
发表时间： 2009
期刊： 遺伝子医学MOOK 15
影响因子： --
作者： [Kato K., Tashiro J., Miyawaki S., Ebe K., Tokunaga M., 饗場弘二]
通讯作者： 饗場弘二
大腸菌sRNAであるSgrSの機能領域の解析
大肠杆菌 sRNA SgrS 的功能区分析
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [石川博一, 大鷹弘紀, 森田鉄兵, 饗場弘二]
通讯作者： 饗場弘二
Implication of spacer length between base-pairing and Hfq-binding region in bacterial small RNA function.
碱基配对和 Hfq 结合区域之间的间隔区长度对细菌小 RNA 功能的影响。
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [石川博一, 大鷹弘紀, 森田鉄兵, 饗場弘二]
通讯作者： 饗場弘二
A minimal base-pairing region of a bacterial small RNA SgrS required for translational repression of ptsG mRNA
DOI： 10.1111/j.1365-2958.2010.07141.x
发表时间： 2010-05-01
期刊： MOLECULAR MICROBIOLOGY
影响因子： 3.6
作者： [Maki, Kimika, Morita, Teppei, Aiba, Hiroji]
通讯作者： Aiba, Hiroji
共 20 条
    リボソームによるmRNA切断:分子機構と生理的意義
    • 批准号：
      16657050
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.86万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      饗場 弘二
    • 依托单位：
      Nagoya University
    TmRNA系による標的タンパク質の精製と同定の試み
    • 批准号：
      13878128
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.34万
    • 财政年份：
      2001
    • 负责人：
      饗場 弘二
    • 依托单位：
      Nagoya University
    Trans-translationの高感度検出系の確立とtmRNAの生理機能
    • 批准号：
      12878130
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.6万
    • 财政年份：
      2000
    • 负责人：
      饗場 弘二
    • 依托单位：
      Nagoya University
    PTSリン酸リレー系とグルコース応答の包括制御
    • 批准号：
      12142203
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $23.36万
    • 财政年份：
      2000
    • 负责人：
      饗場 弘二
    • 依托单位：
      Nagoya University
    国内基金
    海外基金
    小RNA DsrA及其伴侣蛋白Hfq偶联的群体感应抗酸线路的合成与应用研究
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      30.0万元
    • 批准年份：
      2024
    • 负责人：
      杨晓锋
    • 依托单位：
      华南理工大学
    sRNA伴侣Hfq介导的III型分泌系统抑制调节维氏气单胞菌两头下注（bet-hedging）合作毒力
    • 批准号：
      32360047
    • 项目类别：
      地区科学基金项目
    • 资助金额：
      32万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      马香
    • 依托单位：
      海南大学
    嗜水气单胞菌Hfq蛋白K56位点酰基化修饰响应环境胁迫的机制研究
    • 批准号：
      32001045
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      24.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      王贵宾
    • 依托单位：
      北京蛋白质组研究中心
    hfq和rpoS调控粘质沙雷氏菌灵菌红素合成与逆境适应的分子机制
    • 批准号：
      32071479
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      56.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      乔代蓉
    • 依托单位：
      四川大学