Development of a system to find bioactivemolecues by genome scanning

开发通过基因组扫描寻找生物活性分子的系统

• 批准号: 22510223
• 负责人: ISHIKAWA Jun
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22510223/
• 关键词: ゲノム; 次世代シークエンサー; 抗生物質; 応用微生物; 創薬; 生物活性物質

To develop a system to find bioactive molecules by genome scanning, Nocardia brasiliensis IFM 0406 was sequenced by a next-generation sequencer. Many candidates for biosynthetic gene clustres of bioactive molecules were found, and the metabolite of one of the clusters was detected by forced expression of positive regulatory genes. These results suggest that genome scanning facilitates the finding of novel bioactive molecules.

为了建立一个通过基因组扫描寻找生物活性分子的系统，用新一代测序仪对巴西诺卡氏菌IFM 0406进行了测序。发现了许多生物活性分子生物合成基因簇的候选者，并通过强制表达正调控基因来检测其中一个簇的代谢产物。这些结果表明，基因组扫描有助于发现新的生物活性分子。

项目成果

二次代謝産物研究における次世代シークエンサーの利用

下一代测序仪在次级代谢物研究中的应用

• 发表时间: 2012
• 作者: Ogata M;Awaji T;Iwasaki N. Fujimaki R;Takizawa M;Maruyama K;Iwamoto Y;Uchigata Y;石川淳
• 通讯作者: 石川淳

Complete genome sequence of the motile actinomycete Actinoplanes missouriensis 431(T) (= NBRC 102363(T)).

• DOI: 10.4056/sigs.3196539
• 发表时间: 2012-12-19
• 期刊: Standards in genomic sciences
• 作者: Yamamura H;Ohnishi Y;Ishikawa J;Ichikawa N;Ikeda H;Sekine M;Harada T;Horinouchi S;Otoguro M;Tamura T;Suzuki K;Hoshino Y;Arisawa A;Nakagawa Y;Fujita N;Hayakawa M
• 通讯作者: Hayakawa M

Identification of Nocobactin NA Biosynthetic Gene Clusters in Nocardia farcinica

• DOI: 10.1128/jb.00897-10
• 发表时间: 2011-01-01
• 期刊: JOURNAL OF BACTERIOLOGY
• 影响因子: 3.2
• 作者: Hoshino, Yasutaka;Chiba, Kazuhiro;Ishikawa, Jun
• 通讯作者: Ishikawa, Jun

次世代シークエンサーによるMicromonospora griseorubidaのゲノム解析

使用下一代测序仪对灰红小单孢菌进行基因组分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 藤巻理沙、岩崎直子;他;石川淳
• 通讯作者: 石川淳

次世代シークエンサーによる「とりあえずゲノム」解析のすすめ

使用下一代测序仪促进“基因组”分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Takizawa M;Iwasaki N;Yamamoto T;Iwamoto Y;Uchigata Y;石川淳
• 通讯作者: 石川淳