Genome-wide associationstudy to detect disease-associated genes in Japanese patients with primary biliary cirrhosis

全基因组关联研究检测日本原发性胆汁性肝硬化患者的疾病相关基因

• 批准号: 23591006
• 负责人: NAKAMURA Minoru
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: Department of Clinical Research, National Hospital Organization Nagasaki Medical Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23591006/
• 关键词: 原発性胆汁性肝硬変; 疾患感受性遺伝子; GWAS; 肝臓学; 全ゲノム関連解析; 予後予測マーカー; 疾患発症パスウェイ

To identify susceptibility loci for primary biliary cirrhosis(PBC) in Japanese population, a genome-wide association study (GWAS) and subsequent replication study were performed in a total of 1327 PBC cases and 1120 healthy controls. Two significant non-HLA susceptibility loci (TNFSF15 and POU2AF1) for PBC were identified. In addition, 10 loci (CD80, IKZF3, IL7R, NFKB1, STAT4, CXCR5, TNFAIP2, MAP3K7IP1, rs6974491, DENND1B) out of 21 non-HLA susceptibility loci for PBC in European descent showed significant associations in Japanese population. These results indicated the importance of two disease-pathways in both European descent and Japanese population, Th1/Th17 differentiation of T cells (CD80, IL12A, IL12RB2, STAT4, TNFSF15) and B cells(IL7R, CXCR5, POU2AF1, SPIB, IKZF3). In addition, the study for systemic and local expression of TNF-like ligand 1A (TL1A), which is encoded by TNFSF15, indicated that TL1A may be involved in the pathogenesis of PBC.

为了确定日本人群原发性胆汁性肝硬化（PBC）的易感基因位点，对1327例PBC病例和1120例健康对照进行了全基因组关联研究（GWAS）和随后的重复研究。两个显着的非HLA易感性位点（TNFSF 15和POU 2AF 1）的PBC被确定。此外，在21个非HLA易感性位点中，有10个位点（CD 80、IKZF 3、IL 7 R、NFKB 1、STAT 4、CXCR 5、TNFAIP 2、MAP 3 K 7IP 1、rs6974491、DENND 1B）在欧洲血统的PBC中显示出显著的相关性。 这些结果表明两种疾病途径在欧洲血统和日本人群中的重要性，即T细胞（CD 80，IL 12 A，IL 12 RB 2，STAT 4，TNF 15）和B细胞（IL 7 R，CXCR 5，POU 2 AF 1，SPIB，IKZF 3）的Th 1/Th 17分化。此外，对肿瘤坏死因子15（TNFSF 15）编码的肿瘤坏死因子样配体1A（TL 1A）在外周血和局部表达的研究表明，TL 1A可能参与了PBC的发病机制。

项目成果

The role of TL1A and DR3 in autoimmune and inflammatory diseases.

• DOI: 10.1155/2013/258164
• 发表时间: 2013
• 期刊: Mediators of inflammation
• 影响因子: 4.6
• 作者: Aiba Y;Nakamura M
• 通讯作者: Nakamura M

原発性胆汁性肝硬変の進行に関与する胆汁酸合成系遺伝子多型の解析

原发性胆汁性肝硬化进展中胆汁酸合成基因多态性分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 稲嶺達夫;大曲勝久;中村 稔
• 通讯作者: 中村 稔

the Japanese NHO-Liver -network study group. Hepatocellular carcinoma and survival in patients with autoimmune hepatitis (Japanese National Hospital Organization-autoimmune hepatitis prospective study)

日本 NHO 肝脏网络研究小组。

• 发表时间: 2012
• 期刊: Liver Int
• 影响因子: 6.7
• 作者: Migita K;Watanabe Y;Jiuchi Y;Nakamura Y;Saito A;Yagura M;Ohta H;Shimada M;Mita E;Hijioka T;Yamashita H;Takezaki E;Muro T;Sakai H;Nakamuta M;Abiru S;Komori A;Ito M;Yatsuhashi H;Nakamura M;Ishibashi H
• 通讯作者: Ishibashi H

Serum amyloid A (SAA) induces pentraxin 3 (PTX3) production in rheumatoid synoviocytes

• DOI: 10.1007/s10165-012-0630-0
• 发表时间: 2013-01-01
• 期刊: MODERN RHEUMATOLOGY
• 影响因子: 2.2
• 作者: Satomura, Kenshi;Torigoshi, Takafumi;Migita, Kiyoshi
• 通讯作者: Migita, Kiyoshi

日本人原発性胆汁性肝硬変における免疫関連分子の遺伝子多型の解析

日本原发性胆汁性肝硬化免疫相关分子基因多态性分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Isayama H;Yasuda I;et al.;相葉佳洋,稲嶺達夫,城下智,小森敦正,右田清志,八橋弘,中牟田誠,福嶋伸良,竿代丈夫,林茂樹,渡部幸夫,矢倉道泰,高野弘嗣,室豊吉,太田肇,島田昌明,米田俊貴,山下晴弘,竹崎英一,古賀満明,小松達司,小林正和,杉和洋,高橋正彦,正木尚彦,吉澤要,塚元和弘,石橋大海,中村稔
• 通讯作者: 相葉佳洋,稲嶺達夫,城下智,小森敦正,右田清志,八橋弘,中牟田誠,福嶋伸良,竿代丈夫,林茂樹,渡部幸夫,矢倉道泰,高野弘嗣,室豊吉,太田肇,島田昌明,米田俊貴,山下晴弘,竹崎英一,古賀満明,小松達司,小林正和,杉和洋,高橋正彦,正木尚彦,吉澤要,塚元和弘,石橋大海,中村稔