結核菌感染における疾患感受性遺伝子ならびに薬剤治療有効性決定遺伝子の同定

结核分枝杆菌感染疾病易感基因及决定药物治疗效果的基因鉴定

• 批准号: 13J10599
• 负责人: 大前 陽輔
• 金额: $ 3万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-26 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J10599/
• 关键词: 結核症; ゲノムワイド関連解析; 菌体ゲノム; 宿主ゲノム; タイ王国; 結核; 国際情報交換

本研究計画の目的は、結核菌による感染症である結核症について、病状の発症並びに薬剤治療有効性に与る宿主の遺伝的要因を、結核菌の遺伝的背景の情報と患者のゲノム情報とを統合的に解析することで、結核菌の遺伝的背景ごとに特徴的な感染メカニズムや薬剤治療応答メカニズムを明らかにすることである。これまで、受入研究室の先行研究によるゲノムワイド関連解析（GWAS）により同定されていた若年性結核における発症関連因子MAFBに対して、結核菌の遺伝的背景の情報を加えた解析を行い、特定の遺伝系統でのみ発症関連遺伝子MAFBのリスクが有意に上昇することの再現性を得た。本成果は結核症のリスク遺伝要因を同定するうえで、病原菌である結核菌のゲノム情報も考慮することが重要であることを示しており、本年度に開催された第１３回国際人類遺伝学会にて口頭発表を行った。さらに本年度は、MAFB以外の宿主の結核発症リスク遺伝子についても解析を進め、タイ王国で収集した北京型株感染患者270例、非北京型株感染患者420例、健常者782例によるゲノムワイド関連解析の結果、1番染色体13pの領域に非北京型株感染群で老年性の結核発症とより強い関連を示すSNPを見出し、このSNPは多重検定の補正を考慮しても有意であった。対してこのSNPは北京型感染患者群では有意な関連を示さなかった。当該SNPは白血球の細胞表面抗原の一種を発現する遺伝子の近傍に位置しており、その遺伝子は先行研究で細胞への結核菌感染実験において発現量が変動する遺伝子にリストされていたが、これまでヒトにおける結核発症との関連は報告されておらず、新規の結核発症の分子機構を示唆するに至った。

In this study, the purpose of this study is to analyze the causes of sexual and host diseases, the background and the background of the infection of sclerotiorum, the background of the infection of sclerotiorum and the background of the infection of sclerotiorum. Results the background of Sclerotinia sclerotiorum was special for the treatment of infection. In the first place, the laboratory was enrolled in the laboratory to study the etiology of the disease (GWAS). In the same way, the background of MAFB and Rhizoctonia sclerotiorum were analyzed in the same way. The background of the disease was analyzed, and the MAFB test was intended to be registered in a specific system. The results show that the etiology of the disease is due to the identification of the disease, the pathogen and the pathogen. The important information of the disease is very important. This year, we will urge you to return to China for 13 years. This year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of MAFB, the results of the analysis of the results of the analysis, the results of the analysis of the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of this year, the results of the analysis of the results of the The results were as follows: (1) in the group of non-Beijing strain infection in the field of chromosome 13p, the results of senile nuclear disease strongly showed that SNP was found and SNP was detected. The group of patients with SNP infection in Beijing is interested in showing signs of infection. When the SNP detects the cell surface antigen in the vicinity of the cell surface antigen, the cell surface antigen is detected in the vicinity of the cell surface antigen, the cell surface antigen, the According to the new regulations, the molecular mechanism of nuclear disease has indicated and abetted the disease.

项目成果

Pathogen lineage based genome-wide analysis of host genetic risk factorｓ in tuberculosis

基于病原体谱系的结核病宿主遗传危险因素的全基因组分析

• 发表时间: 2016
• 作者: 大前陽輔;Surakameth Mahasirimongkol;豊岡理人;野内英樹;Supalert Nedsuwan;Sukanya Wattanapokayakit;Nat Smittipat;Prasit Paliittapongarnpim;Pathom Sawanpanyalert;Nuanjun Wichukchinda;Ekawat Pasomsub;莚田泰誠;久保充明;徳永勝士
• 通讯作者: 徳永勝士

Pathogen lineage based analysis of host genetic risk factor in young onset tuberculosis.

基于病原体谱系的年轻发病结核病宿主遗传危险因素分析。

• 发表时间: 2016
• 作者: Omae Y;Mahasirimongkol S;Toyo-oka L;Yanai H;Nedsuwan S;Wattanapokayakit S;Smittipat N;Paliittapongarnpim P;Sawanpanyalert P;Wichukchinda N;Pasomsub E;Mushiroda T;Kubo M;Tokunaga K
• 通讯作者: Tokunaga K

ヤルシ大学(インドネシア)

雅西大学（印度尼西亚）

Principles and Practice of Genome-wide Association Study (ゲノムワイド関連解析の原理と実際）

全基因组关联研究的原理与实践

• 发表时间: 2015
• 期刊: 特集；内分泌科医が理解しておきたい遺伝学の新しい潮流、ホルモンと臨床
• 作者: 大前陽輔;徳永勝士
• 通讯作者: 徳永勝士

タイ保健省医科学局/マヒドン大学(タイ)

泰国卫生部医学科学系/玛希隆大学（泰国）