Comprehensive analysis of mutant mammalian cells using barcode vector

使用条形码载体综合分析突变哺乳动物细胞

• 批准号: 23650235
• 负责人: HORIE Kyoji
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23650235/
• 关键词: 発生工学; ES細胞; バーコード; 変異体

We previously developed a method for rapid isolation of a large number of homozygous mutant mouse ES cell lines. However, we realized that phenotypic analysis of each mutant cell line is a labor-intensive process. In the current study, we have constructed a barcode vector library in which each vector contains a unique nucleotide sequence, and labeled each homozygous mutant cell line with different barcode sequence. This allowed us to evaluate the ratio of each mutant cell line among entire population of a pool of mutant cells using each barcode sequence as an index to represent the corresponding mutant cell line, leading to a rapid phenotypic analysis with pooled cells.

我们之前开发了一种快速分离大量纯合突变小鼠 ES 细胞系的方法。然而，我们意识到每个突变细胞系的表型分析是一个劳动密集型的过程。在本研究中，我们构建了一个条形码载体库，其中每个载体都包含独特的核苷酸序列，并用不同的条形码序列标记每个纯合突变细胞系。这使我们能够使用每个条形码序列作为代表相应突变细胞系的索引来评估突变细胞池整个群体中每个突变细胞系的比例，从而对池细胞进行快速表型分析。

项目成果

変異ES細胞については、研究室のホームページにおいて、リストを公開している。

实验室网站上公布了突变型 ES 细胞的列表。