Elucidation of mechanism of molecular dynamics recognition by RNA machineries involved in the thermostable RNA maturation

阐明参与热稳定性 RNA 成熟的 RNA 机器的分子动力学识别机制

• 批准号: 24770125
• 负责人: HIRATA Akira
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24770125/
• 关键词: 酵素の基質認識機構; 酵素の生理機能; tRNAプロセシング; アーキア; RNA成熟マシナリー; アーキア（古細菌）; 構造生物学; 遺伝学; 生化学; RNA成熟

Structural and functional analyses of tRNA splicing enzyme (EndA) from ultra-small archaeon, ARMAN-2, revealed that ARMAN-2 specific loop is involved in the broad substrate specificity of ARMAN-2 EndA. On the other hands, structural, biochemical and genetic analyses of tRNA (m2G10/m22G10) methyltransferase (arcTrm11) in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis showed that the crystal structure of arcTrm11 consists of two domains, N-terminal THUMP domain which is involved in the RNA recognition and C-terminal Rossman fold-type catalytic domain, and that arcTrm11 gene is essential for cell viability at high temperature.

对来自超小型古菌ARMAN-2的tRNA剪接酶（EndA）的结构和功能分析表明，ARMAN-2特异性环参与了ARMAN-2 EndA的广泛底物特异性。另一方面，对超嗜热古细菌kodakarensis热球菌tRNA （m2G10/m22G10）甲基转移酶（arcTrm11）的结构、生化和遗传分析表明，arcTrm11的晶体结构由参与RNA识别的n端THUMP结构域和c端Rossman折叠型催化结构域两个结构域组成，表明arcTrm11基因对细胞在高温下的生存至关重要。

项目成果

世界最小クラスの生命体ARMANにおける4番目のタイプのtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼのX線結晶構造解析

世界上最小的生物体 ARMAN 中第四类 tRNA 剪接核酸内切酶的 X 射线晶体结构分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 平田章;藤島皓介;山上龍太;河村卓哉;JF.Banfield;堀弘幸
• 通讯作者: 堀弘幸

超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来tRNATrpの修飾ヌクレオシド分析

超嗜热古菌 Thermococcus kodakarensis tRNATrp 的修饰核苷分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 前田雄太;平田 章;長野倫子;土手智裕;鈴木健夫;金井保;鈴木勉;堀弘幸
• 通讯作者: 堀弘幸

Structural insight into the evolution and broad substrate specificity of the fourth type of tRNA splicing endonuclease

第四种 tRNA 剪接核酸内切酶的进化和广泛底物特异性的结构洞察

• 发表时间: 2012
• 作者: A. Hirata;K. Fujishima;R. Yamagami;T. Kawamura;J. F. Banfiled;A. Kanai;and H. Hori
• 通讯作者: and H. Hori

世界最小クラスの生命体ARMANにおける４番目のタイプのtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼのX線結晶構造解析

世界上最小的生物体 ARMAN 中第四类 tRNA 剪接核酸内切酶的 X 射线晶体结构分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 平田 章;藤島皓介;山上龍太;河村卓哉;JF. Banfield;堀 弘幸
• 通讯作者: 堀 弘幸

世界最小クラスの生命体ARMANのRNA介在配列除去システムの構造を解明しました

我们已经阐明了世界上最小的生物体 ARMAN 的 RNA 介导的序列去除系统的结构。