Array-basierte SNP-Analyse bei der akuten myeloischen Leukämie des Erwachsenen mit normalem Karyotyp zur Identifizierung genomischer Imbalancen und uniparentaler Disomien
Array-basierte SNP-Analyse bei der akuten myeloischen Leukämie des Erwachsenen mit normalem Karyotyp zur Identifizierung genomischer Imbalancen und uniparentaler Disomien
批准号:
54718880
负责人:
Professorin Dr. Konstanze Döhner, since 6/2010
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2008
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2007-12-31 至 2010-12-31
中文摘要
约45-50%急性骨髓性白血病Leukämien (AML)在erwachsenalalter weisen der常规中Chromosomen-Bänderungsanalyse einen正常核型auf。Innerhalb dieser großen Gruppe sind in den letzten Jahren Mutationen in iner Reihe von Genen (u.a FLT3, NPM1, CEBPA, RAS)鉴定[j]。Diese Erkenntnisse resultierten in einem besseren Verständnis der molecular ularen Pathogenese, in der Identifizierung von neuen prognostischen Markern sowie in der Entwicklung molecular Therapien (Einsatz von fl03 - inhibitoren)。在假设条件下,不受约束的突变存在。单核苷酸多态性(snp)的dna序列分析,mit der neue genomische Veränderungen identifiziert werden können。单核苷酸多态性芯片的分析,分析了单核苷酸多态性芯片的特征,并对其进行了分析。部分单亲人才失调(UPD)。研究人员利用niedrig auflösenden SNP-Chip Analysen (10k)进行分析,发现约15-20%的AMLs存在正常核型zum Zeitpunkt诊断vorligen的upd。Ziele de beantragten projects: 1;正常核型mittel 250个AMLs的UPDs和基因组不平衡(Deletionen /Duplikationen)鉴定hochauflösender 500k snp芯片技术2. 区域候选基因的鉴定及其与全球基因表达分析3. 基因不平衡对FISH基因突变的验证、候选基因对共识缺失区的分析和4。分子间的相互关系。
英文摘要
Ca. 45-50% der akuten myeloischen Leukämien (AML) im Erwachsenenalter weisen in der konventionellen Chromosomen-Bänderungsanalyse einen normalen Karyotyp auf. Innerhalb dieser großen Gruppe sind in den letzten Jahren Mutationen in einer Reihe von Genen (u.a. FLT3, NPM1, CEBPA, RAS) identifiziert worden. Diese Erkenntnisse resultierten in einem besseren Verständnis der molekularen Pathogenese, in der Identifizierung von neuen prognostischen Markern sowie in der Entwicklung molekularer Therapien (Einsatz von FLT3-Inhibitoren). Hypothese ist, dass weitere, bislang unbekannte Mutationen existieren. Die array-basierte genomweite Analyse von Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) ist eine Methode, mit der neue genomische Veränderungen identifiziert werden können. Die SNP-Chip Analyse erlaubt die Identifizierung submikroskopischer Deletionen/Duplikationen, sowie den Verlust der Heterozygotie [LOH] resultierend aus sog. partiellen uniparentalen Disomien (UPD). Pilotstudien mit niedrig auflösenden SNP-Chip Analysen (10k) deuten daraufhin, dass UPDs in ca. 15-20% der AMLs mit normalem Karyotyp zum Zeitpunkt der Diagnose vorliegen. Ziele des beantragten Projektes sind: 1. Identifizierung von UPDs und genomischen Imbalancen (Deletionen /Duplikationen) bei 250 AMLs mit normalem Karyotyp mittels hochauflösender 500k SNP-Chip Technologie; 2. Identifizierung von Kandidatengenen aus Regionen mit UPD mittels globaler Genexpressionsanalysen; 3. Validierung von genomischen Imbalancen mittels FISH sowie Mutationsanalysen von Kandidatengenen aus Konsensus-Deletionsregionen; sowie 4. Korrelation der molekularen Befunde mit klinischen Daten.
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