Array-basierte SNP-Analyse bei der akuten myeloischen Leukämie des Erwachsenen mit normalem Karyotyp zur Identifizierung genomischer Imbalancen und uniparentaler Disomien

对正常核型成人急性髓性白血病进行基于芯片的 SNP 分析，以识别基因组失衡和单亲二体性

• 批准号: 54718880
• 负责人: Professorin Dr. Konstanze Döhner, since 6/2010
• 金额: --
• 依托单位: Klinik für Innere Medizin III
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2007-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/54718880?language=en
• 关键词: Array; basierte; SNP; Analyse; bei

Ca. 45-50% der akuten myeloischen Leukämien (AML) im Erwachsenenalter weisen in der konventionellen Chromosomen-Bänderungsanalyse einen normalen Karyotyp auf. Innerhalb dieser großen Gruppe sind in den letzten Jahren Mutationen in einer Reihe von Genen (u.a. FLT3, NPM1, CEBPA, RAS) identifiziert worden. Diese Erkenntnisse resultierten in einem besseren Verständnis der molekularen Pathogenese, in der Identifizierung von neuen prognostischen Markern sowie in der Entwicklung molekularer Therapien (Einsatz von FLT3-Inhibitoren). Hypothese ist, dass weitere, bislang unbekannte Mutationen existieren. Die array-basierte genomweite Analyse von Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) ist eine Methode, mit der neue genomische Veränderungen identifiziert werden können. Die SNP-Chip Analyse erlaubt die Identifizierung submikroskopischer Deletionen/Duplikationen, sowie den Verlust der Heterozygotie [LOH] resultierend aus sog. partiellen uniparentalen Disomien (UPD). Pilotstudien mit niedrig auflösenden SNP-Chip Analysen (10k) deuten daraufhin, dass UPDs in ca. 15-20% der AMLs mit normalem Karyotyp zum Zeitpunkt der Diagnose vorliegen. Ziele des beantragten Projektes sind: 1. Identifizierung von UPDs und genomischen Imbalancen (Deletionen /Duplikationen) bei 250 AMLs mit normalem Karyotyp mittels hochauflösender 500k SNP-Chip Technologie; 2. Identifizierung von Kandidatengenen aus Regionen mit UPD mittels globaler Genexpressionsanalysen; 3. Validierung von genomischen Imbalancen mittels FISH sowie Mutationsanalysen von Kandidatengenen aus Konsensus-Deletionsregionen; sowie 4. Korrelation der molekularen Befunde mit klinischen Daten.

约45-50%的急性骨髓白血病（AML）患者在常规染色体组分析中表现为正常核型。这一大集团在最近几年里发生了一次基因突变。FLT 3、NPM 1、CEBPA、RAS）沃登。该研究结果可用于分子病原体的最佳识别，用于分子治疗的新靶向标记物的鉴定（FLT 3抑制剂的筛选）。假设这是一个未知的突变。单核苷酸多态性（SNPs）基因组芯片分析是一种新的韦尔登方法。SNP-芯片分析用于鉴定微卫星缺失/复制，从而验证杂合性[洛]结果。partiellen unipartentalen Disomien（UPD）.通过使用新的SNP芯片分析（10 k）进行中试研究，结果在大约。15-20%的AML核型正常，可用于诊断。Ziele des beantragten Projektes sind：1.使用500 k SNP芯片技术对250例正常核型AML患者进行基因缺失和基因组不平衡（缺失/复制）鉴定; 2.通过UPD全球基因表达分析识别地区的Kandidatengenen; 3. FISH检测基因组不平衡的突变分析;见4。分子与线性数据的相关性。