ゲノム「改編」とゲノム「安定維持」を両立可能とさせる分子メカニズム

实现基因组“重组”和基因组“稳定维持”的分子机制

• 批准号: 22K06336
• 负责人: 田中 誠司
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kochi University of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06336/
• 关键词: ゲノム安定維持; ゲノム改変; ゲノム維持; DNA複製; ゲノム改編; Rループ

ゲノム改変と安定維持を両立させているモデル領域とした出芽酵母CUP1領域について、そのコピー数変動メカニズムを明らかにするため、1. CUP1コピー数増加条件下において、下記因子の欠損（生育必須遺伝子についてはhypomorph変異）が及ぼす影響を解析した。a) DNA２本鎖切断（dsb）修復にかかわる因子；b) RNAループ解消に関わるとされるRNaseHとヘリカーゼ；c) CUP1領域内に存在する複製起点のコンセンサスであるACS配列（複製起点としての能力を喪失させると予想される変異）その結果、1-a: 相同組換え（HR）に関わる因子の欠損では著しいコピー数増加の抑制が見られた。一方、非相同末端結合（NHEJ）に関わる因子の欠損は顕著な影響を示さなかった。また、HRに必須のRad51タンパクが存在しない条件下においてもわずかではあるがコピー数増加が見られたため、HR以外にもコピー数増加にかかわる経路があることが示唆された。SSAが関与することを予想し、解析を継続中。1-b): これらの因子が欠損あるいは変異した細胞では、コピー数増加が促進された。このことは、本研究開始時に予測したモデルが正しいことを示唆する。一方、複数存在するRNaseHにおいては、その影響が異なっていたことより、これらの因子間での役割分担が存在することが示唆された。1-c): 出芽酵母パブリックデータベースであるSGDで示された本領域内複製起点ARS810にあるACSを変異させても、コピー数増加には影響がなかった。一方、ARS810の位置については、SGDのものと異なる予測もあるため、そちらのACSを置換したところ、コピー数増加がやや抑制された。この結果を受け、本領域内の複製起点の同定を進めている。2. その他の解析は進行中。コピー数現象を検出する系について新たに着想したため、モデル系を構築中である。

The change of the number of changes in the number of changes. CUP1: Analysis of the effect of hypomorph on fertility under the condition of increasing the number of factors a) DNA2 lock cut (dsb) repair factor;b) RNA release factor;c) ACS alignment (replication origin and loss of ability) in CUP1 domain; 1-a: loss of factor in same composition (HR); increase in inhibition factor. A party, non-identical terminal combination (NHEJ) is a factor of loss and influence. For example, HR must have Rad51. Under the condition that it exists, the number of Rad 51 increases, and HR increases. SSA is a very important tool for understanding and understanding. 1-b): The number of cells in the cell is increased due to the deficiency of the factor. This study was conducted at the beginning of 2010. A party, a plurality of RNase H, a group of factors, a group of factors 1-c): budding yeasts are the origin of replication in the field ARS810, ACS is different, and the number of budding yeasts increases. The position of ARS810 is different from that of SGD. The result of this process is received, and the starting point of replication in this field is determined. 2. His analysis is ongoing. The number of phenomena in the system is new, and the system is in the process of construction.

项目成果

Dimerization of Firing Factors for Replication Origin Activation in Eukaryotes: A Crucial Process for Simultaneous Assembly of Bidirectional Replication Forks?

• DOI: 10.3390/biology11060928
• 发表时间: 2022-06-17
• 期刊: Biology
• 影响因子: 4.2

Identification of atypical replication origin in the metallothionein-encoding repeats in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae

芽殖酵母酿酒酵母中金属硫蛋白编码重复序列中非典型复制起点的鉴定

• 发表时间: 2022
• 作者: Tanaka Seiji;Ogawa Shiho;Seiji Tanaka
• 通讯作者: Seiji Tanaka

Identification of novel type replication origin in the CUP1 repeats in budding yeast

芽殖酵母 CUP1 重复序列中新型复制起点的鉴定

• 发表时间: 2022
• 作者: Tanaka Seiji;Ogawa Shiho;Seiji Tanaka;Seiji Tanaka
• 通讯作者: Seiji Tanaka