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Chip-basierte DNA- und RNA-Analyse Plattform

基于芯片的 DNA 和 RNA 分析平台

基本信息

批准号：
90826012
负责人：
金额：
--
依托单位：
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
依托单位国家：
德国
项目类别：
Major Research Instrumentation
财政年份：
2008
资助国家：
德国
起止时间：
2007-12-31 至无数据
项目状态：
未结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/90826012?language=en
关键词：
Chip basierte DNA und RNA

项目摘要

Ein Ziel des ZBSA ist die Erhebung quantitativer Daten von vielen Systemkomponenten und die anschließende Integration der Daten in prädiktive Modelle. Einen wichtigen Eckpfeiler für die Primärdatenerhebung stellen die vier Kernkompetenzen Genomics, Proteomics, Life Imaging und Metabolomics dar. Um die erfolgreiche Durchführung der erwähnten Projekte zu ermöglichen und die zuvor beschriebenen systembiologischen Fragestellungen als Core Facility Genomics im Rahmen des ZBSA erfolgreich bearbeiten zu können, müssen wir eine Primärdatenerhebung gewährleisten, die zum einen vergleichbare Daten auf internationalem Niveau generiert und zum anderen die Vielfalt der geforderten Analysen im Bereich der Hochdurchsatz-Datenerhebung gewährleistet. Die Analyseplattform gewährleistet die zuvor erwähnte Vergleichbarkeit und Reproduzierbarkeit der generierten Daten. Dies beinhaltet im Bereich der Genotypisierung von SNPs, basierend auf der Vielfalt der möglichen Chips in Kombination mit dem Custom-Made-Design eine effiziente und erfolgreiche Durchführung von Whole Genome Assoziationsstudien. Des Weiteren stellt die SNP basierte Analyse von Aberrationen der Plattform (SNP-CGH) in Kombination mit der Analyse von CNVs eine Erweiterung der bisherigen Array-CGH Techniken dar. Eine weitere Besonderheit der beantragten Plattform ist die Analyse von in Formalin/Paraffin fixierten Gewebeproben mittels des DASL-Systems. Das zuvor genannte Applikationsspektrum der Plattform stellt besonders im Bereich der Genotypisierung von SNPs (tag SNPs) eine entscheidende Erweiterung für den Forschungsstandort Freiburg und insbesondere für die Datenerhebung im ZBSA dar.

Ein Ziel des ZBSA ist die Erhebung定量数据分析系统组件分析和数据分析在prädiktive模型中的集成。基因组学，蛋白质组学，生命成像和代谢组学研究进展。Um die erfolgreiche durchchfhhrung der erwähnten项目ermöglichen和die zuvorbeskleebenen系统生物学家Fragestellungen核心设施基因组学在Rahmen des ZBSA erfolgreich bearbebezu können， mssen wir eine Primärdatenerhebung gewährleisten， die zumeinen vergleichbare Daten aufinternationalniveau generiert和zumeververchafeter geforderderanalysen在berich der Hochdurchsatz-Datenerhebung gewährleistet。模具分析平台gewährleistet Die zuvor erwähnte Vergleichbarkeit和ereduzierbarkeit der genergenererten Daten。本文主要研究了基因型分析、基因型分析、基因型分析、基因型分析和基因型分析等方面的问题。基于SNP的单核苷酸多态性分析平台（SNP- cgh）与基于SNP的单核苷酸多态性分析平台（SNP- cgh）相结合。用甲醛/石蜡固形物对DASL-Systems公司的产品进行分析。参考文献1 .德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国