Chip-basierte DNA- und RNA-Analyse Plattform
Chip-basierte DNA- und RNA-Analyse Plattform
批准号:
90826012
负责人:
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Major Research Instrumentation
财政年份:
2008
资助国家:
德国
项目状态:
未结题
起止时间:
2007-12-31 至 --
中文摘要
Ein Ziel des ZBSA is die Ehebung Quantiantiver Daten von vielen Systemkomponenten and die anschlieçende Integration der Daten in Prädiktive Modelle.Einen wichtigen Eck pfeiler für die Primärdatenerheung stellen die vier Kernkompetenzen Genome,Protetics,Life Imagine and Metoxology DAR.从系统生物学和系统生物学的角度,分析了ZBSA的核心设施基因组学,并在此基础上提出了一种新的数据分析方法。分析平台Gewährleistet die zuvor erwähnte Vergleichbarkeit and Reproduduzierbarkeit der Generierten Daten.在Kombination MIT DEM定制设计eine Eine ffiziente and erfolgreiche Durchführung von整个基因组关联研究中,Bereich和Genypisierung von SNPs,Vielfalt der möglichen芯片的基础上进行了研究。在Kombination MIT Der Analyst von CNvs eine Erweiterung der Biisherigen阵列-CGH Techniken DAR中,DES Weiteren stellt die SNP basierte analyst von Aberarien en der Plattform(SNP-CGH)分析von CNvs eine Erweiterung der Bisherigen阵列-CGH Techniken DAR。在福尔马林/石蜡滤纸体系中对豆类平台上的VON进行分析。Das zuvor genannte ApplicationsSpektrum der Plattform Stellt Bereich der Genypisierung von SNPs(Tag SNPs)eine entschedende Erweiterung für den ForschungsStandort Freiburg and insbebeondere für die Datenerhebung im ZBSA dar.
英文摘要
Ein Ziel des ZBSA ist die Erhebung quantitativer Daten von vielen Systemkomponenten und die anschließende Integration der Daten in prädiktive Modelle. Einen wichtigen Eckpfeiler für die Primärdatenerhebung stellen die vier Kernkompetenzen Genomics, Proteomics, Life Imaging und Metabolomics dar. Um die erfolgreiche Durchführung der erwähnten Projekte zu ermöglichen und die zuvor beschriebenen systembiologischen Fragestellungen als Core Facility Genomics im Rahmen des ZBSA erfolgreich bearbeiten zu können, müssen wir eine Primärdatenerhebung gewährleisten, die zum einen vergleichbare Daten auf internationalem Niveau generiert und zum anderen die Vielfalt der geforderten Analysen im Bereich der Hochdurchsatz-Datenerhebung gewährleistet. Die Analyseplattform gewährleistet die zuvor erwähnte Vergleichbarkeit und Reproduzierbarkeit der generierten Daten. Dies beinhaltet im Bereich der Genotypisierung von SNPs, basierend auf der Vielfalt der möglichen Chips in Kombination mit dem Custom-Made-Design eine effiziente und erfolgreiche Durchführung von Whole Genome Assoziationsstudien. Des Weiteren stellt die SNP basierte Analyse von Aberrationen der Plattform (SNP-CGH) in Kombination mit der Analyse von CNVs eine Erweiterung der bisherigen Array-CGH Techniken dar. Eine weitere Besonderheit der beantragten Plattform ist die Analyse von in Formalin/Paraffin fixierten Gewebeproben mittels des DASL-Systems. Das zuvor genannte Applikationsspektrum der Plattform stellt besonders im Bereich der Genotypisierung von SNPs (tag SNPs) eine entscheidende Erweiterung für den Forschungsstandort Freiburg und insbesondere für die Datenerhebung im ZBSA dar.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1038/ismej.2010.67
发表时间:
2010-11-01
期刊:
ISME JOURNAL
影响因子:
11
作者:
[Mohr, Remus, Voss, Bjoern, Hess, Wolfgang R.]
通讯作者:
Hess, Wolfgang R.
DOI:
10.1038/ismej.2011.199
发表时间:
2012-07-01
期刊:
ISME JOURNAL
影响因子:
11
作者:
[Pfreundt, Ulrike, Stal, Lucas J., Hess, Wolfgang R.]
通讯作者:
Hess, Wolfgang R.
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