Multi-modal cell type atlases of somatosensory spinal cord neurons
体感脊髓神经元多模态细胞类型图谱
基本信息
- 批准号:10508739
- 负责人:
- 金额:$ 0.64万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2022
- 资助国家:美国
- 起止时间:2022-07-15 至 2022-08-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AtlasesCellsCellular MorphologyChemicalsClassificationCodeCoupledDataData CollectionData SetElectrophysiology (science)EsthesiaExhibitsGene Expression ProfileHeterogeneityIndividualInterneuronsLabelLinkLocationLogisticsMapsModalityMorphologyMusNeuronsPainPatternPhenotypePhysiologicalPosterior Horn CellsPropertyPruritusSamplingSensoryShapesSpinalSpinal CordTechniquesTemperatureTouch sensationbasecell typechronic itchchronic paindorsal horndroplet sequencingelectrical propertyexcitatory neuroninhibitory neuronmultimodal datamultimodalitynovelpatch clamppatch sequencingsingle-cell RNA sequencingsomatosensorytranscriptometranscriptomics
项目摘要
PROJECT SUMMARY/ABSTRACT
The major objective of this proposal is to classify somatosensory neurons in a more integrated manner by
capturing the transcriptomic, electrophysiological, and morphological properties of individual neurons in the
spinal dorsal horn (SDH) using the Patch-seq technique. The SDH is critical for processing distinct modalities of
sensation, such as touch, temperature, chemical, itch, and pain. Neurons in SDH are heterogenous and
composed of a vast majority of excitatory and inhibitory interneurons that exhibit a wide range of morphological,
physiological, and transcriptomic properties. Cell-type classification in the SDH provides a logistical and
conceptual framework for understanding how cells and circuits govern somatic sensation. Attempts to classify
neurons include morphological and/or electrophysiological properties, and more recently by transcriptomic
features. However, linking transcriptomically defined cell types in SDH to their electrophysiological/morphological
phenotypes remains a major challenge. The single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) coupled with patch clamp
recording (Patch-seq) is a powerful approach that enables one to directly relate the transcriptomic features of a
given neuron to the phenotypes of the same neuron, e.g., the neuron’s precise location, morphology,
electrophysiological properties, and the functions. In the preliminary study, we have successfully used this
technique to sample SDH neurons and acquired the neuron’s intrinsic firing properties and reconstructed
morphology from patched neurons. In this proposal, we will use the Patch-seq technique to classify
somatosensory neuron types in a more integrated manner by capturing the transcriptomic, electrophysiological,
and morphological properties of individual neurons in mouse SDH. Our proposed study will bridge the missing
link between transcriptomically defined cell types and morphological/electrophysiological properties of
somatosensory neurons in the SDH, which provide a critical stepping-stone for illustrating how the SDH codes
and relays distinct sensory modalities and how disruption of sensory processing in the SDH causes chronic pain
and itch.
项目总结/摘要
这项建议的主要目标是分类体感神经元在一个更综合的方式,
捕捉转录组,电生理学,和形态学特性的个别神经元中,
脊髓背角(SDH)使用Patch-seq技术。SDH对于处理不同的模式至关重要
感觉,如触摸、温度、化学物质、瘙痒和疼痛。SDH中的神经元是异质的,
由绝大多数兴奋性和抑制性中间神经元组成,
生理学和转录组学特性。SDH中的细胞类型分类提供了逻辑和
理解细胞和回路如何支配躯体感觉的概念框架。尝试分类
神经元包括形态学和/或电生理学特性,并且最近通过转录组学,
功能.然而,将SDH中转录组学定义的细胞类型与它们的电生理/形态学联系起来,
表型仍然是一个重大挑战。单细胞RNA测序与膜片钳技术联用
记录(Patch-seq)是一种强大的方法,它使人们能够直接将转录组学特征与基因组学特征联系起来。
给定神经元与相同神经元的表型,例如,神经元的精确位置,形态
电生理特性和功能。在初步研究中,我们成功地利用了这一点,
技术采集SDH神经元,获取神经元的内在放电特性,
来自补丁神经元的形态学。在本提案中,我们将使用Patch-seq技术来分类
躯体感觉神经元类型以更整合的方式通过捕获转录组,电生理,
和小鼠SDH中单个神经元的形态学特性。我们提议的研究将弥补
转录组学定义的细胞类型与细胞形态学/电生理学特性之间的联系
SDH中的躯体感觉神经元,这为说明SDH如何编码提供了关键的垫脚石
并传递不同的感觉方式,以及SDH中感觉处理的中断如何导致慢性疼痛
还很痒
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Lingyong Li其他文献
Lingyong Li的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Lingyong Li', 18)}}的其他基金
Targeting Tiam1-mediated synaptic plasticity for the relief of opioid tolerance
靶向 Tiam1 介导的突触可塑性以缓解阿片类药物耐受
- 批准号:
10800301 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
The conserved mechanisms underlying different types of chronic pain
不同类型慢性疼痛的保守机制
- 批准号:
10677714 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Multi-modal cell type atlases of somatosensory spinal cord neurons
体感脊髓神经元多模态细胞类型图谱
- 批准号:
10743857 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Targeting Tiam1-mediated synaptic plasticity for the relief of opioid tolerance
靶向 Tiam1 介导的突触可塑性以缓解阿片类药物耐受
- 批准号:
10512217 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Alternative polyadenylation(APA) mechanisms of comorbid mood disorders in chronic pain
慢性疼痛共病情绪障碍的替代多聚腺苷酸化(APA)机制
- 批准号:
10572902 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
The conserved mechanisms underlying different types of chronic pain
不同类型慢性疼痛的保守机制
- 批准号:
10747177 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
相似国自然基金
分化肌细胞脱细胞ECM-cells sheet 3D
支架构建及其促进容积性肌组织缺损再
生修复应用及机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:10.0 万元
- 项目类别:省市级项目
CAFs-TAMs-tumor cells调控在HRHPV感染致癌中的作用机制研究及AI可追溯预测模型建立
- 批准号:
- 批准年份:2020
- 资助金额:56 万元
- 项目类别:面上项目
S100A8/A9--Myeloid cells特异性可溶性表氧化物水解酶(sEH)基因敲除改善胰岛素抵抗的新靶点
- 批准号:82070825
- 批准年份:2020
- 资助金额:53 万元
- 项目类别:面上项目
Leader cells通过CCL5调控糖酵解及基质硬度促进结直肠癌集体侵袭的 作用机制
- 批准号:81903002
- 批准年份:2019
- 资助金额:20.5 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
HA/CD44在乳腺癌转移“先导细胞”(leader cells)侵袭中的作用及机制研究
- 批准号:81402419
- 批准年份:2014
- 资助金额:23.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
双模式编码的慢病毒载体转染C6 Glioma Cells的影像学研究
- 批准号:81271563
- 批准年份:2012
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
树突状细胞(Dendritic cells,DCs)介导的黏膜免疫对猪轮状病毒(PRV)感染的分子作用机制研究
- 批准号:31272541
- 批准年份:2012
- 资助金额:82.0 万元
- 项目类别:面上项目
MTA2在睾丸支持细胞(Sertoli cells)中的功能和机制研究
- 批准号:31271248
- 批准年份:2012
- 资助金额:80.0 万元
- 项目类别:面上项目
无外源性基因iPS cells向肠细胞分化及对肠损伤的修复
- 批准号:81160050
- 批准年份:2011
- 资助金额:49.0 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
相似海外基金
Investigating bioengineering approaches to produce immuno-modulatory mesenchymal stromal cells and their extracellular vesicle
研究生产免疫调节间充质基质细胞及其细胞外囊泡的生物工程方法
- 批准号:
2608627 - 财政年份:2025
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Studentship
Next Generation Fluorescent Tools for Measuring Autophagy Dynamics in Cells
用于测量细胞自噬动态的下一代荧光工具
- 批准号:
DP240100465 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Discovery Projects
Dissecting the heterogeniety of human tissue-resident memory T cells
剖析人体组织驻留记忆 T 细胞的异质性
- 批准号:
DE240101101 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Discovery Early Career Researcher Award
Recyclable, smart and highly efficient wire-shaped solar cells waved portable/wearable electronics
可回收、智能、高效的线形太阳能电池挥舞着便携式/可穿戴电子产品
- 批准号:
24K15389 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Interplay of the extracellular matrix and immune cells in lung pathology: key role for chitinase-like proteins
肺病理学中细胞外基质和免疫细胞的相互作用:几丁质酶样蛋白的关键作用
- 批准号:
MR/Y003683/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Research Grant
MARVEL-ous Extracellular vesicles carry RXLR effectors into host plant cells
MARVEL-ous 细胞外囊泡携带 RXLR 效应子进入宿主植物细胞
- 批准号:
BB/Y002067/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Research Grant
SBIR Phase I: Industrial-Scale Technology for Drug Development in Mature Human Fat Cells
SBIR 第一阶段:成熟人类脂肪细胞药物开发的工业规模技术
- 批准号:
2322443 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Standard Grant
CAREER: Understanding how hierarchical organization of growth plate stem cells controls skeletal growth
职业:了解生长板干细胞的分层组织如何控制骨骼生长
- 批准号:
2339761 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Continuing Grant
根での内外的傷害の初動対処となる新規の傷害防衛戦略"Cellsロック"
“细胞锁”是一种新的损伤防御策略,从根源上对内伤和外伤进行初步反应。
- 批准号:
24KJ2131 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Roles of immune cells derived from clonal hematopoiesis in B-cell lymphomas
克隆造血来源的免疫细胞在 B 细胞淋巴瘤中的作用
- 批准号:
24K19213 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists














{{item.name}}会员




