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Building Genomics sequencing competency across West African partners

在西非合作伙伴中建立基因组测序能力

基本信息

批准号：
MC_PC_20045
负责人：
Umberto D'Alessandro
金额：
$ 12.61万
依托单位：
London School of Hygiene & Tropical Medicine
依托单位国家：
英国
项目类别：
Intramural
财政年份：
2021
资助国家：
英国
起止时间：
2021 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=MC_PC_20045
关键词：
Building Genomics sequencing competency across

项目摘要

For our partners involved in molecular detection of Covid-19 without a sequencing facility, it will havean immediate impact. SOP and lab protocol will be shared. Access will be provided to the unit HTSand analysis using the CLIMB server and pipeline. The establishment of the genomics facilities willcontribute to the overall institutional capacity development and will involve improved staff andstakeholder skills, knowledge and experience. Data will be uploaded into open sequence datarepositories for universal open access. Links to the data generated and the platform will accompanyall reports that will also be freely accessible online.

对于我们在没有测序设施的情况下参与COVID-19分子检测的合作伙伴来说，这将产生立竿见影的影响。将共享SOP和实验室方案。将使用CLIMB服务器和管道访问单元HTSand分析。基因组学设施的建立将有助于总体机构能力的发展，并将涉及提高工作人员和利益攸关方的技能、知识和经验。数据将被上传到开放序列数据库，供普遍开放获取。所有报告都将附有与生成的数据和平台的链接，这些报告也可在网上免费查阅。

项目成果

期刊论文数量（5）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance.

DOI：
10.1126/science.abq5358
发表时间：
2022-10-07
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Circulation of respiratory viruses during the COVID-19 pandemic in The Gambia.

冈比亚 COVID-19 大流行期间呼吸道病毒的传播。

DOI：
10.12688/gatesopenres.14155.2
发表时间：
2022
期刊：
Gates open research
影响因子：
0
作者：
Jarju S
通讯作者：
Jarju S

Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Western Burkina Faso, West Africa.

DOI：
10.3390/v14122788
发表时间：
2022-12-14
期刊：
Viruses
影响因子：
0
作者：
Sawadogo Y;Galal L;Belarbi E;Zongo A;Schubert G;Leendertz F;Kanteh A;Sesay AK;Erhart A;Bañuls AL;Tarnagda Z;Godreuil S;Tinto H;Ouedraogo AS
通讯作者：
Ouedraogo AS

DOI：
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作者：
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通讯作者：
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作者：
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作者：
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作者：
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Umberto D'Alessandro其他文献

Prévention de la fibrose et du cancer du foie liés au virus de l’hépatite B en Afrique

非洲乙型肝炎病毒纤维化和癌症的预防

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
médecine/sciences
影响因子：
0
作者：
D. Cohen;Yusuke Shimakawa;Gibril Ndow;A. Sow;Ramou Njie;G. Lo;S. Ghosh;C. Toure;Saydiba Tamba;S. Mboup;Edith N. Okeke;S. Touré;M. Diop;Umberto D'Alessandro;Simon D. Taylor;Maimuna Mendy;F. Zoulim;M. Thursz;M. Lemoine;I. Chemin
通讯作者：
I. Chemin

Maternal pneumococcal nasopharyngeal carriage and risk factors for neonatal carriage after the introduction of pneumococcal conjugate vaccines in The Gambia.

冈比亚引入肺炎球菌结合疫苗后，母亲鼻咽部肺炎球菌携带和新生儿携带肺炎球菌的危险因素。

DOI：
10.1016/j.cmi.2017.07.018
发表时间：
2017
期刊：
Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
影响因子：
0
作者：
Effua Usuf;Effua Usuf;A. Bojang;Bully Camara;I. Jagne;C. Oluwalana;C. Bottomley;U. d’Alessandro;Umberto D'Alessandro;U. d’Alessandro;A. Roca;A. Roca
通讯作者：
A. Roca

Population-based validation of dihydrofolate reductase gene mutations for the prediction of sulfadoxine-pyrimethamine resistance in Uganda.

基于人群的二氢叶酸还原酶基因突变验证，用于预测乌干达磺胺多辛-乙胺嘧啶耐药性。

DOI：
10.1016/s0035-9203(03)90163-5
发表时间：
2003
期刊：
Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene
影响因子：
2.2
作者：
A. Talisuna;P. Langi;T. Mutabingwa;T. Mutabingwa;William M. Watkins;E. V. Marck;T. Egwang;Umberto D'Alessandro
通讯作者：
Umberto D'Alessandro

Clinical characteristics and outcomes of patients with cirrhosis and hepatocellular carcinoma in The Gambia, west Africa: a prospective cohort study

西非冈比亚肝硬化合并肝细胞癌患者的临床特征和结局：一项前瞻性队列研究

DOI：
10.1016/s2214-109x(23)00263-2
发表时间：
2023-09-01
期刊：
Lancet Global Health
影响因子：
18.000
作者：
Gibril Ndow;Erwan Vo-Quang;Yusuke Shimakawa;Amie Ceesay;Saydiba Tamba;Harr F Njai;Lamin Bojang;Charlotte Hateley;Yuki Takao;Emmanuel Opoku;Zakary Warsop;Patrick Ingiliz;Umberto D'Alessandro;Isabelle Chemin;Maimuna Mendy;Mark Thursz;Ramou Njie;Maud Lemoine
通讯作者：
Maud Lemoine

FRI-418 10-year clinical outcomes in chronic hepatitis B patients treated with tenofovir in The Gambia, West Africa

DOI：
10.1016/s0168-8278(24)02177-9
发表时间：
2024-06-01
期刊：
Conference abstract
影响因子：
作者：
Erwan Vo Quang;Gibril Ndow;Sulayman Bah;Rohey Bangura;Lamin Bojang;Bakary Dibba;Sainabou Drammeh;Alhagie Touray;Kitabu Jammeh;Isabelle Chemin;Amie Ceesay;Gavin Cloherty;Umberto D'Alessandro;Mark R. Thursz;Yusuke Shimakawa;Maud Lemoine
通讯作者：
Maud Lemoine