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Maximising the potential of wild-derived laboratory mouse strains for medical research

最大限度地发挥野生实验室小鼠品系在医学研究中的潜力

基本信息

批准号：
MR/L007428/1
负责人：
David Adams
金额：
$ 29.34万
依托单位：
Wellcome Sanger Institute
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2014
资助国家：
英国
起止时间：
2014 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=MR%2FL007428%2F1
关键词：
Maximising potential wild derived laboratory

项目摘要

Our key aim is to explore the relationship between genetic and medically relevant human disease phenotypes. One way to do this is to assess the genetic differences between long-established laboratory mouse strains. Wild-derived mouse strains display many important disease phenotypes such as resistance to various forms of cancer (e.g. liver, lung, and skin cancer), bacterial and viral infection. However, the foundation for studying the genetic differences in these strains is having accurate genome sequences. In this project, we will first generate genome sequences for the most commonly used wild-derived mouse strains and then use these sequences and knowledge of the gene structures to determine the genetic cause of observed phenotypic differences between these strains. By combining sequence and phenotypic data we will determine whether sequence variants are likely to be contributing to disease susceptibility.

我们的主要目标是探索遗传和医学上相关的人类疾病表型之间的关系。要做到这一点，一种方法是评估长期建立的实验室小鼠品系之间的遗传差异。野生来源的小鼠品系表现出许多重要的疾病表型，如对各种形式的癌症(如肝癌、肺癌和皮肤癌)、细菌和病毒感染的抵抗力。然而，研究这些菌株之间的遗传差异的基础是拥有准确的基因组序列。在这个项目中，我们将首先为最常用的野生来源的小鼠品系生成基因组序列，然后使用这些序列和基因结构的知识来确定观察到的这些品系之间表型差异的遗传原因。通过结合序列和表型数据，我们将确定序列变异是否可能有助于疾病易感性。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Impact of temporal variation on design and analysis of mouse knockout phenotyping studies.

DOI：
10.1371/journal.pone.0111239
发表时间：
2014
期刊：
PloS one
影响因子：
3.7
作者：
Karp NA;Speak AO;White JK;Adams DJ;Hrabé de Angelis M;Hérault Y;Mott RF
通讯作者：
Mott RF

Identification, Characterization, and Heritability of Murine Metastable Epialleles: Implications for Non-genetic Inheritance.

DOI：
10.1016/j.cell.2018.09.043
发表时间：
2018-11-15
期刊：
Cell
影响因子：
64.5
作者：
Kazachenka A;Bertozzi TM;Sjoberg-Herrera MK;Walker N;Gardner J;Gunning R;Pahita E;Adams S;Adams D;Ferguson-Smith AC
通讯作者：
Ferguson-Smith AC

Deep genome sequencing and variation analysis of 13 inbred mouse strains defines candidate phenotypic alleles, private variation and homozygous truncating mutations.

DOI：
10.1186/s13059-016-1024-y
发表时间：
2016-08-01
期刊：
Genome biology
影响因子：
12.3
作者：
Doran AG;Wong K;Flint J;Adams DJ;Hunter KW;Keane TM
通讯作者：
Keane TM

A strategy to identify dominant point mutant modifiers of a quantitative trait.

DOI：
10.1534/g3.114.010595
发表时间：
2014-04-17
期刊：
G3 (Bethesda, Md.)
影响因子：
0
作者：
Dove WF;Shedlovsky A;Clipson L;Amos-Landgraf JM;Halberg RB;Krentz KJ;Boehm FJ;Newton MA;Adams DJ;Keane TM
通讯作者：
Keane TM

Identification of structural variation in mouse genomes.

DOI：
10.3389/fgene.2014.00192
发表时间：
2014
期刊：
Frontiers in genetics
影响因子：
3.7
作者：
Keane TM;Wong K;Adams DJ;Flint J;Reymond A;Yalcin B
通讯作者：
Yalcin B

DOI：
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作者：
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影响因子：
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通讯作者：
P. Lasjaunias

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发表时间：
2019
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Masato Mashimo;Xiangning Bu;Kazumasa Aoyama;Jiro Kato;Hiroko Ishiwata-Endo;Linda A. Stevens;Atsushi Kasamatsu;Lynne A. Wolfe;Camilo Toro;David Adams;Thomas Markello;William A. Gahl;Joel Moss
通讯作者：
Joel Moss