Chip-basierte DNA- und RNA-Analyse Plattform

ZBSA的一个Ziel是对各种系统组件的数据进行定量分析，并在生产模型中对数据进行自动集成。Einen wichtigen Eckpfeiler für die Primärdatenerhebung stellen die维耶Kernkompetenzen Genomics，Proteomics，Life Imaging und Metabolomics dar.在ZBSA的核心设施基因组学的研究中，我们需要一个原始数据库，一个国际通用的数据库，并在Hochdurchsatz数据库中进行大量的分析。该分析平台可用于生成数据的Vergleichbarkeit和Reproduzierbarkeit。Dies beinhaltet im Bereich der Genotypsierung von SNPs，basierend auf der Vielfalt der möglichen Chips in Combination mit dem Custom-Made-Design eine effiziente and erfolgreiche Durchführung von Whole Genome Assoziationsstudien.本文介绍了一种基于SNP的平台畸变分析（SNP-CGH）与CNVs分析的联合应用，该方法是一种比较有效的阵列-CGH技术。一个新的测试平台是DASL系统中福尔马林/石蜡固定器的分析。该平台的基因分型谱主要用于弗赖堡研究的SNP（tag SNPs）基因分型，并用于ZBSA的数据采集。

Ein Ziel des ZBSA ist die Erhebung quantitativer Daten von vielen Systemkomponenten und die anschließende Integration der Daten in prädiktive Modelle. Einen wichtigen Eckpfeiler für die Primärdatenerhebung stellen die vier Kernkompetenzen Genomics, Proteomics, Life Imaging und Metabolomics dar. Um die erfolgreiche Durchführung der erwähnten Projekte zu ermöglichen und die zuvor beschriebenen systembiologischen Fragestellungen als Core Facility Genomics im Rahmen des ZBSA erfolgreich bearbeiten zu können, müssen wir eine Primärdatenerhebung gewährleisten, die zum einen vergleichbare Daten auf internationalem Niveau generiert und zum anderen die Vielfalt der geforderten Analysen im Bereich der Hochdurchsatz-Datenerhebung gewährleistet. Die Analyseplattform gewährleistet die zuvor erwähnte Vergleichbarkeit und Reproduzierbarkeit der generierten Daten. Dies beinhaltet im Bereich der Genotypisierung von SNPs, basierend auf der Vielfalt der möglichen Chips in Kombination mit dem Custom-Made-Design eine effiziente und erfolgreiche Durchführung von Whole Genome Assoziationsstudien. Des Weiteren stellt die SNP basierte Analyse von Aberrationen der Plattform (SNP-CGH) in Kombination mit der Analyse von CNVs eine Erweiterung der bisherigen Array-CGH Techniken dar. Eine weitere Besonderheit der beantragten Plattform ist die Analyse von in Formalin/Paraffin fixierten Gewebeproben mittels des DASL-Systems. Das zuvor genannte Applikationsspektrum der Plattform stellt besonders im Bereich der Genotypisierung von SNPs (tag SNPs) eine entscheidende Erweiterung für den Forschungsstandort Freiburg und insbesondere für die Datenerhebung im ZBSA dar.