Die Rolle der Transkriptionsregulator-Familie TrmB bei der Regulation des Kohlenhydrat-Stoffwechsels in Pyrococcus furiosus

转录调节因子TrmB家族在火球菌碳水化合物代谢调节中的作用

基本信息

批准号：
156019105
负责人：
Professor Dr. Michael Thomm
金额：
--
依托单位：
Lehrstuhl für Mikrobiologie und Archaeenzentrum
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2009
资助国家：
德国
起止时间：
2008-12-31 至 2013-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/156019105?language=en
关键词：
Die Rolle der Transkriptionsregulator Familie

项目摘要

Im Rahmen dieses Projektes soll schwerpunktmäßig die Rolle von zwei der insgesamt vier Proteine umfassenden Transkriptionsregulator-Familie TrmB im Zusammenhang mit der Regulation des Kohlenhydrat-Stoffwechsels in Pyrococcus furiosus genauer analysiert werden. Anhand von ChIP-Seq Experimenten sollen die Bindestellen der Regulatoren im Genom ermittelt bzw. bestätigt werden. Auf der Basis eines in unserem Labor entwickelten Plasmid-basierten Transformationssystems soll ein genetisches System für Pyrococcus furiosus aufgebaut werden. Mit Hilfe dieses Systems sollen Deletionsmutanten von diesen Regulatoren erstellt und der Phänotyp der Mutanten auf RNA- bzw. Proteinebene analysiert werden. Diese Untersuchungen werden durch in vitro Transkriptionsexperimente und Analysen zum Nachweis von DNA-Protein-Wechselwirkungen ergänzt werden. Durch die Kombination dieser in vivo und in vitro Versuche wird die bisher unbekannte Funktion des in allen Pyrococcus Arten hochkonservierten Regulators, TrmBL2, entschlüsselt werden. Mit einem ähnlichen experimentellen Ansatz soll auch die Aufgabe des zweiten Regulators, TrmBL1, bei der Kontrolle zwischen Glycolyse und Gluconeogenese aufgeklärt werden. Außerdem zeigen die bisherigen Untersuchungen, dass TrmB oder auch TrmBL1 in Abhängigkeit von den gebundenen Zielsequenzen unterschiedlich auf verschiedene Induktoren bzw. Corepressoren reagieren können. Da bisher nicht bekannt ist, welche molekularen Besonderheiten für dieses Phänomen verantwortlich sind, wird dies durch Analyse der Wirkung von Mutationen auf Protein- bzw. DNA-Ebene näher untersucht werden.

Im Rahmen dies sols of schwerpunktmäßig dies Rolle von Zwei der insgesamt vier Proteine umfassendent Transskriptionsregulator-Familie TrmB Im Zusammenhang mit der Regulation des Kohlenhydrat-Stoffwechsels in Pyrococcus furiosus genauer analyzer werden. Anhand von chip-seq persumimenten die bindestellen der调节剂BZW。 BestätigtWerden。在不繁殖的基础上，基于Entwickelten质粒 - 巴西的转化系统Soll ein Genetisches Systemfürpyrococcus furiosus furiosus aufgebaut werden。 MIT HILFE DIES系统Sollen DeletionsMutanten von Phanotypsis der Mutanten auf rna-bzw. Proteinebene分析仪Werden Durch在体外transkriptionsexperimente和分析Zum Nachweis von DNA-蛋白质Wechselwirkungen是DNA-PROTEIN-WECHSELWIRKUNGEN的一种形式。 Durch Die Kombination dieser in Vivo unt Verter Versuchwirld Die Bisher Unrevannte Funktion des in trmbl2，EntchlüsseltWerden。 Sol Auch auch aufgabe des Zweiten调节剂的缓解实验，TRMBL1，糖原和糖异生AufgeklärtWerden。 AußerdemZeigen Die Bisherigen Untersuchungen，Abhängigkeitvon von von den gebundenen Zielsepenzen untersenzen unterschiedlich unterschiedlich auf verschiedene verschiedene indchiedene induktoren bzw.的dass trmb oder auch trmbl1 CorepressorenReagierenKönnen。 Da Bisher Nicht Bekannt Ist，Welche Molekularen besonderheitenfürDiesesphänomenverantwortlich sind，wird dies dies dies dies dies dish der der der der wirkung von von von von von utationen auf auf protin- bzw. DNA-EbeneNäheruntersucht Werden。