Wechselwirkungen zwischen Domänen der archaeellen Transkriptionsmaschinerie und Vergleich mit dem eukaryotischen System

古细菌转录机制域之间的相互作用以及与真核系统的比较

基本信息

项目摘要

Die RNA Polymerase (RNAP) der Archaeen synthetisiert im Gegensatz zu den spezialisierten eukaryotischen RNA Polymerasen sowohl mRNA, als auch tRNA und rRNA. Sie weist jedoch sowohl in ihrer Quartärstruktur als auch den Sequenzen ihrer Untereinheiten große Ähnlichkeiten zur eukaryotischen RNA Polymerase II aus der Hefe auf, weshalb sie ein vorzügliches Modellsystem zur Untersuchung der eukaryotischen Transkription darstellt. Kürzlich haben wir die RNAP aus dem hyperthermophilen Archaeon Pyrococcus furiosus aus 11 rekombinant hergestellten Untereinheiten in vitro rekonstituiert. Dabei konnte ein aus 9 Untereinheiten bestehendes katalytisch aktives Kernenzym und ein Subkomplex aus den Untereinheiten E´ und F identifiziert werden. Die Untereinheiten E´und F sind homolog zu Rpb7 und Rpb4 der eukaryotischen RNAP II, die dort eine wichtige Funktion bei der Transkriptionsinitiation übernehmen. Mit Hilfe dieses rekombinanten Systems können die Wechselwirkungen und Funktionen einzelner Untereinheiten durch biochemische Untersuchungen und Mutationsstudien analysiert werden. Im Fokus stehen dabei Strukturen im aktiven Zentrum der RNAP, die Kontaktflächen des Kernenzyms mit dem E´-F Subkomplex, sowie die Wechselwirkung der einzelnen Untereinheiten mit dem Transkriptions-Initiationsfaktor TFB.
RNA聚合酶(RNAP)是一种在真核生物中合成RNA的酶,它可以特异性地聚合mRNA,也可以聚合tRNA和rRNA。我们还可以在其四分之一结构中对真核生物RNA聚合酶II进行测序,我们可以建立一个用于研究真核生物转录因子的模型系统。Kürzlich已将来自超嗜热菌的RNAP与来自11种强烈热球菌的RNAP进行了体外重组。Dabei konnte从9个Untereinheiten bestehendes katalytisch aktives Kernenzym和一个Subkomplex从Untereinheiten E '和F identifiziert韦尔登。E ′和F的非同源性与真核生物RNAP II的Rpb 7和Rpb 4同源,它们在转录起始过程中具有重要的功能。Mit Hilfe dieses rekombinanten Systems können die Wechselenkungen und Funktionen einzelner Untereinheiten durch biochemische Untersuchungen und Mutationsstudien analysiert韦尔登.在RNAP的活动中心,通过E ′-F Subkomplex的Kontaktflächen的核心结构,以及通过TFB的传输-启动因子的Wechselechtenkung的Untereinheinheiten。

项目成果

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