福山型筋ジストロフィーのロングリードシークエンサーによる診断法確立と病態解明

使用长读长测序仪建立福山肌营养不良症的诊断方法并阐明其病理学

• 批准号: 21K07789
• 负责人: 長坂 美和子
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Aijinkai Healthcare Corporation Takatsuki General Hospital Clinical Research Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07789/
• 关键词: 福山型筋ジストロフィー; ロングリードシークエンサー; SVA; レトロトランスポゾン; SVA型レトロトランスポゾン; アンチセンス療法; ゲノム編集

福山型先天性筋ジストロフィー（FCMD）は胎児期発症の重度の筋ジストロフィーに脳の形成異常や眼奇形を伴う本邦に特に多い小児難病で、本邦における患者数約2000人の劣性遺伝病である。すべての患者がフクチン(FKTN)の3’非翻訳領域にレトロトランスポゾン（SINE-VNTR-Alu；SVA）挿入変異をもつ。FCMDはその挿入変異が引き起こすスプライシング異常症である。これに対しアンチセンス療法が本邦にて開発され、治験に向け準備中である。治療法開発に伴い、早期診断・早期治療の重要性が高まってくることが予想されるが、SVA挿入変異の詳細な配列の検出はその複雑な核酸配列により容易ではなく、また罹患者の15％は複合へテロ型変異を有するため、現在の診断法には限界がある。そこで本研究では、ゲノム編集技術、ロングリードシークエンサーを駆使して迅速・正確・ロバストなFCMD患者の遺伝学的検査法を確立し、早期診断・治療に役立てることを目指す。今年度はロングリードシークエンサーであるナノポアシーケンサーを用いてSVA配列の解読を45名の患者検体で行い、Miseqによるシーケンス補正を行った。多型について現在、確認し、臨床所見との比較を行っているところである。また患者尿検体を用いた疾患筋樹立のために、尿由来幹細胞の樹立を行った。今後、筋への分化誘導も進める予定である。尿由来の幹細胞は非侵襲的で安価、簡便であり、本邦で開発されたアンチセンス療法についての治療効果判定に役立つ可能性がある。

Fukuyama congenital muscular disease (FCMD) is a severe congenital muscular disease associated with fetal development and abnormal eye shape. In this country, there are many small children with congenital muscular disease. The number of patients with this disease is about 2000. FKTN and SINE-VNTR-Alu (SVA) are 3 'non-inverting domains. FCMDs are not compatible with other diseases. The treatment of this disease is in the process of development and preparation in the country. The importance of early diagnosis and early treatment in treatment development is high, and SVA insertion and sequencing are easy, and 15% of patients have multiple mutations. This study aims to establish a rapid, accurate, and accurate genetic screening method for FCMD patients, and to provide guidance for early diagnosis and treatment. This year, 45 patients with SVA were assigned to receive treatment, and Miseq was assigned to receive treatment. Polymorphic diagnosis, confirmation, clinical findings and comparison The patient's urine is used to establish the tendon and urine derived stem cells From now on, the differentiation of tendons and tendons will be determined. Urogenated stem cells are safe and easy to invade, and the possibility of treatment effectiveness determination in this country is discussed.

项目成果

Comprehensive Glycoscience (Second Edition)

综合糖科学（第二版）

• 发表时间: 2021
• 作者: Miwako Nagasaka;Mariko Ikeda-Taniguchi
• 通讯作者: Mariko Ikeda-Taniguchi

Assessment of the upper limb muscles in patients with Fukuyama muscular dystrophy: Noninvasive assessment using visual ultrasound muscle analysis and shear wave elastography.

福山肌营养不良症患者上肢肌肉的评估：使用可视超声肌肉分析和剪切波弹性成像的无创评估。

• DOI: 10.1016/j.nmd.2022.05.004
• 发表时间: 2022
• 期刊: Neuromuscular Disorders
• 影响因子: 2.8
• 作者: Risa Harada;Mariko Taniguchi-Ikeda;Miwako Nagasaka;Tatsiuya Nishii;Atsuyuki Inui;Tetsushi Yamamoto;Ichiro Morioka;Ryosuke Kuroda;Kazumoto Iijima;Kandai Nozu;Yoshitada Sakai;Tatsushi Toda,
• 通讯作者: Tatsushi Toda,