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Study of molecular mechanisms of retinal development by single cell RNA-seq analysis

单细胞RNA-seq分析研究视网膜发育的分子机制

基本信息

批准号：
21H02657
负责人：
古川貴久
金额：
$ 11.15万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

申請者は、本研究において、網膜の細胞運命決定と成熟ならびに選択的シナプス形成に関わる因子を、発生期マウス網膜を用いたシングルセルRNA-seq解析によって、発生過程の遺伝子発現プロファイルを一細胞レベルの解像度で可視化することによって同定し、それらの機能とその作用メカニズムを生体レベルで明らかにし、中枢神経系の発生の分子メカニズムや網膜視覚回路の機能発現の理解に貢献することを目指している。申請者は、初年度にシングルセルRNA-seq解析によって同定した複数の候補遺伝子の中から、昨年度に、網膜未分化前駆細胞から視細胞前駆細胞へと分化するに従って特異的に発現が増加する機能未知な蛋白質をコードする遺伝子を新たに同定した。網膜のシングルセルRNA-seq解析から、アマクリン細胞に分化する過程に特異的に発現する遺伝子として別の機能未知の転写因子も同定した。ウイルスベクターを用いた当該蛋白質および転写因子の遺伝子発現による細胞系譜解析を行い、網膜未分化前駆細胞におけるこれら分子の発現により、それぞれ視細胞あるいはアマクリン細胞の分化が促進されることを見出した。さらに、これらの遺伝子のウイルスベクターを用いたノックダウン実験により、視細胞あるいはアマクリン細胞の分化が阻害されることも見出した。これら当該遺伝子のKOマウスを作製し、組織学的解析や網膜電図解析などを行うとともに、アマクリン分化転写因子のKOマウスの発生期の網膜を用いたシングルセルRNA-seq解析を行い、細胞運命に関わると考えられる遺伝子プロファイルのデータを得た。

Applicant, the purpose of this study, omentum cell fate determination, maturation and selection of mature factors, growth stage The retina of the omentum was analyzed using RNA-seq analysis of the omentum, and the process of development was revealed in one cell.レベルのVisualization of resolution and visual effects He contributes to the understanding of the function of the retinal optic circuit and the molecular structure of the central nervous system. Applicant は, first year's にシングルセルRNA-seq analysis によって同定したplural candidate addendum 伝子の中から, last year's に, omental undifferentiated anterior 槆The cells are differentiated before the optic cells are differentiated, and the specific functions are unknown and the functions are unknown. RNA-seq analysis of retinal omentum and differentiation of Amarillo cells The process is unique, the function is unknown, the function is unknown, and the factor is determined. The genealogy of the protein および転written by the ウイルスベクターを is used to analyze the lineage of the cell lineage and omental undifferentiated pre-cell cells. Cellular cells, molecular cells, cells, cells The differentiation of いはアマクリン cells is promoted by されることを见出した.さらに、これらの伝子のウイルスベクターを用いたノックダウン実験により, the visual cells are blocked and the differentiation of visual cells is blocked.これら是什么意思のKOマウスをmakerし、histological analysisやretina electrolysis analysisなどを行うとともに、アマクリンdifferentiation factorのKOマウスのAnalysis of omentum during the period of puberty using RNA-seq RNA-seq analysis, details The fate of the family is determined by the test of the fate of the family.

项目成果

期刊论文数量（22）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Effect of Green Tea and Tea Catechin on the Visual Motion Processing for Optokinetic Responses in Mice

绿茶和茶儿茶素对小鼠视动反应视觉运动处理的影响

DOI：
10.1016/j.neuroscience.2022.08.013
发表时间：
2022
期刊：
Neuroscience
影响因子：
3.3
作者：
Sugita Yuko;Furukawa Takahisa
通讯作者：
Furukawa Takahisa

The effect of green tea and tea catechin on the optokinetic responses in

绿茶和茶儿茶素对视动反应的影响

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
杉田祐子;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

シングルセルRNA-seq法によるマウス網膜細胞運命決定機構の解析

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DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
宮之原由己;Hung-Ya Tu;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

タンパク質輸送から見た繊毛病のメカニズムの解析

从蛋白质转运角度分析纤毛病机制

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Bando Y;Ishibashi M;Yamagishi S;Fukuda A;Sato K.;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

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视网膜转导蛋白结合蛋白UNC119的功能分析

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林康暉;茶屋太郎;前田和;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

DOI：
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