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Study of molecular mechanisms of retinal development by single cell RNA-seq analysis

单细胞RNA-seq分析研究视网膜发育的分子机制

基本信息

批准号：
21H02657
负责人：
古川貴久
金额：
$ 11.15万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

申請者は、本研究において、網膜の細胞運命決定と成熟ならびに選択的シナプス形成に関わる因子を、発生期マウス網膜を用いたシングルセルRNA-seq解析によって、発生過程の遺伝子発現プロファイルを一細胞レベルの解像度で可視化することによって同定し、それらの機能とその作用メカニズムを生体レベルで明らかにし、中枢神経系の発生の分子メカニズムや網膜視覚回路の機能発現の理解に貢献することを目指している。申請者は、初年度にシングルセルRNA-seq解析によって同定した複数の候補遺伝子の中から、昨年度に、網膜未分化前駆細胞から視細胞前駆細胞へと分化するに従って特異的に発現が増加する機能未知な蛋白質をコードする遺伝子を新たに同定した。網膜のシングルセルRNA-seq解析から、アマクリン細胞に分化する過程に特異的に発現する遺伝子として別の機能未知の転写因子も同定した。ウイルスベクターを用いた当該蛋白質および転写因子の遺伝子発現による細胞系譜解析を行い、網膜未分化前駆細胞におけるこれら分子の発現により、それぞれ視細胞あるいはアマクリン細胞の分化が促進されることを見出した。さらに、これらの遺伝子のウイルスベクターを用いたノックダウン実験により、視細胞あるいはアマクリン細胞の分化が阻害されることも見出した。これら当該遺伝子のKOマウスを作製し、組織学的解析や網膜電図解析などを行うとともに、アマクリン分化転写因子のKOマウスの発生期の網膜を用いたシングルセルRNA-seq解析を行い、細胞運命に関わると考えられる遺伝子プロファイルのデータを得た。

The applicant responded to this study by identifying factors related to the development of omental cell fate, maturation, and selection, and by analyzing RNA-seq in omental cells during development, and by visualizing the resolution of omental cell fate during development. Molecular mechanisms for the development of the central nervous system contribute to understanding the functional development of retinal visual circuits. The applicant has identified multiple candidate genes in the initial and final years of RNA-seq analysis, and identified new genes in the initial and final years of retinal undifferentiated cells, optic cells, and differentiation. The RNA sequence of the retina is analyzed and identified in the process of cell differentiation, and the function of the gene is unknown When the protein is used, the expression of the gene is analyzed by cell line spectrum, and the expression of the gene is promoted by retinal undifferentiated cells. In addition, it is necessary to prevent the differentiation of the cells. When the gene is detected, histological analysis, retinal electroanalysis, differentiation factor analysis, and development stage, retinal electroanalysis, and cell fate analysis are performed.

项目成果

期刊论文数量（22）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Effect of Green Tea and Tea Catechin on the Visual Motion Processing for Optokinetic Responses in Mice

绿茶和茶儿茶素对小鼠视动反应视觉运动处理的影响

DOI：
10.1016/j.neuroscience.2022.08.013
发表时间：
2022
期刊：
Neuroscience
影响因子：
3.3
作者：
Sugita Yuko;Furukawa Takahisa
通讯作者：
Furukawa Takahisa

The effect of green tea and tea catechin on the optokinetic responses in

绿茶和茶儿茶素对视动反应的影响

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
杉田祐子;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

シングルセルRNA-seq法によるマウス網膜細胞運命決定機構の解析

利用单细胞RNA-seq方法分析小鼠视网膜细胞命运决定机制

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
宮之原由己;Hung-Ya Tu;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

タンパク質輸送から見た繊毛病のメカニズムの解析

从蛋白质转运角度分析纤毛病机制

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Bando Y;Ishibashi M;Yamagishi S;Fukuda A;Sato K.;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

網膜におけるトランスデューシン結合タンパク質UNC119の機能解析

视网膜转导蛋白结合蛋白UNC119的功能分析

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林康暉;茶屋太郎;前田和;古川貴久
通讯作者：
古川貴久

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古川貴久其他文献

視運動性応答の時空間周波数特性への網膜視細胞リボンシナプスの寄与

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DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
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通讯作者：
三浦健一郎

網膜ON型双極細胞視覚伝達チャネルの転写制御解析

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DOI：
发表时间：
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期刊：
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0
作者：
大下陽介;瀧澤伸剛;古藤諒　川島桐吾;谷田裕樹;多賀駿;吉田圭祐;石金浩史;古川貴久;天野晃;下ノ村和弘;北野勝則;坪泰宏;小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・川島桐吾・大下陽介・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪泰宏・小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・谷田祐樹・川島桐吾・大下陽介・谷原明子・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪泰宏・小池千恵子;稲葉るり　安田優耶　小原文太　阪岡倫行　小池千恵子
通讯作者：
稲葉るり　安田優耶　小原文太　阪岡倫行　小池千恵子

The Drosophila RBP-J[k] gene encodes the binding protein for the immunoglobulin J[k] recombination signal sequence

果蝇 RBP-J[k] 基因编码免疫球蛋白 J[k] 重组信号序列的结合蛋白

DOI：
发表时间：
1992
期刊：
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0
作者：
古川貴久
通讯作者：
古川貴久

網膜ON型双極細胞視覚伝達チャネルノックアウトマウス網膜の電気生理学的解析

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DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
大下陽介;瀧澤伸剛;古藤諒　川島桐吾;谷田裕樹;多賀駿;吉田圭祐;石金浩史;古川貴久;天野晃;下ノ村和弘;北野勝則;坪泰宏;小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・川島桐吾・大下陽介・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪泰宏・小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・谷田祐樹・川島桐吾・大下陽介・谷原明子・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪泰宏・小池千恵子;稲葉るり　安田優耶　小原文太　阪岡倫行　小池千恵子;Satoshi Yokota Chieko Koike Ken Takeda;古藤諒　吉田圭祐　多賀駿　石金浩史　下ノ村和弘　小池千恵子
通讯作者：
古藤諒　吉田圭祐　多賀駿　石金浩史　下ノ村和弘　小池千恵子

マウス視覚伝達チャネルTRPM1の発現制御解析

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DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
大下陽介;瀧澤伸剛;古藤諒　川島桐吾;谷田裕樹;多賀駿;吉田圭祐;石金浩史;古川貴久;天野晃;下ノ村和弘;北野勝則;坪泰宏;小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・川島桐吾・大下陽介・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪泰宏・小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・谷田祐樹・川島桐吾・大下陽介・谷原明子・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪泰宏・小池千恵子;稲葉るり　安田優耶　小原文太　阪岡倫行　小池千恵子;Satoshi Yokota Chieko Koike Ken Takeda;古藤諒　吉田圭祐　多賀駿　石金浩史　下ノ村和弘　小池千恵子;谷原明子　秋葉唯　横田理　古藤諒　多賀駿　小池千恵子;安田優耶　稲葉るり　小原文太　阪岡倫行　小池千恵子
通讯作者：
安田優耶　稲葉るり　小原文太　阪岡倫行　小池千恵子