Study of molecular mechanisms of retinal development by single cell RNA-seq analysis
单细胞RNA-seq分析研究视网膜发育的分子机制
基本信息
- 批准号:21H02657
- 负责人:
- 金额:$ 11.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
申請者は、本研究において、網膜の細胞運命決定と成熟ならびに選択的シナプス形成に関わる因子を、発生期マウス網膜を用いたシングルセルRNA-seq解析によって、発生過程の遺伝子発現プロファイルを一細胞レベルの解像度で可視化することによって同定し、それらの機能とその作用メカニズムを生体レベルで明らかにし、中枢神経系の発生の分子メカニズムや網膜視覚回路の機能発現の理解に貢献することを目指している。申請者は、初年度にシングルセルRNA-seq解析によって同定した複数の候補遺伝子の中から、昨年度に、網膜未分化前駆細胞から視細胞前駆細胞へと分化するに従って特異的に発現が増加する機能未知な蛋白質をコードする遺伝子を新たに同定した。網膜のシングルセルRNA-seq解析から、アマクリン細胞に分化する過程に特異的に発現する遺伝子として別の機能未知の転写因子も同定した。ウイルスベクターを用いた当該蛋白質および転写因子の遺伝子発現による細胞系譜解析を行い、網膜未分化前駆細胞におけるこれら分子の発現により、それぞれ視細胞あるいはアマクリン細胞の分化が促進されることを見出した。さらに、これらの遺伝子のウイルスベクターを用いたノックダウン実験により、視細胞あるいはアマクリン細胞の分化が阻害されることも見出した。これら当該遺伝子のKOマウスを作製し、組織学的解析や網膜電図解析などを行うとともに、アマクリン分化転写因子のKOマウスの発生期の網膜を用いたシングルセルRNA-seq解析を行い、細胞運命に関わると考えられる遺伝子プロファイルのデータを得た。
The applicant responded to this study by identifying factors related to the development of omental cell fate, maturation, and selection, and by analyzing RNA-seq in omental cells during development, and by visualizing the resolution of omental cell fate during development. Molecular mechanisms for the development of the central nervous system contribute to understanding the functional development of retinal visual circuits. The applicant has identified multiple candidate genes in the initial and final years of RNA-seq analysis, and identified new genes in the initial and final years of retinal undifferentiated cells, optic cells, and differentiation. The RNA sequence of the retina is analyzed and identified in the process of cell differentiation, and the function of the gene is unknown When the protein is used, the expression of the gene is analyzed by cell line spectrum, and the expression of the gene is promoted by retinal undifferentiated cells. In addition, it is necessary to prevent the differentiation of the cells. When the gene is detected, histological analysis, retinal electroanalysis, differentiation factor analysis, and development stage, retinal electroanalysis, and cell fate analysis are performed.
项目成果
期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Effect of Green Tea and Tea Catechin on the Visual Motion Processing for Optokinetic Responses in Mice
绿茶和茶儿茶素对小鼠视动反应视觉运动处理的影响
- DOI:10.1016/j.neuroscience.2022.08.013
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:3.3
- 作者:Sugita Yuko;Furukawa Takahisa
- 通讯作者:Furukawa Takahisa
The effect of green tea and tea catechin on the optokinetic responses in
绿茶和茶儿茶素对视动反应的影响
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:杉田祐子;古川貴久
- 通讯作者:古川貴久
シングルセルRNA-seq法によるマウス網膜細胞運命決定機構の解析
利用单细胞RNA-seq方法分析小鼠视网膜细胞命运决定机制
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:宮之原由己;Hung-Ya Tu;古川貴久
- 通讯作者:古川貴久
タンパク質輸送から見た繊毛病のメカニズムの解析
从蛋白质转运角度分析纤毛病机制
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Bando Y;Ishibashi M;Yamagishi S;Fukuda A;Sato K.;古川貴久
- 通讯作者:古川貴久
網膜におけるトランスデューシン結合タンパク質UNC119の機能解析
视网膜转导蛋白结合蛋白UNC119的功能分析
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:小林康暉;茶屋太郎;前田和;古川貴久
- 通讯作者:古川貴久
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
古川 貴久其他文献
視運動性応答の時空間周波数特性への網膜視細胞リボンシナプスの寄与
视网膜感光带突触对视运动反应时空频率特征的贡献
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
杉田 祐子;荒木 章之;茶屋 太郎;河野 憲二;古川 貴久;三浦 健一郎 - 通讯作者:
三浦 健一郎
網膜ON型双極細胞視覚伝達チャネルの転写制御解析
视网膜ON型双极细胞视觉传输通道的转录调控分析
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
大下 陽介;瀧澤 伸剛;古藤 諒 川島 桐吾;谷田裕樹;多賀 駿;吉田 圭祐;石金 浩史;古川 貴久;天野 晃;下ノ村 和弘;北野 勝則;坪 泰宏;小池 千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・川島桐吾・大下陽介・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪 泰宏・小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・谷田祐樹・川島桐吾・大下陽介・谷原明子・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・ 天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪 泰宏・小池千恵子;稲葉るり 安田優耶 小原文太 阪岡倫行 小池千恵子 - 通讯作者:
稲葉るり 安田優耶 小原文太 阪岡倫行 小池千恵子
The Drosophila RBP-J[k] gene encodes the binding protein for the immunoglobulin J[k] recombination signal sequence
果蝇 RBP-J[k] 基因编码免疫球蛋白 J[k] 重组信号序列的结合蛋白
- DOI:
- 发表时间:
1992 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
古川 貴久 - 通讯作者:
古川 貴久
網膜ON型双極細胞視覚伝達チャネルノックアウトマウス網膜の電気生理学的解析
视网膜ON型双极细胞视觉传输通道敲除小鼠视网膜电生理分析
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
大下 陽介;瀧澤 伸剛;古藤 諒 川島 桐吾;谷田裕樹;多賀 駿;吉田 圭祐;石金 浩史;古川 貴久;天野 晃;下ノ村 和弘;北野 勝則;坪 泰宏;小池 千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・川島桐吾・大下陽介・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪 泰宏・小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・谷田祐樹・川島桐吾・大下陽介・谷原明子・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・ 天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪 泰宏・小池千恵子;稲葉るり 安田優耶 小原文太 阪岡倫行 小池千恵子;Satoshi Yokota Chieko Koike Ken Takeda;古藤諒 吉田圭祐 多賀駿 石金浩史 下ノ村和弘 小池千恵子 - 通讯作者:
古藤諒 吉田圭祐 多賀駿 石金浩史 下ノ村和弘 小池千恵子
マウス視覚伝達チャネルTRPM1の発現制御解析
小鼠视觉传输通道TRPM1的表达调控分析
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
大下 陽介;瀧澤 伸剛;古藤 諒 川島 桐吾;谷田裕樹;多賀 駿;吉田 圭祐;石金 浩史;古川 貴久;天野 晃;下ノ村 和弘;北野 勝則;坪 泰宏;小池 千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・川島桐吾・大下陽介・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪 泰宏・小池千恵子;瀧澤伸剛・古藤諒・谷田祐樹・川島桐吾・大下陽介・谷原明子・多賀駿・吉田圭佑・石金浩史・古川貴久・ 天野晃・下ノ村和弘・北野勝則・坪 泰宏・小池千恵子;稲葉るり 安田優耶 小原文太 阪岡倫行 小池千恵子;Satoshi Yokota Chieko Koike Ken Takeda;古藤諒 吉田圭祐 多賀駿 石金浩史 下ノ村和弘 小池千恵子;谷原明子 秋葉唯 横田理 古藤諒 多賀駿 小池千恵子;安田優耶 稲葉るり 小原文太 阪岡倫行 小池千恵子 - 通讯作者:
安田優耶 稲葉るり 小原文太 阪岡倫行 小池千恵子
古川 貴久的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('古川 貴久', 18)}}的其他基金
Analysis of molecular mechanism of male parenting behavior
男性养育行为的分子机制分析
- 批准号:
23K18199 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
網羅的遺伝子解析によって同定した網膜視細胞形成に関わる遺伝子群の解析
通过综合遗传分析鉴定出参与视网膜感光细胞形成的基因分析
- 批准号:
20022045 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
網膜視細胞発生に関わる分子の網羅的解析
视网膜感光细胞发育相关分子的综合分析
- 批准号:
18022044 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
脊椎動物の四肢形成におけるマイクロRNAの機能の解析
microRNA在脊椎动物肢体形成中的功能分析
- 批准号:
18659081 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
網膜視細胞発生に関わる分子の網羅的解析
视网膜感光细胞发育相关分子的综合分析
- 批准号:
17024061 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
脊椎動物の眼の初期発生機構の解析
脊椎动物眼睛的早期发育机制分析
- 批准号:
16027257 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
脊椎動物の中枢神経系の細胞運命決定機構の解析
脊椎动物中枢神经系统细胞命运决定机制分析
- 批准号:
15016115 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
脊椎動物の眼の初期発生機構の解析
脊椎动物眼睛的早期发育机制分析
- 批准号:
14034265 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
脊椎動物の中枢神経系の細胞運命決定機構の解析
脊椎动物中枢神经系统细胞命运决定机制分析
- 批准号:
14017101 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
新しいタイプのDNA結合蛋白質JκRBPの機能の解析
新型DNA结合蛋白JκRBP的功能分析
- 批准号:
06770082 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
糖尿病網膜症の視細胞死における炎症性単球の役割
炎症单核细胞在糖尿病视网膜病变感光细胞死亡中的作用
- 批准号:
23K19674 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
網膜色素変性動物モデルでの視細胞保護治療の実験的効果解析
视网膜色素变性动物模型光感受器保护治疗的实验效果分析
- 批准号:
21K16864 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
網膜視細胞におけるトポイソメラーゼIIβの生理、病理学的役割の検証
拓扑异构酶IIβ在视网膜感光细胞中生理和病理作用的验证
- 批准号:
21K09721 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
視細胞変性のオンセットと進展制御に関わる網膜内炎症環境の時空的な解析
与感光细胞变性的发生和进展控制相关的视网膜内炎症环境的时空分析
- 批准号:
21K09693 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Progranulinの網膜視細胞分化に関する研究
颗粒体蛋白前体对视网膜感光细胞分化的研究
- 批准号:
15J07651 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
網膜視細胞における転写因子Otx2とCrxの機能解析
视网膜感光细胞转录因子Otx2和Crx的功能分析
- 批准号:
08J02055 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
網羅的遺伝子解析によって同定した網膜視細胞形成に関わる遺伝子群の解析
通过综合遗传分析鉴定出参与视网膜感光细胞形成的基因分析
- 批准号:
20022045 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
網膜視細胞発生に関わる分子の網羅的解析
视网膜感光细胞发育相关分子的综合分析
- 批准号:
18022044 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
常染色体優性網膜色素変性原因遺伝子の発現調節を用いた視細胞変性機序の解析
利用常染色体显性遗传色素性视网膜炎致病基因的表达调控分析感光细胞变性的机制
- 批准号:
18659507 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
網膜視細胞発生に関わる分子の網羅的解析
视网膜感光细胞发育相关分子的综合分析
- 批准号:
17024061 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas